Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ22

RAB12, Ras-related protein Rab-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB12Q6IQ22 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB12Q6IQ22 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB12Q6IQ22 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms