RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.25■■■■■ 5.63
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HOXD9-201ENST00000249499 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.11■■■■■ 4.17
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HOXD9-201ENST00000249499 SMARCA2P51531 1590 aa37.83■■■■□ 3.65
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HOXD9-201ENST00000249499 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.5■■■■□ 3.43
HOXD9-201ENST00000249499 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.48■■■■□ 3.43
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HOXD9-201ENST00000249499 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.37■■■■□ 3.41
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HOXD9-201ENST00000249499 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.34■■■■□ 3.41
HOXD9-201ENST00000249499 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.33■■■■□ 3.41
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HOXD9-201ENST00000249499 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.91■■■■□ 3.34
HOXD9-201ENST00000249499 ERCC6Q03468 1493 aa35.89■■■■□ 3.34
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HOXD9-201ENST00000249499 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.99■■■■□ 3.19
HOXD9-201ENST00000249499 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
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HOXD9-201ENST00000249499 MAP3K1Q13233 1512 aa34.86■■■■□ 3.17
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