RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561518.5

RNPS1-204, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene RNPS1, Length 1,092 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-204ENST00000561518 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.34■■■■■ 4.21
RNPS1-204ENST00000561518 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.41■■■■□ 3.42
RNPS1-204ENST00000561518 ABCC9O60706 1549 aa35.19■■■■□ 3.22
RNPS1-204ENST00000561518 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
RNPS1-204ENST00000561518 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.41■■■■□ 3.1
RNPS1-204ENST00000561518 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.15■■■■□ 3.06
RNPS1-204ENST00000561518 NACADO15069 1562 aa34.11■■■■□ 3.05
RNPS1-204ENST00000561518 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.04■■■■□ 3.04
RNPS1-204ENST00000561518 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.01■■■■□ 3.03
RNPS1-204ENST00000561518 SCRIBQ14160 1630 aa33.39■■■□□ 2.94
RNPS1-204ENST00000561518 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.28■■■□□ 2.92
RNPS1-204ENST00000561518 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.18■■■□□ 2.9
RNPS1-204ENST00000561518 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.03■■■□□ 2.88
RNPS1-204ENST00000561518 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.02■■■□□ 2.88
RNPS1-204ENST00000561518 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.21■■■□□ 2.75
RNPS1-204ENST00000561518 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
RNPS1-204ENST00000561518 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
RNPS1-204ENST00000561518 SMARCA4P51532 1647 aa31.95■■■□□ 2.71
RNPS1-204ENST00000561518 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.92■■■□□ 2.7
RNPS1-204ENST00000561518 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.82■■■□□ 2.68
RNPS1-204ENST00000561518 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.8■■■□□ 2.68
RNPS1-204ENST00000561518 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
RNPS1-204ENST00000561518 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.63■■■□□ 2.65
RNPS1-204ENST00000561518 WIZO95785 1651 aa31.6■■■□□ 2.65
RNPS1-204ENST00000561518 SMARCA2P51531 1590 aa31.57■■■□□ 2.64
RNPS1-204ENST00000561518 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.57■■■□□ 2.64
RNPS1-204ENST00000561518 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
RNPS1-204ENST00000561518 NCAPD3P42695 1498 aa31.48■■■□□ 2.63
RNPS1-204ENST00000561518 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
RNPS1-204ENST00000561518 HMGXB3Q12766 1538 aa31.37■■■□□ 2.61
RNPS1-204ENST00000561518 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
RNPS1-204ENST00000561518 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.93■■■□□ 2.54
RNPS1-204ENST00000561518 NESP48681 1621 aa30.65■■■□□ 2.5
RNPS1-204ENST00000561518 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.63■■■□□ 2.49
RNPS1-204ENST00000561518 CFTRP13569 1480 aa30.56■■■□□ 2.48
RNPS1-204ENST00000561518 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.54■■■□□ 2.48
RNPS1-204ENST00000561518 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.33■■■□□ 2.45
RNPS1-204ENST00000561518 PRDM2Q13029 1718 aa30.33■■■□□ 2.45
RNPS1-204ENST00000561518 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.29■■■□□ 2.44
RNPS1-204ENST00000561518 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.25■■■□□ 2.43
RNPS1-204ENST00000561518 ERCC6Q03468 1493 aa30.24■■■□□ 2.43
RNPS1-204ENST00000561518 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.18■■■□□ 2.42
RNPS1-204ENST00000561518 ABCC8Q09428 1581 aa30.03■■■□□ 2.4
RNPS1-204ENST00000561518 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.01■■■□□ 2.4
RNPS1-204ENST00000561518 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
RNPS1-204ENST00000561518 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
RNPS1-204ENST00000561518 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.91■■■□□ 2.38
RNPS1-204ENST00000561518 CUX1P39880 1505 aa29.9■■■□□ 2.38
RNPS1-204ENST00000561518 WDR62O43379 1518 aa29.88■■■□□ 2.37
RNPS1-204ENST00000561518 TOPBP1Q92547 1522 aa29.87■■■□□ 2.37
RNPS1-204ENST00000561518 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.87■■■□□ 2.37
RNPS1-204ENST00000561518 SYNJ1O43426 1573 aa29.83■■■□□ 2.37
RNPS1-204ENST00000561518 TOP2BQ02880 1626 aa29.75■■■□□ 2.35
RNPS1-204ENST00000561518 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.74■■■□□ 2.35
RNPS1-204ENST00000561518 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.72■■■□□ 2.35
RNPS1-204ENST00000561518 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.69■■■□□ 2.34
RNPS1-204ENST00000561518 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
RNPS1-204ENST00000561518 TRIM41Q8WV44 630 aa29.66■■■□□ 2.34
RNPS1-204ENST00000561518 CUX2O14529 1486 aa29.64■■■□□ 2.34
RNPS1-204ENST00000561518 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.59■■■□□ 2.33
RNPS1-204ENST00000561518 SOGA1O94964 1423 aa29.55■■■□□ 2.32
RNPS1-204ENST00000561518 IFT140Q96RY7 1462 aa29.5■■■□□ 2.31
RNPS1-204ENST00000561518 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
RNPS1-204ENST00000561518 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.4■■■□□ 2.3
RNPS1-204ENST00000561518 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
RNPS1-204ENST00000561518 WDR97A6NE52 1622 aa29.38■■■□□ 2.29
RNPS1-204ENST00000561518 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
RNPS1-204ENST00000561518 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.31■■■□□ 2.283e-7■■■■□ 22.2
RNPS1-204ENST00000561518 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.28
RNPS1-204ENST00000561518 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.25■■■□□ 2.27
RNPS1-204ENST00000561518 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.23■■■□□ 2.27
RNPS1-204ENST00000561518 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.22■■■□□ 2.27
RNPS1-204ENST00000561518 KIF27Q86VH2 1401 aa29.21■■■□□ 2.27
RNPS1-204ENST00000561518 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
RNPS1-204ENST00000561518 GRIN2BQ13224 1484 aa29.11■■■□□ 2.25
RNPS1-204ENST00000561518 PBRM1Q86U86 1689 aa29.11■■■□□ 2.25
RNPS1-204ENST00000561518 IGF1RP08069 1367 aa29.06■■■□□ 2.24
RNPS1-204ENST00000561518 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.04■■■□□ 2.24
RNPS1-204ENST00000561518 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.04■■■□□ 2.24
RNPS1-204ENST00000561518 EEA1Q15075 1411 aa29.02■■■□□ 2.24
RNPS1-204ENST00000561518 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.97■■■□□ 2.23
RNPS1-204ENST00000561518 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
RNPS1-204ENST00000561518 ADAMTS12P58397 1594 aa28.92■■■□□ 2.22
RNPS1-204ENST00000561518 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.89■■■□□ 2.22
RNPS1-204ENST00000561518 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.88■■■□□ 2.21
RNPS1-204ENST00000561518 CUL7Q14999 1698 aa28.88■■■□□ 2.21
RNPS1-204ENST00000561518 FBLN2P98095 1184 aa28.86■■■□□ 2.21
RNPS1-204ENST00000561518 SYNJ2O15056 1496 aa28.85■■■□□ 2.21
RNPS1-204ENST00000561518 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
RNPS1-204ENST00000561518 PRXQ9BXM0 1461 aa28.82■■■□□ 2.2
RNPS1-204ENST00000561518 CHD1O14646 1710 aa28.78■■■□□ 2.2
RNPS1-204ENST00000561518 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.77■■■□□ 2.2
RNPS1-204ENST00000561518 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.76■■■□□ 2.19
RNPS1-204ENST00000561518 GRIN2AQ12879 1464 aa28.75■■■□□ 2.19
RNPS1-204ENST00000561518 KIF21BO75037 1637 aa28.71■■■□□ 2.19
RNPS1-204ENST00000561518 CEP170Q5SW79 1584 aa28.61■■■□□ 2.17
RNPS1-204ENST00000561518 GOLGA3Q08378 1498 aa28.6■■■□□ 2.17
RNPS1-204ENST00000561518 NUP160Q12769 1436 aa28.59■■■□□ 2.17
RNPS1-204ENST00000561518 OSCARQ8IYS5 282 aa28.57■■■□□ 2.16
RNPS1-204ENST00000561518 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms