Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
C4BP0C0L5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
C4BP0C0L5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
C4BP0C0L5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
C4BP0C0L5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
C4BP0C0L5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
C4BP0C0L5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
C4BP0C0L5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
C4BP0C0L5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
C4BP0C0L5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
C4BP0C0L5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
C4BP0C0L5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
C4BP0C0L5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
C4BP0C0L5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
C4BP0C0L5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
C4BP0C0L5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
C4BP0C0L5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
C4BP0C0L5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
C4BP0C0L5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
C4BP0C0L5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
C4BP0C0L5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
C4BP0C0L5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
C4BP0C0L5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
C4BP0C0L5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
C4BP0C0L5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
C4BP0C0L5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
C4BP0C0L5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
C4BP0C0L5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
C4BP0C0L5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
C4BP0C0L5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
C4BP0C0L5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
C4BP0C0L5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
C4BP0C0L5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
C4BP0C0L5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
C4BP0C0L5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
C4BP0C0L5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
C4BP0C0L5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
C4BP0C0L5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
C4BP0C0L5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
C4BP0C0L5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
C4BP0C0L5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms