RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464987.5

TSPAN4-210, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 5

Gene TSPAN4, Length 2,205 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-210ENST00000464987 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.82■■■■□ 3.97
TSPAN4-210ENST00000464987 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.05■■■■□ 3.04
TSPAN4-210ENST00000464987 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.69■■■□□ 2.98
TSPAN4-210ENST00000464987 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.63■■■□□ 2.97
TSPAN4-210ENST00000464987 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.02■■■□□ 2.88
TSPAN4-210ENST00000464987 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.85■■■□□ 2.85
TSPAN4-210ENST00000464987 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.66■■■□□ 2.82
TSPAN4-210ENST00000464987 SCRIBQ14160 1630 aa31.85■■■□□ 2.69
TSPAN4-210ENST00000464987 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.83■■■□□ 2.69
TSPAN4-210ENST00000464987 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.81■■■□□ 2.68
TSPAN4-210ENST00000464987 ABCC9O60706 1549 aa31.75■■■□□ 2.67
TSPAN4-210ENST00000464987 NACADO15069 1562 aa31.5■■■□□ 2.63
TSPAN4-210ENST00000464987 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
TSPAN4-210ENST00000464987 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.1■■■□□ 2.57
TSPAN4-210ENST00000464987 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.06■■■□□ 2.56
TSPAN4-210ENST00000464987 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.96■■■□□ 2.55
TSPAN4-210ENST00000464987 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.87■■■□□ 2.53
TSPAN4-210ENST00000464987 WIZO95785 1651 aa30.83■■■□□ 2.53
TSPAN4-210ENST00000464987 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.77■■■□□ 2.52
TSPAN4-210ENST00000464987 TRIM41Q8WV44 630 aa30.6■■■□□ 2.49
TSPAN4-210ENST00000464987 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
TSPAN4-210ENST00000464987 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.47■■■□□ 2.47
TSPAN4-210ENST00000464987 SMARCA4P51532 1647 aa30.43■■■□□ 2.46
TSPAN4-210ENST00000464987 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
TSPAN4-210ENST00000464987 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.3■■■□□ 2.44
TSPAN4-210ENST00000464987 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
TSPAN4-210ENST00000464987 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.28■■■□□ 2.445e-10■■■□□ 17.3
TSPAN4-210ENST00000464987 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
TSPAN4-210ENST00000464987 HRCP23327 699 aa30.24■■■□□ 2.43
TSPAN4-210ENST00000464987 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.14■■■□□ 2.42
TSPAN4-210ENST00000464987 SMARCA2P51531 1590 aa30.13■■■□□ 2.41
TSPAN4-210ENST00000464987 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.13■■■□□ 2.41
TSPAN4-210ENST00000464987 ABCC8Q09428 1581 aa30■■■□□ 2.39
TSPAN4-210ENST00000464987 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
TSPAN4-210ENST00000464987 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.85■■■□□ 2.37
TSPAN4-210ENST00000464987 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
TSPAN4-210ENST00000464987 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.68■■■□□ 2.34
TSPAN4-210ENST00000464987 SOGA1O94964 1423 aa29.61■■■□□ 2.33
TSPAN4-210ENST00000464987 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
TSPAN4-210ENST00000464987 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.52■■■□□ 2.32
TSPAN4-210ENST00000464987 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.46■■■□□ 2.31
TSPAN4-210ENST00000464987 SYNJ1O43426 1573 aa29.41■■■□□ 2.3
TSPAN4-210ENST00000464987 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.35■■■□□ 2.29
TSPAN4-210ENST00000464987 EEA1Q15075 1411 aa29.33■■■□□ 2.29
TSPAN4-210ENST00000464987 CEP162Q5TB80 1403 aa29.3■■■□□ 2.28
TSPAN4-210ENST00000464987 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.26■■■□□ 2.27
TSPAN4-210ENST00000464987 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
TSPAN4-210ENST00000464987 GOLGA3Q08378 1498 aa29.16■■■□□ 2.26
TSPAN4-210ENST00000464987 NCAPD3P42695 1498 aa29.14■■■□□ 2.25
TSPAN4-210ENST00000464987 HMGXB3Q12766 1538 aa29.13■■■□□ 2.25
TSPAN4-210ENST00000464987 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
TSPAN4-210ENST00000464987 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
TSPAN4-210ENST00000464987 TOP2BQ02880 1626 aa29.05■■■□□ 2.24
TSPAN4-210ENST00000464987 KIF21BO75037 1637 aa29.04■■■□□ 2.24
TSPAN4-210ENST00000464987 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.02■■■□□ 2.24
TSPAN4-210ENST00000464987 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.98■■■□□ 2.23
TSPAN4-210ENST00000464987 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.91■■■□□ 2.22
TSPAN4-210ENST00000464987 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
TSPAN4-210ENST00000464987 CUX1P39880 1505 aa28.85■■■□□ 2.21
TSPAN4-210ENST00000464987 CFTRP13569 1480 aa28.83■■■□□ 2.21
TSPAN4-210ENST00000464987 CLIP1P30622 1438 aa28.8■■■□□ 2.2
TSPAN4-210ENST00000464987 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.78■■■□□ 2.2
TSPAN4-210ENST00000464987 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
TSPAN4-210ENST00000464987 PRDM2Q13029 1718 aa28.71■■■□□ 2.19
TSPAN4-210ENST00000464987 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.19
TSPAN4-210ENST00000464987 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.65■■■□□ 2.18
TSPAN4-210ENST00000464987 PRXQ9BXM0 1461 aa28.65■■■□□ 2.18
TSPAN4-210ENST00000464987 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.64■■■□□ 2.18
TSPAN4-210ENST00000464987 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.61■■■□□ 2.17
TSPAN4-210ENST00000464987 KIF27Q86VH2 1401 aa28.55■■■□□ 2.16
TSPAN4-210ENST00000464987 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.54■■■□□ 2.16
TSPAN4-210ENST00000464987 ARAP1Q96P48 1450 aa28.44■■■□□ 2.14
TSPAN4-210ENST00000464987 APLP2Q06481 763 aa28.41■■■□□ 2.14
TSPAN4-210ENST00000464987 CUX2O14529 1486 aa28.38■■■□□ 2.13
TSPAN4-210ENST00000464987 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
TSPAN4-210ENST00000464987 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.36■■■□□ 2.13
TSPAN4-210ENST00000464987 IGF1RP08069 1367 aa28.3■■■□□ 2.12
TSPAN4-210ENST00000464987 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.29■■■□□ 2.12
TSPAN4-210ENST00000464987 NESP48681 1621 aa28.25■■■□□ 2.11
TSPAN4-210ENST00000464987 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.24■■■□□ 2.11
TSPAN4-210ENST00000464987 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
TSPAN4-210ENST00000464987 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.16■■■□□ 2.1
TSPAN4-210ENST00000464987 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.13■■■□□ 2.09
TSPAN4-210ENST00000464987 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.13■■■□□ 2.09
TSPAN4-210ENST00000464987 TOPBP1Q92547 1522 aa28.09■■■□□ 2.09
TSPAN4-210ENST00000464987 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
TSPAN4-210ENST00000464987 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.01■■■□□ 2.07
TSPAN4-210ENST00000464987 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
TSPAN4-210ENST00000464987 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.97■■■□□ 2.07
TSPAN4-210ENST00000464987 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
TSPAN4-210ENST00000464987 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
TSPAN4-210ENST00000464987 TIAM1Q13009 1591 aa27.88■■■□□ 2.05
TSPAN4-210ENST00000464987 P3H3Q8IVL6 736 aa27.88■■■□□ 2.05
TSPAN4-210ENST00000464987 WDR97A6NE52 1622 aa27.87■■■□□ 2.05
TSPAN4-210ENST00000464987 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
TSPAN4-210ENST00000464987 CUL7Q14999 1698 aa27.83■■■□□ 2.05
TSPAN4-210ENST00000464987 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.83■■■□□ 2.05
TSPAN4-210ENST00000464987 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.82■■■□□ 2.04
TSPAN4-210ENST00000464987 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
TSPAN4-210ENST00000464987 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms