RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405755.6

PDE4D-207, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-207ENST00000405755 NISCHQ9Y2I1 1504 aa20.99■□□□□ 0.95
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PDE4D-207ENST00000405755 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa17.38■□□□□ 0.37
PDE4D-207ENST00000405755 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa17.29■□□□□ 0.36
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PDE4D-207ENST00000405755 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.78■□□□□ 0.28
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PDE4D-207ENST00000405755 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.33■□□□□ 0.2
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PDE4D-207ENST00000405755 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PDE4D-207ENST00000405755 PEG3Q9GZU2 1588 aa15.86■□□□□ 0.13
PDE4D-207ENST00000405755 SMARCA2P51531 1590 aa15.81■□□□□ 0.12
PDE4D-207ENST00000405755 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa15.8■□□□□ 0.12
PDE4D-207ENST00000405755 CCDC88BA6NC98 1476 aa15.8■□□□□ 0.12
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PDE4D-207ENST00000405755 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
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PDE4D-207ENST00000405755 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa15.51■□□□□ 0.07
PDE4D-207ENST00000405755 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
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PDE4D-207ENST00000405755 SOGA1O94964 1423 aa15.29■□□□□ 0.04
PDE4D-207ENST00000405755 PRDM2Q13029 1718 aa15.27■□□□□ 0.03
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PDE4D-207ENST00000405755 TOP2BQ02880 1626 aa15.25■□□□□ 0.03
PDE4D-207ENST00000405755 EEA1Q15075 1411 aa15.24■□□□□ 0.03
PDE4D-207ENST00000405755 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.22■□□□□ 0.03
PDE4D-207ENST00000405755 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.21■□□□□ 0.03
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PDE4D-207ENST00000405755 CEP162Q5TB80 1403 aa15□□□□□ -0.01
PDE4D-207ENST00000405755 PCGF6Q9BYE7 350 aa15□□□□□ -0.01
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PDE4D-207ENST00000405755 PDS5BQ9NTI5 1447 aa14.98□□□□□ -0.01
PDE4D-207ENST00000405755 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa14.97□□□□□ -0.01
PDE4D-207ENST00000405755 CUX2O14529 1486 aa14.96□□□□□ -0.01
PDE4D-207ENST00000405755 ERCC6Q03468 1493 aa14.96□□□□□ -0.01
PDE4D-207ENST00000405755 TOPBP1Q92547 1522 aa14.96□□□□□ -0.02
PDE4D-207ENST00000405755 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.94□□□□□ -0.02
PDE4D-207ENST00000405755 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.91□□□□□ -0.02
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PDE4D-207ENST00000405755 PRXQ9BXM0 1461 aa14.91□□□□□ -0.02
PDE4D-207ENST00000405755 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PDE4D-207ENST00000405755 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PDE4D-207ENST00000405755 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.88□□□□□ -0.03
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PDE4D-207ENST00000405755 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.84□□□□□ -0.03
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PDE4D-207ENST00000405755 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.79□□□□□ -0.04
PDE4D-207ENST00000405755 WDR97A6NE52 1622 aa14.78□□□□□ -0.04
PDE4D-207ENST00000405755 MRC2Q9UBG0 1479 aa14.78□□□□□ -0.04
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PDE4D-207ENST00000405755 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.72□□□□□ -0.05
PDE4D-207ENST00000405755 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.7□□□□□ -0.06
PDE4D-207ENST00000405755 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PDE4D-207ENST00000405755 WDR62O43379 1518 aa14.68□□□□□ -0.06
PDE4D-207ENST00000405755 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PDE4D-207ENST00000405755 APLP2Q06481 763 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4D-207ENST00000405755 ARAP1Q96P48 1450 aa14.66□□□□□ -0.06
PDE4D-207ENST00000405755 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.64□□□□□ -0.07
PDE4D-207ENST00000405755 HRCP23327 699 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4D-207ENST00000405755 PBRM1Q86U86 1689 aa14.62□□□□□ -0.07
PDE4D-207ENST00000405755 IFT140Q96RY7 1462 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4D-207ENST00000405755 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
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