RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591622.1

CIRBP-233, Transcript of cold inducible RNA binding protein, human

TSL 4

Gene CIRBP, Length 548 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIRBP-233	ENST00000591622	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		40.07	■■■■■ 4.01
CIRBP-233	ENST00000591622	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		35.65	■■■■□ 3.3
CIRBP-233	ENST00000591622	ABCC9	O60706	1549 aa		35.06	■■■■□ 3.2
CIRBP-233	ENST00000591622	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		33.65	■■■□□ 2.98
CIRBP-233	ENST00000591622	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		33.58	■■■□□ 2.97
CIRBP-233	ENST00000591622	NACAD	O15069	1562 aa		33.58	■■■□□ 2.97
CIRBP-233	ENST00000591622	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		33.35	■■■□□ 2.93
CIRBP-233	ENST00000591622	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
CIRBP-233	ENST00000591622	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		33.15	■■■□□ 2.9
CIRBP-233	ENST00000591622	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		32.8	■■■□□ 2.84
CIRBP-233	ENST00000591622	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	32.77	■■■□□ 2.84
CIRBP-233	ENST00000591622	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.64	■■■□□ 2.82
CIRBP-233	ENST00000591622	SCRIB	Q14160	1630 aa		32.52	■■■□□ 2.8
CIRBP-233	ENST00000591622	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		32.36	■■■□□ 2.77
CIRBP-233	ENST00000591622	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		32.3	■■■□□ 2.76
CIRBP-233	ENST00000591622	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
CIRBP-233	ENST00000591622	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31.69	■■■□□ 2.66
CIRBP-233	ENST00000591622	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		31.52	■■■□□ 2.64
CIRBP-233	ENST00000591622	SMARCA4	P51532	1647 aa		31.1	■■■□□ 2.57
CIRBP-233	ENST00000591622	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	31.06	■■■□□ 2.56
CIRBP-233	ENST00000591622	NCAPD3	P42695	1498 aa		31.02	■■■□□ 2.56
CIRBP-233	ENST00000591622	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		31.01	■■■□□ 2.55
CIRBP-233	ENST00000591622	SMARCA2	P51531	1590 aa		30.94	■■■□□ 2.54
CIRBP-233	ENST00000591622	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		30.88	■■■□□ 2.53
CIRBP-233	ENST00000591622	HMGXB3	Q12766	1538 aa		30.82	■■■□□ 2.52
CIRBP-233	ENST00000591622	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		30.81	■■■□□ 2.52
CIRBP-233	ENST00000591622	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	30.73	■■■□□ 2.51
CIRBP-233	ENST00000591622	WIZ	O95785	1651 aa		30.51	■■■□□ 2.47
CIRBP-233	ENST00000591622	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	30.49	■■■□□ 2.47
CIRBP-233	ENST00000591622	NES	P48681	1621 aa		30.3	■■■□□ 2.44
CIRBP-233	ENST00000591622	ERCC6	Q03468	1493 aa		30.23	■■■□□ 2.43
CIRBP-233	ENST00000591622	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		30.2	■■■□□ 2.42
CIRBP-233	ENST00000591622	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	30.19	■■■□□ 2.42
CIRBP-233	ENST00000591622	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		30.11	■■■□□ 2.41
CIRBP-233	ENST00000591622	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		30.03	■■■□□ 2.4
CIRBP-233	ENST00000591622	CUX2	O14529	1486 aa		29.97	■■■□□ 2.39
CIRBP-233	ENST00000591622	CFTR	P13569	1480 aa		29.89	■■■□□ 2.38
CIRBP-233	ENST00000591622	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		29.88	■■■□□ 2.37
CIRBP-233	ENST00000591622	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		29.87	■■■□□ 2.37
CIRBP-233	ENST00000591622	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	29.84	■■■□□ 2.37
CIRBP-233	ENST00000591622	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.74	■■■□□ 2.35
CIRBP-233	ENST00000591622	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.72	■■■□□ 2.35
CIRBP-233	ENST00000591622	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.71	■■■□□ 2.35
CIRBP-233	ENST00000591622	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	29.62	■■■□□ 2.33
CIRBP-233	ENST00000591622	WDR62	O43379	1518 aa		29.61	■■■□□ 2.33
CIRBP-233	ENST00000591622	PRDM2	Q13029	1718 aa		29.54	■■■□□ 2.32
CIRBP-233	ENST00000591622	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.45	■■■□□ 2.31
CIRBP-233	ENST00000591622	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		29.41	■■■□□ 2.3
CIRBP-233	ENST00000591622	ABCC8	Q09428	1581 aa		29.25	■■■□□ 2.27
CIRBP-233	ENST00000591622	TOPBP1	Q92547	1522 aa		29.25	■■■□□ 2.27
CIRBP-233	ENST00000591622	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		29.19	■■■□□ 2.26
CIRBP-233	ENST00000591622	IFT140	Q96RY7	1462 aa		29.1	■■■□□ 2.25
CIRBP-233	ENST00000591622	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
CIRBP-233	ENST00000591622	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
CIRBP-233	ENST00000591622	CUX1	P39880	1505 aa		28.97	■■■□□ 2.23
CIRBP-233	ENST00000591622	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
CIRBP-233	ENST00000591622	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		28.91	■■■□□ 2.22
CIRBP-233	ENST00000591622	SOGA1	O94964	1423 aa		28.89	■■■□□ 2.22
CIRBP-233	ENST00000591622	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CIRBP-233	ENST00000591622	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
CIRBP-233	ENST00000591622	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.82	■■■□□ 2.2
CIRBP-233	ENST00000591622	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
CIRBP-233	ENST00000591622	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	28.75	■■■□□ 2.19
CIRBP-233	ENST00000591622	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		28.74	■■■□□ 2.19
CIRBP-233	ENST00000591622	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.69	■■■□□ 2.18
CIRBP-233	ENST00000591622	TOP2B	Q02880	1626 aa		28.67	■■■□□ 2.18
CIRBP-233	ENST00000591622	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.66	■■■□□ 2.18
CIRBP-233	ENST00000591622	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		28.65	■■■□□ 2.18
CIRBP-233	ENST00000591622	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CIRBP-233	ENST00000591622	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.56	■■■□□ 2.16
CIRBP-233	ENST00000591622	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		28.54	■■■□□ 2.16
CIRBP-233	ENST00000591622	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.53	■■■□□ 2.16
CIRBP-233	ENST00000591622	FBLN2	P98095	1184 aa		28.52	■■■□□ 2.16
CIRBP-233	ENST00000591622	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.49	■■■□□ 2.15
CIRBP-233	ENST00000591622	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		28.49	■■■□□ 2.15
CIRBP-233	ENST00000591622	CHD1	O14646	1710 aa		28.46	■■■□□ 2.15
CIRBP-233	ENST00000591622	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.42	■■■□□ 2.14
CIRBP-233	ENST00000591622	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.42	■■■□□ 2.14
CIRBP-233	ENST00000591622	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.4	■■■□□ 2.14
CIRBP-233	ENST00000591622	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		28.27	■■■□□ 2.12
CIRBP-233	ENST00000591622	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.23	■■■□□ 2.11
CIRBP-233	ENST00000591622	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		28.23	■■■□□ 2.11
CIRBP-233	ENST00000591622	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		28.23	■■■□□ 2.11
CIRBP-233	ENST00000591622	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		28.23	■■■□□ 2.11
CIRBP-233	ENST00000591622	ADAMTS12	P58397	1594 aa		28.23	■■■□□ 2.11
CIRBP-233	ENST00000591622	TRIM41	Q8WV44	630 aa		28.22	■■■□□ 2.11
CIRBP-233	ENST00000591622	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		28.21	■■■□□ 2.11
CIRBP-233	ENST00000591622	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.21	■■■□□ 2.11
CIRBP-233	ENST00000591622	GRIN2A	Q12879	1464 aa		28.19	■■■□□ 2.1
CIRBP-233	ENST00000591622	KIF27	Q86VH2	1401 aa		28.17	■■■□□ 2.1
CIRBP-233	ENST00000591622	IGF1R	P08069	1367 aa		28.09	■■■□□ 2.09
CIRBP-233	ENST00000591622	NUP160	Q12769	1436 aa		28.07	■■■□□ 2.08
CIRBP-233	ENST00000591622	CEP170	Q5SW79	1584 aa		28.03	■■■□□ 2.08
CIRBP-233	ENST00000591622	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		28.02	■■■□□ 2.08
CIRBP-233	ENST00000591622	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28	■■■□□ 2.07
CIRBP-233	ENST00000591622	CUL7	Q14999	1698 aa		27.95	■■■□□ 2.07
CIRBP-233	ENST00000591622	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CIRBP-233	ENST00000591622	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CIRBP-233	ENST00000591622	SHROOM2	Q13796	1616 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CIRBP-233	ENST00000591622	JPH4	Q96JJ6	628 aa		27.81	■■■□□ 2.04

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