RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608842.1

DGCR6-208, Transcript of DiGeorge syndrome critical region gene 6, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene DGCR6, Length 1,837 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR6-208ENST00000608842 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.97■■■■■ 6.07
DGCR6-208ENST00000608842 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.18■■■■■ 4.98
DGCR6-208ENST00000608842 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.54■■■■■ 4.72
DGCR6-208ENST00000608842 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.81■■■■■ 4.6
DGCR6-208ENST00000608842 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.52■■■■■ 4.56
DGCR6-208ENST00000608842 ABCC9O60706 1549 aa43.46■■■■■ 4.55
DGCR6-208ENST00000608842 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.23■■■■■ 4.51
DGCR6-208ENST00000608842 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.22■■■■■ 4.51
DGCR6-208ENST00000608842 NACADO15069 1562 aa42.91■■■■■ 4.46
DGCR6-208ENST00000608842 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.5■■■■■ 4.39
DGCR6-208ENST00000608842 SCRIBQ14160 1630 aa42.45■■■■■ 4.39
DGCR6-208ENST00000608842 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.88■■■■■ 4.3
DGCR6-208ENST00000608842 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.6■■■■■ 4.25
DGCR6-208ENST00000608842 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.34■■■■■ 4.21
DGCR6-208ENST00000608842 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.18■■■■■ 4.18
DGCR6-208ENST00000608842 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
DGCR6-208ENST00000608842 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.97■■■■■ 4.15
DGCR6-208ENST00000608842 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.96■■■■■ 4.15
DGCR6-208ENST00000608842 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
DGCR6-208ENST00000608842 SMARCA4P51532 1647 aa40.73■■■■■ 4.11
DGCR6-208ENST00000608842 WIZO95785 1651 aa40.68■■■■■ 4.1
DGCR6-208ENST00000608842 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.24■■■■■ 4.03
DGCR6-208ENST00000608842 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.02
DGCR6-208ENST00000608842 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.01■■■■■ 4
DGCR6-208ENST00000608842 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.97■■■■□ 3.99
DGCR6-208ENST00000608842 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.97■■■■□ 3.99
DGCR6-208ENST00000608842 SMARCA2P51531 1590 aa39.93■■■■□ 3.98
DGCR6-208ENST00000608842 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.77■■■■□ 3.96
DGCR6-208ENST00000608842 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.71■■■■□ 3.95
DGCR6-208ENST00000608842 NCAPD3P42695 1498 aa39.6■■■■□ 3.93
DGCR6-208ENST00000608842 HMGXB3Q12766 1538 aa39.58■■■■□ 3.93
DGCR6-208ENST00000608842 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.4■■■■□ 3.9
DGCR6-208ENST00000608842 TRIM41Q8WV44 630 aa39.1■■■■□ 3.85
DGCR6-208ENST00000608842 ABCC8Q09428 1581 aa39.02■■■■□ 3.84
DGCR6-208ENST00000608842 CFTRP13569 1480 aa38.76■■■■□ 3.8
DGCR6-208ENST00000608842 PRDM2Q13029 1718 aa38.73■■■■□ 3.79
DGCR6-208ENST00000608842 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.67■■■■□ 3.78
DGCR6-208ENST00000608842 SYNJ1O43426 1573 aa38.61■■■■□ 3.77
DGCR6-208ENST00000608842 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.55■■■■□ 3.76
DGCR6-208ENST00000608842 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.45■■■■□ 3.75
DGCR6-208ENST00000608842 TOP2BQ02880 1626 aa38.42■■■■□ 3.74
DGCR6-208ENST00000608842 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.42■■■■□ 3.74
DGCR6-208ENST00000608842 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.4■■■■□ 3.74
DGCR6-208ENST00000608842 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.38■■■■□ 3.73
DGCR6-208ENST00000608842 CUX1P39880 1505 aa38.29■■■■□ 3.72
DGCR6-208ENST00000608842 SOGA1O94964 1423 aa38.27■■■■□ 3.72
DGCR6-208ENST00000608842 NESP48681 1621 aa38.26■■■■□ 3.71
DGCR6-208ENST00000608842 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.25■■■■□ 3.71
DGCR6-208ENST00000608842 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.18■■■■□ 3.7
DGCR6-208ENST00000608842 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.15■■■■□ 3.7
DGCR6-208ENST00000608842 EEA1Q15075 1411 aa38.14■■■■□ 3.7
DGCR6-208ENST00000608842 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.91■■■■□ 3.66
DGCR6-208ENST00000608842 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.88■■■■□ 3.65
DGCR6-208ENST00000608842 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.88■■■■□ 3.65
DGCR6-208ENST00000608842 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.87■■■■□ 3.65
DGCR6-208ENST00000608842 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.85■■■■□ 3.65
DGCR6-208ENST00000608842 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.84■■■■□ 3.65
DGCR6-208ENST00000608842 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.8■■■■□ 3.64
DGCR6-208ENST00000608842 TOPBP1Q92547 1522 aa37.79■■■■□ 3.64
DGCR6-208ENST00000608842 KIF21BO75037 1637 aa37.76■■■■□ 3.63
DGCR6-208ENST00000608842 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
DGCR6-208ENST00000608842 GOLGA3Q08378 1498 aa37.65■■■■□ 3.62
DGCR6-208ENST00000608842 KIF27Q86VH2 1401 aa37.64■■■■□ 3.62
DGCR6-208ENST00000608842 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.61■■■■□ 3.61
DGCR6-208ENST00000608842 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.56■■■■□ 3.6
DGCR6-208ENST00000608842 CUX2O14529 1486 aa37.54■■■■□ 3.6
DGCR6-208ENST00000608842 PRXQ9BXM0 1461 aa37.5■■■■□ 3.59
DGCR6-208ENST00000608842 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.5■■■■□ 3.59
DGCR6-208ENST00000608842 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.49■■■■□ 3.59
DGCR6-208ENST00000608842 WDR97A6NE52 1622 aa37.48■■■■□ 3.59
DGCR6-208ENST00000608842 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.48■■■■□ 3.59
DGCR6-208ENST00000608842 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.45■■■■□ 3.59
DGCR6-208ENST00000608842 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.41■■■■□ 3.58
DGCR6-208ENST00000608842 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
DGCR6-208ENST00000608842 CEP162Q5TB80 1403 aa37.38■■■■□ 3.57
DGCR6-208ENST00000608842 IGF1RP08069 1367 aa37.35■■■■□ 3.57
DGCR6-208ENST00000608842 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.29■■■■□ 3.56
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DGCR6-208ENST00000608842 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.23■■■■□ 3.55
DGCR6-208ENST00000608842 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
DGCR6-208ENST00000608842 ERCC6Q03468 1493 aa37.16■■■■□ 3.54
DGCR6-208ENST00000608842 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.12■■■■□ 3.53
DGCR6-208ENST00000608842 CUL7Q14999 1698 aa37.09■■■■□ 3.53
DGCR6-208ENST00000608842 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
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DGCR6-208ENST00000608842 PBRM1Q86U86 1689 aa36.96■■■■□ 3.51
DGCR6-208ENST00000608842 IFT140Q96RY7 1462 aa36.96■■■■□ 3.51
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DGCR6-208ENST00000608842 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.49
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DGCR6-208ENST00000608842 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.76■■■■□ 3.48
DGCR6-208ENST00000608842 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.75■■■■□ 3.47
DGCR6-208ENST00000608842 ARAP1Q96P48 1450 aa36.75■■■■□ 3.47
DGCR6-208ENST00000608842 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
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DGCR6-208ENST00000608842 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
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DGCR6-208ENST00000608842 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.71■■■■□ 3.47
DGCR6-208ENST00000608842 ADAMTS12P58397 1594 aa36.7■■■■□ 3.47
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