RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457257.5

MCRIP1-202, Transcript of MAPK regulated corepressor interacting protein 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MCRIP1, Length 942 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1-202ENST00000457257 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.11■■■■■ 6.57
MCRIP1-202ENST00000457257 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.93■■■■■ 5.58
MCRIP1-202ENST00000457257 ABCC9O60706 1549 aa48.52■■■■■ 5.36
MCRIP1-202ENST00000457257 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.82■■■■■ 5.09
MCRIP1-202ENST00000457257 NACADO15069 1562 aa46.81■■■■■ 5.08
MCRIP1-202ENST00000457257 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.81■■■■■ 5.08
MCRIP1-202ENST00000457257 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.61■■■■■ 5.05
MCRIP1-202ENST00000457257 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.59■■■■■ 5.05
MCRIP1-202ENST00000457257 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.48■■■■■ 5.03
MCRIP1-202ENST00000457257 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.93■■■■■ 4.94
MCRIP1-202ENST00000457257 SCRIBQ14160 1630 aa45.48■■■■■ 4.87
MCRIP1-202ENST00000457257 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.45■■■■■ 4.87
MCRIP1-202ENST00000457257 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.28■■■■■ 4.842e-6■■□□□ 13.8
MCRIP1-202ENST00000457257 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.97■■■■■ 4.79
MCRIP1-202ENST00000457257 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.34■■■■■ 4.69
MCRIP1-202ENST00000457257 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.19■■■■■ 4.66
MCRIP1-202ENST00000457257 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.98■■■■■ 4.63
MCRIP1-202ENST00000457257 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.67■■■■■ 4.58
MCRIP1-202ENST00000457257 SMARCA4P51532 1647 aa43.55■■■■■ 4.56
MCRIP1-202ENST00000457257 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.49■■■■■ 4.55
MCRIP1-202ENST00000457257 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.24■■■■■ 4.51
MCRIP1-202ENST00000457257 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.2■■■■■ 4.51
MCRIP1-202ENST00000457257 SMARCA2P51531 1590 aa43.2■■■■■ 4.51
MCRIP1-202ENST00000457257 NCAPD3P42695 1498 aa43.15■■■■■ 4.5
MCRIP1-202ENST00000457257 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.14■■■■■ 4.5
MCRIP1-202ENST00000457257 HMGXB3Q12766 1538 aa43.02■■■■■ 4.48
MCRIP1-202ENST00000457257 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.85■■■■■ 4.45
MCRIP1-202ENST00000457257 WIZO95785 1651 aa42.83■■■■■ 4.45
MCRIP1-202ENST00000457257 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.77■■■■■ 4.44
MCRIP1-202ENST00000457257 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.37■■■■■ 4.37
MCRIP1-202ENST00000457257 NESP48681 1621 aa42.06■■■■■ 4.32
MCRIP1-202ENST00000457257 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.05■■■■■ 4.32
MCRIP1-202ENST00000457257 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.87■■■■■ 4.29
MCRIP1-202ENST00000457257 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.81■■■■■ 4.28
MCRIP1-202ENST00000457257 ERCC6Q03468 1493 aa41.79■■■■■ 4.28
MCRIP1-202ENST00000457257 CFTRP13569 1480 aa41.7■■■■■ 4.27
MCRIP1-202ENST00000457257 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.69■■■■■ 4.26
MCRIP1-202ENST00000457257 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.26
MCRIP1-202ENST00000457257 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.66■■■■■ 4.26
MCRIP1-202ENST00000457257 PRDM2Q13029 1718 aa41.6■■■■■ 4.25
MCRIP1-202ENST00000457257 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
MCRIP1-202ENST00000457257 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.41■■■■■ 4.22
MCRIP1-202ENST00000457257 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.36■■■■■ 4.21
MCRIP1-202ENST00000457257 CUX2O14529 1486 aa41.35■■■■■ 4.21
MCRIP1-202ENST00000457257 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.27■■■■■ 4.2
MCRIP1-202ENST00000457257 WDR62O43379 1518 aa41.18■■■■■ 4.18
MCRIP1-202ENST00000457257 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
MCRIP1-202ENST00000457257 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.8■■■■■ 4.12
MCRIP1-202ENST00000457257 TOPBP1Q92547 1522 aa40.8■■■■■ 4.12
MCRIP1-202ENST00000457257 ABCC8Q09428 1581 aa40.78■■■■■ 4.12
MCRIP1-202ENST00000457257 CUX1P39880 1505 aa40.57■■■■■ 4.09
MCRIP1-202ENST00000457257 IFT140Q96RY7 1462 aa40.48■■■■■ 4.07
MCRIP1-202ENST00000457257 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
MCRIP1-202ENST00000457257 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
MCRIP1-202ENST00000457257 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.38■■■■■ 4.05
MCRIP1-202ENST00000457257 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.34■■■■■ 4.05
MCRIP1-202ENST00000457257 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.32■■■■■ 4.04
MCRIP1-202ENST00000457257 TOP2BQ02880 1626 aa40.3■■■■■ 4.04
MCRIP1-202ENST00000457257 SYNJ1O43426 1573 aa40.28■■■■■ 4.04
MCRIP1-202ENST00000457257 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
MCRIP1-202ENST00000457257 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.25■■■■■ 4.03
MCRIP1-202ENST00000457257 SOGA1O94964 1423 aa40.24■■■■■ 4.03
MCRIP1-202ENST00000457257 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
MCRIP1-202ENST00000457257 WDR97A6NE52 1622 aa40.18■■■■■ 4.02
MCRIP1-202ENST00000457257 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.04■■■■■ 46e-10■■□□□ 12.3
MCRIP1-202ENST00000457257 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.01■■■■■ 4
MCRIP1-202ENST00000457257 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
MCRIP1-202ENST00000457257 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.91■■■■□ 3.98
MCRIP1-202ENST00000457257 PBRM1Q86U86 1689 aa39.86■■■■□ 3.97
MCRIP1-202ENST00000457257 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.81■■■■□ 3.96
MCRIP1-202ENST00000457257 GRIN2BQ13224 1484 aa39.78■■■■□ 3.96
MCRIP1-202ENST00000457257 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.78■■■■□ 3.96
MCRIP1-202ENST00000457257 CHD1O14646 1710 aa39.72■■■■□ 3.95
MCRIP1-202ENST00000457257 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.72■■■■□ 3.95
MCRIP1-202ENST00000457257 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.68■■■■□ 3.94
MCRIP1-202ENST00000457257 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.55■■■■□ 3.92
MCRIP1-202ENST00000457257 OSCARQ8IYS5 282 aa39.54■■■■□ 3.92
MCRIP1-202ENST00000457257 SYNJ2O15056 1496 aa39.51■■■■□ 3.92
MCRIP1-202ENST00000457257 ADAMTS12P58397 1594 aa39.5■■■■□ 3.91
MCRIP1-202ENST00000457257 KIF27Q86VH2 1401 aa39.44■■■■□ 3.9
MCRIP1-202ENST00000457257 FBLN2P98095 1184 aa39.42■■■■□ 3.9
MCRIP1-202ENST00000457257 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.37■■■■□ 3.89
MCRIP1-202ENST00000457257 TRIM41Q8WV44 630 aa39.36■■■■□ 3.89
MCRIP1-202ENST00000457257 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.35■■■■□ 3.89
MCRIP1-202ENST00000457257 GRIN2AQ12879 1464 aa39.3■■■■□ 3.88
MCRIP1-202ENST00000457257 CUL7Q14999 1698 aa39.27■■■■□ 3.88
MCRIP1-202ENST00000457257 IGF1RP08069 1367 aa39.25■■■■□ 3.87
MCRIP1-202ENST00000457257 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.24■■■■□ 3.87
MCRIP1-202ENST00000457257 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.17■■■■□ 3.86
MCRIP1-202ENST00000457257 CEP170Q5SW79 1584 aa39.13■■■■□ 3.85
MCRIP1-202ENST00000457257 NUP160Q12769 1436 aa39.12■■■■□ 3.85
MCRIP1-202ENST00000457257 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.06■■■■□ 3.84
MCRIP1-202ENST00000457257 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.06■■■■□ 3.84
MCRIP1-202ENST00000457257 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.06■■■■□ 3.84
MCRIP1-202ENST00000457257 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.05■■■■□ 3.84
MCRIP1-202ENST00000457257 ARHGEF11O15085 1522 aa39.03■■■■□ 3.84
MCRIP1-202ENST00000457257 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.02■■■■□ 3.84
MCRIP1-202ENST00000457257 SHROOM2Q13796 1616 aa38.89■■■■□ 3.82
MCRIP1-202ENST00000457257 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.84■■■■□ 3.81
MCRIP1-202ENST00000457257 EEA1Q15075 1411 aa38.82■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms