Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 HM13-219ENST00000487964 902 ntTSL 510.05□□□□□ -0.81e-15■■■□□ 15
SRSF9Q13242 ATG4B-201ENST00000344376 1566 ntTSL 59.91□□□□□ -0.822e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 FOXRED1-218ENST00000534315 2210 ntTSL 1 (best)9.72□□□□□ -0.852e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 SPG7-206ENST00000562775 1595 ntTSL 1 (best)9.35□□□□□ -0.912e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 FOXRED1-204ENST00000525770 1427 ntTSL 29.05□□□□□ -0.962e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 HM13-208ENST00000464508 855 ntTSL 29.04□□□□□ -0.961e-15■■■□□ 15
SRSF9Q13242 ATG4B-224ENST00000494132 828 ntTSL 29.03□□□□□ -0.962e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 PLPP5-212ENST00000531109 581 ntTSL 38.33□□□□□ -1.082e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 HM13-216ENST00000479096 598 ntTSL 37.81□□□□□ -1.161e-15■■■□□ 15
SRSF9Q13242 HM13-209ENST00000464661 906 ntTSL 37.26□□□□□ -1.251e-15■■■□□ 15
SRSF9Q13242 FOXRED1-210ENST00000530642 3045 ntTSL 26.65□□□□□ -1.342e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 FOXRED1-216ENST00000533839 559 ntTSL 45.97□□□□□ -1.452e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.492e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 PLPP5-207ENST00000527793 392 ntTSL 34.39□□□□□ -1.712e-8■■■□□ 15
SRSF9Q13242 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC4.04□□□□□ -1.761e-15■■■□□ 15
SRSF9Q13242 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.492e-7■■■□□ 14.9
SRSF9Q13242 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.182e-6■■■□□ 14.9
SRSF9Q13242 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.712e-6■■■□□ 14.9
SRSF9Q13242 PLCXD1-203ENST00000399012 5287 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.732e-6■■■□□ 14.9
SRSF9Q13242 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.72e-8■■■□□ 14.8
SRSF9Q13242 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.842e-8■■■□□ 14.8
SRSF9Q13242 HM13-220ENST00000492709 1248 ntTSL 59.29□□□□□ -0.922e-8■■■□□ 14.8
SRSF9Q13242 HM13-213ENST00000469126 756 ntTSL 59.21□□□□□ -0.942e-8■■■□□ 14.8
SRSF9Q13242 HM13-203ENST00000344042 847 ntTSL 58.53□□□□□ -1.042e-8■■■□□ 14.8
SRSF9Q13242 HM13-205ENST00000460225 443 ntTSL 58.51□□□□□ -1.052e-8■■■□□ 14.8
SRSF9Q13242 HM13-204ENST00000398174 3792 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.062e-8■■■□□ 14.8
SRSF9Q13242 HM13-223ENST00000496438 699 ntTSL 58.11□□□□□ -1.112e-8■■■□□ 14.8
SRSF9Q13242 HM13-212ENST00000469097 801 ntTSL 57.14□□□□□ -1.272e-8■■■□□ 14.8
SRSF9Q13242 CHRD-208ENST00000460627 4719 ntTSL 214.31□□□□□ -0.125e-8■■■□□ 14.8
SRSF9Q13242 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.325e-8■■■□□ 14.8
SRSF9Q13242 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.455e-8■■■□□ 14.8
SRSF9Q13242 CHRD-205ENST00000448472 3547 ntTSL 1 (best)12.27□□□□□ -0.455e-8■■■□□ 14.8
SRSF9Q13242 CHRD-204ENST00000420973 3492 ntTSL 1 (best)11.5□□□□□ -0.575e-8■■■□□ 14.8
SRSF9Q13242 CHRD-212ENST00000470150 4234 ntTSL 210.94□□□□□ -0.665e-8■■■□□ 14.8
SRSF9Q13242 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.75e-8■■■□□ 14.8
SRSF9Q13242 PTP4A1-207ENST00000639568 532 ntTSL 56.83□□□□□ -1.327e-7■■■□□ 14.8
SRSF9Q13242 PTP4A1-202ENST00000470661 479 ntTSL 24.21□□□□□ -1.747e-7■■■□□ 14.8
SRSF9Q13242 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.218e-12■■■□□ 14.7
SRSF9Q13242 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.368e-12■■■□□ 14.7
SRSF9Q13242 POLR3E-211ENST00000564750 2327 ntTSL 212.45□□□□□ -0.428e-12■■■□□ 14.7
SRSF9Q13242 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.458e-12■■■□□ 14.7
SRSF9Q13242 POLR3E-208ENST00000564061 4800 ntTSL 1 (best)10.26□□□□□ -0.778e-12■■■□□ 14.7
SRSF9Q13242 POLR3E-219ENST00000615879 3655 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.818e-12■■■□□ 14.7
SRSF9Q13242 POLR3E-201ENST00000299853 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.848e-12■■■□□ 14.7
SRSF9Q13242 WNK4-205ENST00000592072 1613 ntTSL 213.32□□□□□ -0.281e-6■■■□□ 14.7
SRSF9Q13242 WNK4-202ENST00000587705 586 ntTSL 411.34□□□□□ -0.591e-6■■■□□ 14.7
SRSF9Q13242 WNK4-204ENST00000591448 3909 ntTSL 1 (best)10.06□□□□□ -0.81e-6■■■□□ 14.7
SRSF9Q13242 WNK4-201ENST00000246914 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.91e-6■■■□□ 14.7
SRSF9Q13242 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.244e-8■■■□□ 14.6
SRSF9Q13242 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.264e-8■■■□□ 14.6
SRSF9Q13242 UQCRC2-201ENST00000268379 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.174e-8■■■□□ 14.6
SRSF9Q13242 TMCO3-205ENST00000465556 314 ntTSL 37.39□□□□□ -1.234e-8■■■□□ 14.6
SRSF9Q13242 ATF7IP2-205ENST00000535850 1907 ntTSL 26.37□□□□□ -1.394e-6■■■□□ 14.6
SRSF9Q13242 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.594e-6■■■□□ 14.6
SRSF9Q13242 UQCRC2-202ENST00000561553 1415 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.624e-8■■■□□ 14.6
SRSF9Q13242 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.644e-6■■■□□ 14.6
SRSF9Q13242 UQCRC2-205ENST00000563898 1406 ntTSL 54.14□□□□□ -1.754e-8■■■□□ 14.6
SRSF9Q13242 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.764e-6■■■□□ 14.6
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SRSF9Q13242 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.772e-7■■■□□ 14.6
SRSF9Q13242 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.82e-7■■■□□ 14.6
SRSF9Q13242 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.812e-7■■■□□ 14.6
SRSF9Q13242 SLC26A6-201ENST00000307364 2586 ntTSL 1 (best)9.81□□□□□ -0.842e-7■■■□□ 14.6
SRSF9Q13242 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.862e-7■■■□□ 14.6
SRSF9Q13242 ANKRD11-204ENST00000378332 1982 ntTSL 214.4□□□□□ -0.11e-7■■□□□ 14.5
SRSF9Q13242 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.281e-7■■□□□ 14.5
SRSF9Q13242 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.244e-6■■□□□ 14.5
SRSF9Q13242 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.072e-6■■□□□ 14.5
SRSF9Q13242 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.722e-6■■□□□ 14.5
SRSF9Q13242 NCL-205ENST00000453992 964 ntTSL 411.83□□□□□ -0.525e-27■■□□□ 14.5
SRSF9Q13242 NCL-203ENST00000417652 568 ntTSL 44.23□□□□□ -1.735e-27■■□□□ 14.5
SRSF9Q13242 NCL-206ENST00000454824 606 ntTSL 34.23□□□□□ -1.735e-27■■□□□ 14.5
SRSF9Q13242 NCL-204ENST00000436894 562 ntTSL 43.47□□□□□ -1.855e-27■■□□□ 14.5
SRSF9Q13242 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.879e-8■■□□□ 14.5
SRSF9Q13242 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.542e-6■■□□□ 14.4
SRSF9Q13242 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.732e-10■■□□□ 14.4
SRSF9Q13242 SRSF5-215ENST00000556587 1863 ntTSL 1 (best)9.24□□□□□ -0.932e-10■■□□□ 14.4
SRSF9Q13242 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.942e-10■■□□□ 14.4
SRSF9Q13242 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.072e-10■■□□□ 14.4
SRSF9Q13242 SRSF5-212ENST00000556184 2443 ntTSL 1 (best)8.1□□□□□ -1.112e-10■■□□□ 14.4
SRSF9Q13242 SRSF5-211ENST00000555547 2057 ntTSL 57.4□□□□□ -1.232e-10■■□□□ 14.4
SRSF9Q13242 SRSF5-207ENST00000554465 3044 ntTSL 1 (best)6.18□□□□□ -1.422e-10■■□□□ 14.4
SRSF9Q13242 SRSF5-217ENST00000557154 1500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.432e-10■■□□□ 14.4
SRSF9Q13242 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.44e-6■■□□□ 14.4
SRSF9Q13242 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.644e-6■■□□□ 14.4
SRSF9Q13242 UCKL1-205ENST00000483710 524 ntTSL 36.23□□□□□ -1.414e-6■■□□□ 14.4
SRSF9Q13242 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.242e-9■■□□□ 14.4
SRSF9Q13242 APMAP-202ENST00000451442 2117 ntTSL 59.84□□□□□ -0.832e-9■■□□□ 14.4
SRSF9Q13242 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.466e-8■■□□□ 14.3
SRSF9Q13242 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.426e-8■■□□□ 14.3
SRSF9Q13242 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.386e-8■■□□□ 14.3
SRSF9Q13242 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.386e-8■■□□□ 14.3
SRSF9Q13242 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.326e-8■■□□□ 14.3
SRSF9Q13242 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.46e-8■■□□□ 14.3
SRSF9Q13242 AP1G2-204ENST00000465445 2554 ntTSL 59.93□□□□□ -0.824e-9■■□□□ 14.3
SRSF9Q13242 AP1G2-205ENST00000535852 2471 ntTSL 1 (best)8.96□□□□□ -0.984e-9■■□□□ 14.3
SRSF9Q13242 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.463e-6■■□□□ 14.2
SRSF9Q13242 CTAGE5-202ENST00000280083 3860 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.877e-21■■□□□ 14.2
SRSF9Q13242 CTAGE5-206ENST00000396158 3695 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.947e-21■■□□□ 14.2
SRSF9Q13242 CTAGE5-216ENST00000556990 568 ntTSL 48.95□□□□□ -0.987e-21■■□□□ 14.2
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