Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
XPCQ01831 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
XPCQ01831 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
XPCQ01831 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
XPCQ01831 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
XPCQ01831 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
XPCQ01831 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
XPCQ01831 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
XPCQ01831 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
XPCQ01831 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
XPCQ01831 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
XPCQ01831 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
XPCQ01831 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
XPCQ01831 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
XPCQ01831 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
XPCQ01831 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
XPCQ01831 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
XPCQ01831 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
XPCQ01831 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
XPCQ01831 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
XPCQ01831 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
XPCQ01831 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
XPCQ01831 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
XPCQ01831 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
XPCQ01831 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
XPCQ01831 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
XPCQ01831 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
XPCQ01831 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
XPCQ01831 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
XPCQ01831 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
XPCQ01831 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
XPCQ01831 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
XPCQ01831 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
XPCQ01831 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
XPCQ01831 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
XPCQ01831 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
XPCQ01831 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC32.61■■■□□ 2.81
XPCQ01831 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC32.61■■■□□ 2.81
XPCQ01831 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
XPCQ01831 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
XPCQ01831 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
XPCQ01831 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
XPCQ01831 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
XPCQ01831 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
XPCQ01831 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
XPCQ01831 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
XPCQ01831 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
XPCQ01831 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
XPCQ01831 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
XPCQ01831 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
XPCQ01831 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
XPCQ01831 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
XPCQ01831 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
XPCQ01831 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
XPCQ01831 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
XPCQ01831 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
XPCQ01831 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
XPCQ01831 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
XPCQ01831 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
XPCQ01831 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
XPCQ01831 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
XPCQ01831 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
XPCQ01831 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
XPCQ01831 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
XPCQ01831 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
XPCQ01831 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
XPCQ01831 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
XPCQ01831 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
XPCQ01831 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
XPCQ01831 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
XPCQ01831 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
XPCQ01831 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
XPCQ01831 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
XPCQ01831 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
XPCQ01831 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
XPCQ01831 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
XPCQ01831 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
XPCQ01831 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
XPCQ01831 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
XPCQ01831 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
XPCQ01831 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
XPCQ01831 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
XPCQ01831 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
XPCQ01831 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
XPCQ01831 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
XPCQ01831 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
XPCQ01831 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
XPCQ01831 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
XPCQ01831 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
XPCQ01831 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
XPCQ01831 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
XPCQ01831 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
XPCQ01831 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
XPCQ01831 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
XPCQ01831 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
XPCQ01831 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
XPCQ01831 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
XPCQ01831 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
XPCQ01831 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
XPCQ01831 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms