Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC44.62■■■■■ 4.73
C4BP0C0L5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC44.45■■■■■ 4.71
C4BP0C0L5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.92■■■■■ 4.62
C4BP0C0L5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
C4BP0C0L5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
C4BP0C0L5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.84■■■■■ 4.45
C4BP0C0L5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
C4BP0C0L5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
C4BP0C0L5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC42.46■■■■■ 4.39
C4BP0C0L5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
C4BP0C0L5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
C4BP0C0L5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC42.25■■■■■ 4.35
C4BP0C0L5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
C4BP0C0L5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
C4BP0C0L5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
C4BP0C0L5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
C4BP0C0L5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.27
C4BP0C0L5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
C4BP0C0L5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
C4BP0C0L5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
C4BP0C0L5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
C4BP0C0L5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
C4BP0C0L5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.17
C4BP0C0L5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
C4BP0C0L5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
C4BP0C0L5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
C4BP0C0L5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
C4BP0C0L5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
C4BP0C0L5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
C4BP0C0L5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
C4BP0C0L5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
C4BP0C0L5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
C4BP0C0L5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
C4BP0C0L5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
C4BP0C0L5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
C4BP0C0L5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
C4BP0C0L5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
C4BP0C0L5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
C4BP0C0L5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
C4BP0C0L5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
C4BP0C0L5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
C4BP0C0L5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
C4BP0C0L5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
C4BP0C0L5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
C4BP0C0L5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
C4BP0C0L5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
C4BP0C0L5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
C4BP0C0L5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
C4BP0C0L5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
C4BP0C0L5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
C4BP0C0L5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
C4BP0C0L5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
C4BP0C0L5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
C4BP0C0L5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
C4BP0C0L5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
C4BP0C0L5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
C4BP0C0L5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
C4BP0C0L5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
C4BP0C0L5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
C4BP0C0L5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
C4BP0C0L5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
C4BP0C0L5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
C4BP0C0L5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
C4BP0C0L5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
C4BP0C0L5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
C4BP0C0L5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
C4BP0C0L5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
C4BP0C0L5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
C4BP0C0L5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
C4BP0C0L5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
C4BP0C0L5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
C4BP0C0L5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
C4BP0C0L5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
C4BP0C0L5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC38.57■■■■□ 3.76
C4BP0C0L5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
C4BP0C0L5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
C4BP0C0L5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
C4BP0C0L5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
C4BP0C0L5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
C4BP0C0L5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
C4BP0C0L5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
C4BP0C0L5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
C4BP0C0L5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
C4BP0C0L5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
C4BP0C0L5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
C4BP0C0L5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
C4BP0C0L5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
C4BP0C0L5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC38.37■■■■□ 3.73
C4BP0C0L5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
C4BP0C0L5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
C4BP0C0L5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
C4BP0C0L5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
C4BP0C0L5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
C4BP0C0L5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
C4BP0C0L5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
C4BP0C0L5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
C4BP0C0L5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
C4BP0C0L5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
C4BP0C0L5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
C4BP0C0L5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms