Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 RNPS1-210ENST00000564601 903 ntTSL 320.87■□□□□ 0.938e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 FDXR-209ENST00000579482 2157 ntTSL 220.85■□□□□ 0.938e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.928e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 VRK2-205ENST00000432057 1870 ntTSL 1 (best)20.77■□□□□ 0.928e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 EXOC5-206ENST00000555148 2349 ntTSL 220.76■□□□□ 0.918e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 EHMT1-224ENST00000630754 709 ntTSL 320.72■□□□□ 0.918e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 LMF1-213ENST00000568964 853 ntTSL 220.69■□□□□ 0.98e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 PRKAR1B-206ENST00000417852 651 ntTSL 220.69■□□□□ 0.98e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 FDXR-220ENST00000610946 529 ntTSL 520.67■□□□□ 0.98e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.98e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 FDXR-207ENST00000577932 572 ntTSL 220.58■□□□□ 0.898e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ACAP3-208ENST00000472541 1946 ntTSL 520.57■□□□□ 0.888e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TSPAN4-210ENST00000464987 2205 ntTSL 520.41■□□□□ 0.868e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MSH6-206ENST00000455383 578 ntTSL 520.39■□□□□ 0.858e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.858e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 PLXNB1-209ENST00000466353 626 ntTSL 320.29■□□□□ 0.848e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.848e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.838e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.828e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.828e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SH3GL1-205ENST00000598230 577 ntTSL 520.13■□□□□ 0.818e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.818e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TSPAN4-215ENST00000525334 860 ntTSL 320.06■□□□□ 0.88e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TGIF2-206ENST00000560025 923 ntTSL 320.06■□□□□ 0.88e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TSPAN4-216ENST00000526055 469 ntTSL 220.03■□□□□ 0.88e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.788e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.788e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ZNF432-204ENST00000598446 862 ntTSL 319.93■□□□□ 0.788e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.788e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.758e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.758e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.748e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.748e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.738e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 STRN4-215ENST00000597063 570 ntTSL 419.59■□□□□ 0.738e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 STRN4-205ENST00000593979 675 ntTSL 419.59■□□□□ 0.738e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.718e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.718e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.718e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.78e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MSH6-207ENST00000456246 846 ntTSL 319.41■□□□□ 0.78e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.78e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 EXOC5-204ENST00000554598 772 ntTSL 219.36■□□□□ 0.698e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TNPO2-216ENST00000589956 594 ntTSL 519.36■□□□□ 0.698e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MSI2-210ENST00000579505 577 ntTSL 319.26■□□□□ 0.678e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 FDXR-210ENST00000579543 558 ntTSL 419.23■□□□□ 0.678e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 PLXNB2-205ENST00000432455 1620 ntTSL 519.22■□□□□ 0.678e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.678e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.658e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.658e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.648e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.638e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 PSD4-203ENST00000409656 2394 ntTSL 218.97■□□□□ 0.638e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.628e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 PLXNB2-203ENST00000425954 609 ntTSL 218.9■□□□□ 0.628e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.618e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.618e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.618e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.618e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.618e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 HUWE1-201ENST00000218328 5488 ntTSL 518.83■□□□□ 0.68e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 RNPS1-204ENST00000561518 1092 ntTSL 518.76■□□□□ 0.598e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.598e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.588e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 EHMT1-202ENST00000460486 818 ntTSL 518.62■□□□□ 0.578e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.558e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.528e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.518e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TRIM13-208ENST00000478111 478 ntTSL 218.21■□□□□ 0.518e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 FDXR-213ENST00000581219 567 ntTSL 418.18■□□□□ 0.58e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.58e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 GATD1-213ENST00000532320 1273 ntTSL 1 (best)18.15■□□□□ 0.58e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ZNF571-AS1-206ENST00000589750 515 ntTSL 318.14■□□□□ 0.498e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SH3D21-203ENST00000480549 3182 ntTSL 218.1■□□□□ 0.498e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 LMF1-203ENST00000545827 2731 ntTSL 218.09■□□□□ 0.498e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.498e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.498e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 LMF1-215ENST00000570014 882 ntTSL 518.01■□□□□ 0.478e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MAZ-209ENST00000565777 1313 ntTSL 217.98■□□□□ 0.478e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.468e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 PRKAR1B-205ENST00000414568 752 ntTSL 517.94■□□□□ 0.468e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 GATD1-216ENST00000534603 863 ntTSL 1 (best)17.81■□□□□ 0.448e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 CIRBP-233ENST00000591622 548 ntTSL 417.78■□□□□ 0.448e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.448e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ZNF571-AS1-210ENST00000591430 722 ntTSL 317.7■□□□□ 0.428e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.428e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 EXOC5-208ENST00000556318 518 ntTSL 417.63■□□□□ 0.418e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ZNF571-AS1-202ENST00000586013 477 ntTSL 1 (best)17.62■□□□□ 0.418e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SLC25A42-204ENST00000597661 519 ntTSL 317.62■□□□□ 0.418e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 LMF1-209ENST00000566627 694 ntTSL 317.54■□□□□ 0.48e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 STRN4-218ENST00000600358 1267 ntTSL 517.54■□□□□ 0.48e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.368e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 HNRNPUL1-213ENST00000599614 2447 ntTSL 517.3■□□□□ 0.368e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 AGER-202ENST00000375056 715 ntTSL 217.27■□□□□ 0.368e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.358e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.358e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.358e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 NDUFB2-211ENST00000476181 660 ntTSL 1 (best)17.23■□□□□ 0.358e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.348e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.348e-6■■■■■ 52.4
Retrieved 100 of 8,200 protein–RNA pairs in 171.3 ms