RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540011.2

EPHA10-211, Transcript of EPH receptor A10, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene EPHA10, Length 720 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA10-211ENST00000540011 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.58■■■■■ 6.49
EPHA10-211ENST00000540011 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.29■■■■■ 5.48
EPHA10-211ENST00000540011 ABCC9O60706 1549 aa47.94■■■■■ 5.26
EPHA10-211ENST00000540011 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.49■■■■■ 5.03
EPHA10-211ENST00000540011 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.35■■■■■ 5.01
EPHA10-211ENST00000540011 NACADO15069 1562 aa46.3■■■■■ 5
EPHA10-211ENST00000540011 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.3■■■■■ 5
EPHA10-211ENST00000540011 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.08■■■■■ 4.97
EPHA10-211ENST00000540011 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46■■■■■ 4.95
EPHA10-211ENST00000540011 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.09■■■■■ 4.81
EPHA10-211ENST00000540011 SCRIBQ14160 1630 aa45.01■■■■■ 4.8
EPHA10-211ENST00000540011 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.86■■■■■ 4.77
EPHA10-211ENST00000540011 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.73■■■■■ 4.75
EPHA10-211ENST00000540011 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.43■■■■■ 4.7
EPHA10-211ENST00000540011 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.61■■■■■ 4.57
EPHA10-211ENST00000540011 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.58■■■■■ 4.57
EPHA10-211ENST00000540011 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.34■■■■■ 4.53
EPHA10-211ENST00000540011 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.2■■■■■ 4.51
EPHA10-211ENST00000540011 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.12■■■■■ 4.49
EPHA10-211ENST00000540011 SMARCA4P51532 1647 aa43.05■■■■■ 4.48
EPHA10-211ENST00000540011 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.8■■■■■ 4.44
EPHA10-211ENST00000540011 SMARCA2P51531 1590 aa42.78■■■■■ 4.44
EPHA10-211ENST00000540011 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.74■■■■■ 4.43
EPHA10-211ENST00000540011 NCAPD3P42695 1498 aa42.68■■■■■ 4.42
EPHA10-211ENST00000540011 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.6■■■■■ 4.41
EPHA10-211ENST00000540011 HMGXB3Q12766 1538 aa42.51■■■■■ 4.39
EPHA10-211ENST00000540011 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.49■■■■■ 4.39
EPHA10-211ENST00000540011 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.46■■■■■ 4.39
EPHA10-211ENST00000540011 WIZO95785 1651 aa42.37■■■■■ 4.37
EPHA10-211ENST00000540011 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.99■■■■■ 4.31
EPHA10-211ENST00000540011 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
EPHA10-211ENST00000540011 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.54■■■■■ 4.24
EPHA10-211ENST00000540011 NESP48681 1621 aa41.51■■■■■ 4.24
EPHA10-211ENST00000540011 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.49■■■■■ 4.23
EPHA10-211ENST00000540011 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.47■■■■■ 4.23
EPHA10-211ENST00000540011 ERCC6Q03468 1493 aa41.4■■■■■ 4.22
EPHA10-211ENST00000540011 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.32■■■■■ 4.21
EPHA10-211ENST00000540011 CFTRP13569 1480 aa41.28■■■■■ 4.2
EPHA10-211ENST00000540011 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.04■■■■■ 4.16
EPHA10-211ENST00000540011 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.02■■■■■ 4.16
EPHA10-211ENST00000540011 PRDM2Q13029 1718 aa40.98■■■■■ 4.15
EPHA10-211ENST00000540011 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.97■■■■■ 4.15
EPHA10-211ENST00000540011 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.82■■■■■ 4.12
EPHA10-211ENST00000540011 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.81■■■■■ 4.12
EPHA10-211ENST00000540011 CUX2O14529 1486 aa40.77■■■■■ 4.12
EPHA10-211ENST00000540011 WDR62O43379 1518 aa40.62■■■■■ 4.09
EPHA10-211ENST00000540011 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
EPHA10-211ENST00000540011 ABCC8Q09428 1581 aa40.48■■■■■ 4.07
EPHA10-211ENST00000540011 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.37■■■■■ 4.05
EPHA10-211ENST00000540011 TOPBP1Q92547 1522 aa40.37■■■■■ 4.05
EPHA10-211ENST00000540011 CUX1P39880 1505 aa40.15■■■■■ 4.02
EPHA10-211ENST00000540011 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.09■■■■■ 4.01
EPHA10-211ENST00000540011 IFT140Q96RY7 1462 aa40.08■■■■■ 4.01
EPHA10-211ENST00000540011 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
EPHA10-211ENST00000540011 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.01■■■■■ 4
EPHA10-211ENST00000540011 SOGA1O94964 1423 aa39.95■■■■□ 3.99
EPHA10-211ENST00000540011 TOP2BQ02880 1626 aa39.92■■■■□ 3.98
EPHA10-211ENST00000540011 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.9■■■■□ 3.98
EPHA10-211ENST00000540011 SYNJ1O43426 1573 aa39.89■■■■□ 3.98
EPHA10-211ENST00000540011 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
EPHA10-211ENST00000540011 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.85■■■■□ 3.97
EPHA10-211ENST00000540011 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.79■■■■□ 3.96
EPHA10-211ENST00000540011 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
EPHA10-211ENST00000540011 WDR97A6NE52 1622 aa39.65■■■■□ 3.94
EPHA10-211ENST00000540011 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.65■■■■□ 3.94
EPHA10-211ENST00000540011 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.64■■■■□ 3.94
EPHA10-211ENST00000540011 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.63■■■■□ 3.93
EPHA10-211ENST00000540011 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.48■■■■□ 3.91
EPHA10-211ENST00000540011 TRIM41Q8WV44 630 aa39.47■■■■□ 3.91
EPHA10-211ENST00000540011 GRIN2BQ13224 1484 aa39.44■■■■□ 3.9
EPHA10-211ENST00000540011 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.4■■■■□ 3.9
EPHA10-211ENST00000540011 PBRM1Q86U86 1689 aa39.33■■■■□ 3.89
EPHA10-211ENST00000540011 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.31■■■■□ 3.88
EPHA10-211ENST00000540011 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
EPHA10-211ENST00000540011 KIF27Q86VH2 1401 aa39.28■■■■□ 3.88
EPHA10-211ENST00000540011 FBLN2P98095 1184 aa39.26■■■■□ 3.88
EPHA10-211ENST00000540011 OSCARQ8IYS5 282 aa39.2■■■■□ 3.87
EPHA10-211ENST00000540011 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.19■■■■□ 3.86
EPHA10-211ENST00000540011 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.19■■■■□ 3.86
EPHA10-211ENST00000540011 SYNJ2O15056 1496 aa39.13■■■■□ 3.85
EPHA10-211ENST00000540011 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.12■■■■□ 3.85
EPHA10-211ENST00000540011 CHD1O14646 1710 aa39.1■■■■□ 3.85
EPHA10-211ENST00000540011 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.07■■■■□ 3.85
EPHA10-211ENST00000540011 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.05■■■■□ 3.84
EPHA10-211ENST00000540011 ADAMTS12P58397 1594 aa39.04■■■■□ 3.84
EPHA10-211ENST00000540011 IGF1RP08069 1367 aa38.98■■■■□ 3.83
EPHA10-211ENST00000540011 CUL7Q14999 1698 aa38.92■■■■□ 3.82
EPHA10-211ENST00000540011 GRIN2AQ12879 1464 aa38.9■■■■□ 3.82
EPHA10-211ENST00000540011 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.86■■■■□ 3.81
EPHA10-211ENST00000540011 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.82■■■■□ 3.8
EPHA10-211ENST00000540011 EEA1Q15075 1411 aa38.76■■■■□ 3.8
EPHA10-211ENST00000540011 NUP160Q12769 1436 aa38.68■■■■□ 3.78
EPHA10-211ENST00000540011 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.67■■■■□ 3.78
EPHA10-211ENST00000540011 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.64■■■■□ 3.78
EPHA10-211ENST00000540011 CEP170Q5SW79 1584 aa38.64■■■■□ 3.78
EPHA10-211ENST00000540011 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.63■■■■□ 3.77
EPHA10-211ENST00000540011 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.6■■■■□ 3.77
EPHA10-211ENST00000540011 PRXQ9BXM0 1461 aa38.5■■■■□ 3.75
EPHA10-211ENST00000540011 ARHGEF11O15085 1522 aa38.47■■■■□ 3.75
EPHA10-211ENST00000540011 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.44■■■■□ 3.74
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