Protein–RNA interactions for Protein: O00206

TLR4, Toll-like receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR4O00206 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR4O00206 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR4O00206 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR4O00206 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR4O00206 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR4O00206 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR4O00206 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR4O00206 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR4O00206 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR4O00206 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR4O00206 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR4O00206 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR4O00206 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR4O00206 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR4O00206 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR4O00206 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR4O00206 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR4O00206 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR4O00206 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR4O00206 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR4O00206 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR4O00206 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR4O00206 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR4O00206 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR4O00206 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR4O00206 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR4O00206 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR4O00206 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR4O00206 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR4O00206 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR4O00206 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR4O00206 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR4O00206 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR4O00206 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR4O00206 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR4O00206 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TLR4O00206 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR4O00206 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR4O00206 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR4O00206 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR4O00206 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR4O00206 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR4O00206 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR4O00206 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR4O00206 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR4O00206 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR4O00206 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR4O00206 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR4O00206 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR4O00206 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR4O00206 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR4O00206 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR4O00206 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR4O00206 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR4O00206 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR4O00206 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR4O00206 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR4O00206 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR4O00206 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR4O00206 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR4O00206 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR4O00206 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR4O00206 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR4O00206 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR4O00206 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR4O00206 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR4O00206 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR4O00206 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR4O00206 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR4O00206 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR4O00206 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR4O00206 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR4O00206 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR4O00206 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR4O00206 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR4O00206 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR4O00206 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR4O00206 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR4O00206 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR4O00206 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR4O00206 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR4O00206 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TLR4O00206 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR4O00206 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR4O00206 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR4O00206 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR4O00206 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR4O00206 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR4O00206 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR4O00206 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR4O00206 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR4O00206 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR4O00206 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR4O00206 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR4O00206 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR4O00206 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR4O00206 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR4O00206 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR4O00206 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR4O00206 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms