Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ILF3Q12906 FAM120B-203ENST00000537664 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.221e-8■■■■■ 45.2
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ILF3Q12906 FNDC3A-206ENST00000541916 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.992e-13■■■■■ 45.1
ILF3Q12906 FNDC3A-204ENST00000492622 6286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.072e-13■■■■■ 45.1
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ILF3Q12906 NDRG1-223ENST00000522665 411 ntTSL 214.75□□□□□ -0.053e-13■■■■■ 44.7
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ILF3Q12906 NDRG1-201ENST00000323851 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.753e-13■■■■■ 44.7
ILF3Q12906 NDRG1-212ENST00000519278 3983 ntTSL 29.07□□□□□ -0.963e-13■■■■■ 44.7
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ILF3Q12906 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.181e-13■■■■■ 44.2
ILF3Q12906 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.371e-13■■■■■ 44.2
ILF3Q12906 ZNF44-205ENST00000397742 2372 ntTSL 213.66□□□□□ -0.228e-7■■■■■ 44.1
ILF3Q12906 ZNF44-202ENST00000355684 2119 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.428e-7■■■■■ 44.1
ILF3Q12906 ZNF44-201ENST00000354656 517 ntTSL 311.6□□□□□ -0.558e-7■■■■■ 44.1
ILF3Q12906 ZNF44-208ENST00000600003 2051 ntTSL 211.2□□□□□ -0.628e-7■■■■■ 44.1
ILF3Q12906 ZNF44-203ENST00000356109 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.698e-7■■■■■ 44.1
ILF3Q12906 ZNF44-204ENST00000393337 3236 ntTSL 1 (best)8.56□□□□□ -1.048e-7■■■■■ 44.1
ILF3Q12906 JMJD1C-211ENST00000633035 499 ntTSL 316.51■□□□□ 0.234e-8■■■■■ 43.4
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