RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265028.7

DNAJB11-201, Transcript of DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DNAJB11, Length 1,688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB11-201ENST00000265028 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.93■■■■■ 6.06
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DNAJB11-201ENST00000265028 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.69■■■■■ 4.58
DNAJB11-201ENST00000265028 ABCC9O60706 1549 aa43.65■■■■■ 4.58
DNAJB11-201ENST00000265028 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.24■■■■■ 4.51
DNAJB11-201ENST00000265028 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.19■■■■■ 4.5
DNAJB11-201ENST00000265028 NACADO15069 1562 aa43.02■■■■■ 4.48
DNAJB11-201ENST00000265028 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.69■■■■■ 4.42
DNAJB11-201ENST00000265028 SCRIBQ14160 1630 aa42.53■■■■■ 4.4
DNAJB11-201ENST00000265028 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.86■■■■■ 4.29
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DNAJB11-201ENST00000265028 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.08■■■■■ 4.17
DNAJB11-201ENST00000265028 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
DNAJB11-201ENST00000265028 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
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DNAJB11-201ENST00000265028 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.21■■■■■ 4.03
DNAJB11-201ENST00000265028 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
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DNAJB11-201ENST00000265028 CFTRP13569 1480 aa38.77■■■■□ 3.8
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DNAJB11-201ENST00000265028 TOP2BQ02880 1626 aa38.39■■■■□ 3.74
DNAJB11-201ENST00000265028 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.38■■■■□ 3.74
DNAJB11-201ENST00000265028 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.38■■■■□ 3.73
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DNAJB11-201ENST00000265028 NESP48681 1621 aa38.3■■■■□ 3.72
DNAJB11-201ENST00000265028 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.25■■■■□ 3.71
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DNAJB11-201ENST00000265028 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.17■■■■□ 3.7
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DNAJB11-201ENST00000265028 SOGA1O94964 1423 aa38.14■■■■□ 3.7
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DNAJB11-201ENST00000265028 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.04■■■■□ 3.68
DNAJB11-201ENST00000265028 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.99■■■■□ 3.67
DNAJB11-201ENST00000265028 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.96■■■■□ 3.67
DNAJB11-201ENST00000265028 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.95■■■■□ 3.67
DNAJB11-201ENST00000265028 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.85■■■■□ 3.65
DNAJB11-201ENST00000265028 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.85■■■■□ 3.65
DNAJB11-201ENST00000265028 TOPBP1Q92547 1522 aa37.83■■■■□ 3.65
DNAJB11-201ENST00000265028 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.82■■■■□ 3.65
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DNAJB11-201ENST00000265028 KIF21BO75037 1637 aa37.69■■■■□ 3.62
DNAJB11-201ENST00000265028 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.65■■■■□ 3.62
DNAJB11-201ENST00000265028 GOLGA3Q08378 1498 aa37.64■■■■□ 3.62
DNAJB11-201ENST00000265028 CUX2O14529 1486 aa37.6■■■■□ 3.61
DNAJB11-201ENST00000265028 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.58■■■■□ 3.61
DNAJB11-201ENST00000265028 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.5■■■■□ 3.59
DNAJB11-201ENST00000265028 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.5■■■■□ 3.59
DNAJB11-201ENST00000265028 ERCC6Q03468 1493 aa37.49■■■■□ 3.59
DNAJB11-201ENST00000265028 WDR97A6NE52 1622 aa37.46■■■■□ 3.59
DNAJB11-201ENST00000265028 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.45■■■■□ 3.59
DNAJB11-201ENST00000265028 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.43■■■■□ 3.58
DNAJB11-201ENST00000265028 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.42■■■■□ 3.58
DNAJB11-201ENST00000265028 PRXQ9BXM0 1461 aa37.4■■■■□ 3.58
DNAJB11-201ENST00000265028 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.4■■■■□ 3.58
DNAJB11-201ENST00000265028 WDR62O43379 1518 aa37.38■■■■□ 3.57
DNAJB11-201ENST00000265028 CEP162Q5TB80 1403 aa37.3■■■■□ 3.56
DNAJB11-201ENST00000265028 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.29■■■■□ 3.56
DNAJB11-201ENST00000265028 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.28■■■■□ 3.56
DNAJB11-201ENST00000265028 IGF1RP08069 1367 aa37.27■■■■□ 3.56
DNAJB11-201ENST00000265028 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.24■■■■□ 3.55
DNAJB11-201ENST00000265028 CUL7Q14999 1698 aa37.17■■■■□ 3.54
DNAJB11-201ENST00000265028 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.13■■■■□ 3.54
DNAJB11-201ENST00000265028 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.12■■■■□ 3.53
DNAJB11-201ENST00000265028 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.11■■■■□ 3.53
DNAJB11-201ENST00000265028 IFT140Q96RY7 1462 aa37.11■■■■□ 3.53
DNAJB11-201ENST00000265028 PBRM1Q86U86 1689 aa37.03■■■■□ 3.52
DNAJB11-201ENST00000265028 CLIP1P30622 1438 aa37.02■■■■□ 3.52
DNAJB11-201ENST00000265028 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.89■■■■□ 3.57e-8■■■□□ 17.9
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DNAJB11-201ENST00000265028 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.84■■■■□ 3.49
DNAJB11-201ENST00000265028 GRIN2BQ13224 1484 aa36.84■■■■□ 3.49
DNAJB11-201ENST00000265028 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.48
DNAJB11-201ENST00000265028 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.8■■■■□ 3.48
DNAJB11-201ENST00000265028 ADAMTS12P58397 1594 aa36.78■■■■□ 3.48
DNAJB11-201ENST00000265028 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.72■■■■□ 3.47
DNAJB11-201ENST00000265028 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.69■■■■□ 3.46
DNAJB11-201ENST00000265028 ARAP1Q96P48 1450 aa36.63■■■■□ 3.45
DNAJB11-201ENST00000265028 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.6■■■■□ 3.45
DNAJB11-201ENST00000265028 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.6■■■■□ 3.45
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