Protein–RNA interactions for Protein: Q07955

SRSF1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1Q07955 CCDC18-AS1-202ENST00000413606 770 ntTSL 37.27□□□□□ -1.253e-7■■■■■ 37.1
SRSF1Q07955 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.533e-7■■■■■ 37.1
SRSF1Q07955 CCDC18-AS1-211ENST00000438777 752 ntTSL 34.75□□□□□ -1.653e-7■■■■■ 37.1
SRSF1Q07955 FOXRED1-215ENST00000533395 704 ntTSL 517.26■□□□□ 0.355e-10■■■■■ 36.9
SRSF1Q07955 FOXRED1-203ENST00000525083 1228 ntTSL 216.12■□□□□ 0.175e-10■■■■■ 36.9
SRSF1Q07955 FOXRED1-204ENST00000525770 1427 ntTSL 213.95□□□□□ -0.185e-10■■■■■ 36.9
SRSF1Q07955 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.385e-10■■■■■ 36.9
SRSF1Q07955 FOXRED1-207ENST00000527004 1760 ntTSL 512.47□□□□□ -0.415e-10■■■■■ 36.9
SRSF1Q07955 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.445e-10■■■■■ 36.9
SRSF1Q07955 FOXRED1-217ENST00000534011 1955 ntTSL 210.76□□□□□ -0.695e-10■■■■■ 36.9
SRSF1Q07955 FOXRED1-218ENST00000534315 2210 ntTSL 1 (best)10.54□□□□□ -0.725e-10■■■■■ 36.9
SRSF1Q07955 FOXRED1-216ENST00000533839 559 ntTSL 48.98□□□□□ -0.975e-10■■■■■ 36.9
SRSF1Q07955 FOXRED1-210ENST00000530642 3045 ntTSL 26.86□□□□□ -1.315e-10■■■■■ 36.9
SRSF1Q07955 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.041e-13■■■■■ 36.7
SRSF1Q07955 HMGB2-205ENST00000511316 1841 ntTSL 211.2□□□□□ -0.621e-13■■■■■ 36.7
SRSF1Q07955 HMGB2-201ENST00000296503 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.631e-13■■■■■ 36.7
SRSF1Q07955 ASNS-217ENST00000495255 1678 ntTSL 29.16□□□□□ -0.942e-6■■■■■ 36.4
SRSF1Q07955 ASNS-207ENST00000437657 745 ntTSL 57.83□□□□□ -1.162e-6■■■■■ 36.4
SRSF1Q07955 ASNS-212ENST00000453600 573 ntTSL 313.93□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 36.3
SRSF1Q07955 ANP32E-206ENST00000534220 512 ntTSL 56.18□□□□□ -1.429e-10■■■■■ 36.3
SRSF1Q07955 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 36
SRSF1Q07955 STX2-203ENST00000392373 2151 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 36
SRSF1Q07955 STX2-202ENST00000344271 661 ntTSL 34.68□□□□□ -1.662e-6■■■■■ 36
SRSF1Q07955 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.771e-11■■■■■ 36
SRSF1Q07955 CCDC144NL-203ENST00000539484 751 ntTSL 38.88□□□□□ -0.991e-11■■■■■ 36
SRSF1Q07955 DNHD1-203ENST00000472080 2288 ntTSL 27.68□□□□□ -1.182e-11■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GPCPD1-205ENST00000481038 6649 ntTSL 23.9□□□□□ -1.792e-11■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.983e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-212ENST00000439161 568 ntTSL 420.98■□□□□ 0.953e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GADD45B-203ENST00000586759 517 nt20.01■□□□□ 0.793e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GADD45B-207ENST00000593043 373 ntTSL 1 (best)19.38■□□□□ 0.693e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-214ENST00000449944 927 ntTSL 518.68■□□□□ 0.583e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-215ENST00000453208 639 ntTSL 518.55■□□□□ 0.563e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-207ENST00000411501 661 ntTSL 318.33■□□□□ 0.523e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-211ENST00000431745 483 ntTSL 516.04■□□□□ 0.163e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.113e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-213ENST00000447515 577 ntTSL 415.37■□□□□ 0.053e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-202ENST00000326597 946 ntTSL 415.35■□□□□ 0.053e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GADD45B-205ENST00000587887 276 ntTSL 1 (best)15.32■□□□□ 0.043e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-210ENST00000429218 566 ntTSL 515.11■□□□□ 0.013e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.013e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.23e-10■■■■■ 35.7
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SRSF1Q07955 GADD45B-202ENST00000585359 750 ntTSL 313.71□□□□□ -0.213e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.493e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.593e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-222ENST00000489772 1384 ntTSL 210.27□□□□□ -0.763e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.233e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-209ENST00000423024 559 ntTSL 37.22□□□□□ -1.253e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-208ENST00000413251 565 ntTSL 57.22□□□□□ -1.253e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 QTRT1-207ENST00000589488 1571 ntTSL 519.36■□□□□ 0.691e-11■■■■■ 35.5
SRSF1Q07955 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.631e-11■■■■■ 35.5
SRSF1Q07955 QTRT1-202ENST00000421333 1502 ntTSL 216.98■□□□□ 0.311e-11■■■■■ 35.5
SRSF1Q07955 QTRT1-208ENST00000590705 846 ntTSL 316.57■□□□□ 0.241e-11■■■■■ 35.5
SRSF1Q07955 QTRT1-205ENST00000587599 994 ntTSL 316.17■□□□□ 0.181e-11■■■■■ 35.5
SRSF1Q07955 QTRT1-206ENST00000587861 2034 ntTSL 214.31□□□□□ -0.121e-11■■■■■ 35.5
SRSF1Q07955 QTRT1-209ENST00000591643 370 ntTSL 512.53□□□□□ -0.41e-11■■■■■ 35.5
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SRSF1Q07955 RIT1-204ENST00000462687 548 ntTSL 39.85□□□□□ -0.835e-9■■■■■ 34.8
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SRSF1Q07955 RIT1-201ENST00000368322 855 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.015e-9■■■■■ 34.8
SRSF1Q07955 RIT1-202ENST00000368323 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.045e-9■■■■■ 34.8
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SRSF1Q07955 TKFC-219ENST00000534084 964 ntTSL 312.22□□□□□ -0.454e-10■■■■■ 34.6
SRSF1Q07955 TKFC-213ENST00000530329 483 ntTSL 311.92□□□□□ -0.54e-10■■■■■ 34.6
SRSF1Q07955 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.268e-11■■■■■ 34.5
SRSF1Q07955 AKAP9-216ENST00000619023 6006 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.938e-11■■■■■ 34.5
SRSF1Q07955 AKAP9-214ENST00000493453 6020 ntTSL 27.22□□□□□ -1.258e-11■■■■■ 34.5
SRSF1Q07955 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.058e-11■■■■■ 34.5
SRSF1Q07955 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.93□□□□□ -2.18e-9■■■■■ 34.5
SRSF1Q07955 CHTF18-216ENST00000565787 607 ntTSL 522.2■■□□□ 1.145e-8■■■■■ 34.3
SRSF1Q07955 CHTF18-218ENST00000569270 711 ntTSL 518.64■□□□□ 0.573e-8■■■■■ 34.3
SRSF1Q07955 CHAF1A-202ENST00000585371 884 ntTSL 512.36□□□□□ -0.437e-9■■■■■ 34.2
SRSF1Q07955 CHAF1A-206ENST00000587739 875 ntTSL 58.91□□□□□ -0.987e-9■■■■■ 34.2
SRSF1Q07955 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.064e-13■■■■■ 34.2
SRSF1Q07955 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.484e-13■■■■■ 34.2
SRSF1Q07955 AC006001.2-203ENST00000428557 304 ntTSL 311.15□□□□□ -0.624e-13■■■■■ 34.2
SRSF1Q07955 CUL7-202ENST00000478630 749 ntTSL 512.85□□□□□ -0.358e-11■■■■■ 34.1
SRSF1Q07955 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.428e-11■■■■■ 34.1
SRSF1Q07955 CUL7-201ENST00000265348 5254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.888e-11■■■■■ 34.1
SRSF1Q07955 ZNF655-221ENST00000489320 671 ntTSL 215.88■□□□□ 0.131e-11■■■■■ 34
SRSF1Q07955 ARID4B-206ENST00000444620 1660 ntTSL 57.33□□□□□ -1.242e-6■■■■■ 33.9
SRSF1Q07955 SPACA6-205ENST00000572703 964 ntTSL 521.21■□□□□ 0.991e-9■■■■■ 33.8
SRSF1Q07955 SPACA6-203ENST00000572565 1308 ntTSL 218.52■□□□□ 0.561e-9■■■■■ 33.8
SRSF1Q07955 SPACA6-202ENST00000572160 759 ntTSL 518.46■□□□□ 0.551e-9■■■■■ 33.8
SRSF1Q07955 SPACA6-206ENST00000573151 660 ntTSL 217.68■□□□□ 0.421e-9■■■■■ 33.8
SRSF1Q07955 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.41e-9■■■■■ 33.8
SRSF1Q07955 SPACA6-212ENST00000576975 500 ntTSL 217.54■□□□□ 0.41e-9■■■■■ 33.8
SRSF1Q07955 SPACA6-208ENST00000573896 554 ntTSL 417.22■□□□□ 0.351e-9■■■■■ 33.8
SRSF1Q07955 SPACA6-204ENST00000572609 342 ntTSL 315.78■□□□□ 0.121e-9■■■■■ 33.8
SRSF1Q07955 SPACA6-207ENST00000573266 1960 ntTSL 214.88□□□□□ -0.031e-9■■■■■ 33.8
SRSF1Q07955 SPACA6-210ENST00000576093 1894 ntTSL 1 (best)11.75□□□□□ -0.531e-9■■■■■ 33.8
SRSF1Q07955 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.631e-9■■■■■ 33.8
SRSF1Q07955 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.761e-9■■■■■ 33.8
SRSF1Q07955 NAP1L4-209ENST00000492594 570 ntTSL 317.01■□□□□ 0.313e-9■■■■■ 33.4
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