RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267328.4

RAB20-201, Transcript of RAB20, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB20, Length 1,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20-201ENST00000267328 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.26■■■■■ 6.6
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RAB20-201ENST00000267328 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.56■■■■■ 5.04
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RAB20-201ENST00000267328 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.55■■■■■ 5.04
RAB20-201ENST00000267328 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.42■■■■■ 5.02
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RAB20-201ENST00000267328 SCRIBQ14160 1630 aa45.38■■■■■ 4.86
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RAB20-201ENST00000267328 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.72■■■■■ 4.59
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RAB20-201ENST00000267328 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.38■■■■■ 4.54
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RAB20-201ENST00000267328 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.07■■■■■ 4.48
RAB20-201ENST00000267328 SMARCA2P51531 1590 aa43.06■■■■■ 4.48
RAB20-201ENST00000267328 NCAPD3P42695 1498 aa42.94■■■■■ 4.46
RAB20-201ENST00000267328 WIZO95785 1651 aa42.94■■■■■ 4.46
RAB20-201ENST00000267328 HMGXB3Q12766 1538 aa42.82■■■■■ 4.45
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RAB20-201ENST00000267328 PRDM2Q13029 1718 aa41.45■■■■■ 4.23
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RAB20-201ENST00000267328 ERCC6Q03468 1493 aa41.19■■■■■ 4.19
RAB20-201ENST00000267328 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.11■■■■■ 4.17
RAB20-201ENST00000267328 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
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RAB20-201ENST00000267328 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.7■■■■■ 4.11
RAB20-201ENST00000267328 TOPBP1Q92547 1522 aa40.67■■■■■ 4.1
RAB20-201ENST00000267328 CUX1P39880 1505 aa40.63■■■■■ 4.1
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RAB20-201ENST00000267328 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.51■■■■■ 4.08
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RAB20-201ENST00000267328 WDR97A6NE52 1622 aa40.07■■■■■ 4
RAB20-201ENST00000267328 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.04■■■■■ 4
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RAB20-201ENST00000267328 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
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RAB20-201ENST00000267328 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.82■■■■□ 3.97
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RAB20-201ENST00000267328 CEP170Q5SW79 1584 aa38.94■■■■□ 3.82
RAB20-201ENST00000267328 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.84■■■■□ 3.81
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RAB20-201ENST00000267328 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.75■■■■□ 3.79
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