Protein–RNA interactions for Protein: Q07955

SRSF1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1Q07955 CHTF18-203ENST00000426047 790 ntTSL 316.44■□□□□ 0.223e-25■■■■■ 75.1
SRSF1Q07955 CHTF18-211ENST00000491530 819 ntTSL 514.52□□□□□ -0.093e-25■■■■■ 75.1
SRSF1Q07955 CHTF18-217ENST00000567620 701 ntTSL 513.97□□□□□ -0.173e-25■■■■■ 75.1
SRSF1Q07955 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.269e-9■■■■■ 73.5
SRSF1Q07955 PELP1-214ENST00000575329 3280 ntTSL 211.9□□□□□ -0.59e-9■■■■■ 73.5
SRSF1Q07955 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.639e-9■■■■■ 73.5
SRSF1Q07955 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.689e-9■■■■■ 73.5
SRSF1Q07955 PELP1-211ENST00000573523 3878 ntTSL 210.72□□□□□ -0.699e-9■■■■■ 73.5
SRSF1Q07955 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.729e-9■■■■■ 73.5
SRSF1Q07955 TIMM44-205ENST00000597926 819 ntTSL 317.27■□□□□ 0.365e-19■■■■■ 67.9
SRSF1Q07955 TIMM44-204ENST00000595876 1206 ntTSL 1 (best)14.51□□□□□ -0.095e-19■■■■■ 67.9
SRSF1Q07955 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.215e-19■■■■■ 67.9
SRSF1Q07955 TIMM44-207ENST00000598675 744 ntTSL 313.35□□□□□ -0.275e-19■■■■■ 67.9
SRSF1Q07955 TIMM44-202ENST00000595565 868 ntTSL 312.88□□□□□ -0.355e-19■■■■■ 67.9
SRSF1Q07955 TIMM44-203ENST00000595831 1797 ntTSL 512.42□□□□□ -0.425e-19■■■■■ 67.9
SRSF1Q07955 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.551e-16■■■■■ 63.8
SRSF1Q07955 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.511e-54■■■■■ 53.5
SRSF1Q07955 SCART1-203ENST00000475114 946 ntTSL 215.76■□□□□ 0.115e-17■■■■■ 53
SRSF1Q07955 SCART1-201ENST00000462252 3451 ntTSL 212.57□□□□□ -0.45e-17■■■■■ 53
SRSF1Q07955 HERPUD1-207ENST00000563781 774 ntTSL 34.58□□□□□ -1.685e-17■■■■■ 53
SRSF1Q07955 RPS18-236ENST00000490191 996 ntTSL 216.4■□□□□ 0.222e-11■■■■■ 51.6
SRSF1Q07955 RPS18-230ENST00000439602 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.632e-11■■■■■ 51.6
SRSF1Q07955 RPS18-234ENST00000476222 685 ntTSL 1 (best)11.12□□□□□ -0.632e-11■■■■■ 51.6
SRSF1Q07955 RPS18-233ENST00000474973 589 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.632e-11■■■■■ 51.6
SRSF1Q07955 RPS18-232ENST00000474626 639 ntTSL 39.05□□□□□ -0.962e-11■■■■■ 51.6
SRSF1Q07955 RPS18-237ENST00000496813 642 ntTSL 28.67□□□□□ -1.022e-11■■■■■ 51.6
SRSF1Q07955 RAD21-201ENST00000297338 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.22e-11■■■■■ 50.7
SRSF1Q07955 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.712e-11■■■■■ 50.7
SRSF1Q07955 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.872e-11■■■■■ 50.7
SRSF1Q07955 NCL-210ENST00000494618 910 ntTSL 25.89□□□□□ -1.476e-10■■■■■ 47.7
SRSF1Q07955 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.656e-8■■■■■ 46.9
SRSF1Q07955 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.666e-8■■■■■ 46.9
SRSF1Q07955 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.676e-8■■■■■ 46.9
SRSF1Q07955 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.686e-8■■■■■ 46.9
SRSF1Q07955 EHMT2-211ENST00000480912 3940 ntTSL 58.53□□□□□ -1.046e-8■■■■■ 46.9
SRSF1Q07955 FKBP9P1-201ENST00000441699 1491 ntBASIC10.87□□□□□ -0.673e-8■■■■■ 46.7
SRSF1Q07955 ANP32E-207ENST00000534437 616 ntTSL 34.12□□□□□ -1.755e-10■■■■■ 46.4
SRSF1Q07955 ASNS-210ENST00000448127 579 ntTSL 27.18□□□□□ -1.263e-6■■■■■ 45.6
SRSF1Q07955 CCDC18-AS1-218ENST00000450843 600 ntTSL 55.6□□□□□ -1.513e-12■■■■■ 45.5
SRSF1Q07955 TFR2-209ENST00000473963 771 ntTSL 312.64□□□□□ -0.395e-13■■■■■ 45.4
SRSF1Q07955 VWDE-204ENST00000485526 573 ntTSL 22.56□□□□□ -23e-10■■■■■ 44.4
SRSF1Q07955 PUM1-219ENST00000527498 652 ntTSL 33.78□□□□□ -1.82e-12■■■■■ 42.5
SRSF1Q07955 OPLAH-202ENST00000531027 500 ntTSL 213.49□□□□□ -0.257e-12■■■■■ 41.5
SRSF1Q07955 HERPUD1-206ENST00000563343 567 ntTSL 48.31□□□□□ -1.089e-10■■■■■ 41.4
SRSF1Q07955 HERPUD1-217ENST00000569429 562 ntTSL 47.76□□□□□ -1.179e-10■■■■■ 41.4
SRSF1Q07955 HERPUD1-208ENST00000563911 844 ntTSL 35.93□□□□□ -1.469e-10■■■■■ 41.4
SRSF1Q07955 HERPUD1-209ENST00000564678 2199 ntTSL 1 (best)5.52□□□□□ -1.539e-10■■■■■ 41.4
SRSF1Q07955 HERPUD1-213ENST00000568358 751 ntTSL 54.47□□□□□ -1.699e-10■■■■■ 41.4
SRSF1Q07955 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.539e-10■■■■■ 40.6
SRSF1Q07955 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.929e-10■■■■■ 40.6
SRSF1Q07955 FBXO30-201ENST00000237281 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.385e-13■■■■■ 40.5
SRSF1Q07955 DDX17-210ENST00000497196 856 ntTSL 38.03□□□□□ -1.126e-32■■■■■ 40.5
SRSF1Q07955 PHF1-208ENST00000486845 1099 ntTSL 520.05■□□□□ 0.89e-13■■■■■ 39.9
SRSF1Q07955 RBM6-202ENST00000419610 2128 ntTSL 215.86■□□□□ 0.135e-13■■■■■ 39.6
SRSF1Q07955 RBM6-209ENST00000441115 1876 ntTSL 215.41■□□□□ 0.065e-13■■■■■ 39.6
SRSF1Q07955 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.035e-13■■■■■ 39.6
SRSF1Q07955 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.345e-13■■■■■ 39.6
SRSF1Q07955 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.635e-13■■■■■ 39.6
SRSF1Q07955 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.685e-13■■■■■ 39.6
SRSF1Q07955 RBM6-213ENST00000454079 4324 ntTSL 29.05□□□□□ -0.965e-13■■■■■ 39.6
SRSF1Q07955 RBM6-208ENST00000438912 473 ntTSL 54.03□□□□□ -1.765e-13■■■■■ 39.6
SRSF1Q07955 MARS-220ENST00000549827 465 ntTSL 211.57□□□□□ -0.563e-12■■■■■ 38.7
SRSF1Q07955 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.141e-9■■■■■ 38.3
SRSF1Q07955 ANP32E-203ENST00000436748 1339 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.841e-9■■■■■ 38.3
SRSF1Q07955 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.861e-9■■■■■ 38.3
SRSF1Q07955 ANP32E-208ENST00000583931 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.121e-9■■■■■ 38.3
SRSF1Q07955 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.731e-9■■■■■ 38.3
SRSF1Q07955 EIF5B-205ENST00000617677 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.014e-7■■■■■ 38.2
SRSF1Q07955 EIF5B-201ENST00000289371 5777 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.224e-7■■■■■ 38.2
SRSF1Q07955 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.545e-10■■■■■ 37.7
SRSF1Q07955 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.755e-10■■■■■ 37.7
SRSF1Q07955 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.525e-10■■■■■ 37.7
SRSF1Q07955 ANP32B-203ENST00000486769 400 ntTSL 210.9□□□□□ -0.661e-53■■■■■ 37.7
SRSF1Q07955 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.411e-13■■■■■ 37.7
SRSF1Q07955 PTRH2-201ENST00000393038 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.662e-12■■■■■ 37.5
SRSF1Q07955 PTRH2-202ENST00000409433 2246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.212e-12■■■■■ 37.5
SRSF1Q07955 PTRH2-204ENST00000579915 531 ntTSL 45.24□□□□□ -1.572e-12■■■■■ 37.5
SRSF1Q07955 PTRH2-205ENST00000587935 409 ntTSL 34.35□□□□□ -1.712e-12■■■■■ 37.5
SRSF1Q07955 IST1-222ENST00000545388 630 ntTSL 210.77□□□□□ -0.695e-12■■■■■ 37.5
SRSF1Q07955 IST1-214ENST00000538709 491 ntTSL 210.29□□□□□ -0.765e-12■■■■■ 37.5
SRSF1Q07955 IST1-210ENST00000537571 603 ntTSL 25.02□□□□□ -1.615e-12■■■■■ 37.5
SRSF1Q07955 DDB2-216ENST00000622878 556 ntTSL 415.21■□□□□ 0.033e-9■■■■■ 37.2
SRSF1Q07955 DDB2-212ENST00000617022 2181 ntTSL 213.4□□□□□ -0.263e-9■■■■■ 37.2
SRSF1Q07955 DDB2-215ENST00000622090 580 ntTSL 513.16□□□□□ -0.33e-9■■■■■ 37.2
SRSF1Q07955 DDB2-203ENST00000378601 1591 ntTSL 211.47□□□□□ -0.573e-9■■■■■ 37.2
SRSF1Q07955 DDB2-208ENST00000614825 852 ntTSL 311.04□□□□□ -0.643e-9■■■■■ 37.2
SRSF1Q07955 DDB2-205ENST00000610805 793 ntTSL 510.91□□□□□ -0.663e-9■■■■■ 37.2
SRSF1Q07955 DDB2-201ENST00000256996 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.753e-9■■■■■ 37.2
SRSF1Q07955 DDB2-204ENST00000378603 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.763e-9■■■■■ 37.2
SRSF1Q07955 DDB2-202ENST00000378600 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.763e-9■■■■■ 37.2
SRSF1Q07955 DDB2-211ENST00000616278 960 ntTSL 210.29□□□□□ -0.763e-9■■■■■ 37.2
SRSF1Q07955 DDB2-210ENST00000615695 897 ntTSL 29.83□□□□□ -0.843e-9■■■■■ 37.2
SRSF1Q07955 DDB2-206ENST00000612309 3101 ntTSL 27.05□□□□□ -1.283e-9■■■■■ 37.2
SRSF1Q07955 CCDC18-AS1-223ENST00000457387 806 ntTSL 213.4□□□□□ -0.263e-7■■■■■ 37.1
SRSF1Q07955 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.343e-7■■■■■ 37.1
SRSF1Q07955 CCDC18-AS1-217ENST00000449305 748 ntTSL 212.89□□□□□ -0.353e-7■■■■■ 37.1
SRSF1Q07955 CCDC18-AS1-214ENST00000445076 620 ntTSL 29.26□□□□□ -0.933e-7■■■■■ 37.1
SRSF1Q07955 CCDC18-AS1-201ENST00000411670 675 ntTSL 58.25□□□□□ -1.093e-7■■■■■ 37.1
SRSF1Q07955 CCDC18-AS1-216ENST00000447577 431 ntTSL 57.73□□□□□ -1.173e-7■■■■■ 37.1
SRSF1Q07955 CCDC18-AS1-220ENST00000452347 969 ntTSL 27.28□□□□□ -1.243e-7■■■■■ 37.1
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