RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578845.2

CDKN2A-212, Transcript of cyclin dependent kinase inhibitor 2A, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDKN2A, Length 678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-212ENST00000578845 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.92■■■■■ 6.7
CDKN2A-212ENST00000578845 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.96■■■■■ 5.75
CDKN2A-212ENST00000578845 ABCC9O60706 1549 aa50.49■■■■■ 5.67
CDKN2A-212ENST00000578845 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.3■■■■■ 5.32
CDKN2A-212ENST00000578845 NACADO15069 1562 aa48.09■■■■■ 5.29
CDKN2A-212ENST00000578845 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.65■■■■■ 5.22
CDKN2A-212ENST00000578845 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.64■■■■■ 5.22
CDKN2A-212ENST00000578845 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.28■■■■■ 5.16
CDKN2A-212ENST00000578845 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.16■■■■■ 5.14
CDKN2A-212ENST00000578845 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.13■■■■■ 5.14
CDKN2A-212ENST00000578845 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.05■■■■■ 5.12
CDKN2A-212ENST00000578845 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.01■■■■■ 5.12
CDKN2A-212ENST00000578845 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.9■■■■■ 5.1
CDKN2A-212ENST00000578845 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.42■■■■■ 5.02
CDKN2A-212ENST00000578845 SCRIBQ14160 1630 aa46.34■■■■■ 5.01
CDKN2A-212ENST00000578845 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.71■■■■■ 4.91
CDKN2A-212ENST00000578845 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.67■■■■■ 4.9
CDKN2A-212ENST00000578845 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.49■■■■■ 4.87
CDKN2A-212ENST00000578845 NCAPD3P42695 1498 aa44.4■■■■■ 4.7
CDKN2A-212ENST00000578845 SMARCA4P51532 1647 aa44.32■■■■■ 4.68
CDKN2A-212ENST00000578845 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.28■■■■■ 4.68
CDKN2A-212ENST00000578845 SMARCA2P51531 1590 aa44.18■■■■■ 4.66
CDKN2A-212ENST00000578845 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.17■■■■■ 4.66
CDKN2A-212ENST00000578845 HMGXB3Q12766 1538 aa44.12■■■■■ 4.65
CDKN2A-212ENST00000578845 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.97■■■■■ 4.63
CDKN2A-212ENST00000578845 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.84■■■■■ 4.61
CDKN2A-212ENST00000578845 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.83■■■■■ 4.61
CDKN2A-212ENST00000578845 ERCC6Q03468 1493 aa43.57■■■■■ 4.57
CDKN2A-212ENST00000578845 NESP48681 1621 aa43.48■■■■■ 4.55
CDKN2A-212ENST00000578845 CUX2O14529 1486 aa43.48■■■■■ 4.55
CDKN2A-212ENST00000578845 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.33■■■■■ 4.53
CDKN2A-212ENST00000578845 WIZO95785 1651 aa43.28■■■■■ 4.52
CDKN2A-212ENST00000578845 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
CDKN2A-212ENST00000578845 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.06■■■■■ 4.48
CDKN2A-212ENST00000578845 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.04■■■■■ 4.48
CDKN2A-212ENST00000578845 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.03■■■■■ 4.48
CDKN2A-212ENST00000578845 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.99■■■■■ 4.47
CDKN2A-212ENST00000578845 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.95■■■■■ 4.47
CDKN2A-212ENST00000578845 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.83■■■■■ 4.45
CDKN2A-212ENST00000578845 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.65■■■■■ 4.42
CDKN2A-212ENST00000578845 CFTRP13569 1480 aa42.64■■■■■ 4.42
CDKN2A-212ENST00000578845 WDR62O43379 1518 aa42.56■■■■■ 4.4
CDKN2A-212ENST00000578845 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.54■■■■■ 4.4
CDKN2A-212ENST00000578845 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.52■■■■■ 4.4
CDKN2A-212ENST00000578845 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.3■■■■■ 4.36
CDKN2A-212ENST00000578845 PRDM2Q13029 1718 aa42.2■■■■■ 4.35
CDKN2A-212ENST00000578845 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
CDKN2A-212ENST00000578845 TOPBP1Q92547 1522 aa41.76■■■■■ 4.28
CDKN2A-212ENST00000578845 ABCC8Q09428 1581 aa41.73■■■■■ 4.27
CDKN2A-212ENST00000578845 IFT140Q96RY7 1462 aa41.7■■■■■ 4.27
CDKN2A-212ENST00000578845 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.66■■■■■ 4.26
CDKN2A-212ENST00000578845 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.55■■■■■ 4.24
CDKN2A-212ENST00000578845 OSCARQ8IYS5 282 aa41.45■■■■■ 4.23
CDKN2A-212ENST00000578845 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
CDKN2A-212ENST00000578845 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
CDKN2A-212ENST00000578845 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
CDKN2A-212ENST00000578845 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.24■■■■■ 4.19
CDKN2A-212ENST00000578845 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.2■■■■■ 4.19
CDKN2A-212ENST00000578845 CUX1P39880 1505 aa41.17■■■■■ 4.18
CDKN2A-212ENST00000578845 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.15■■■■■ 4.18
CDKN2A-212ENST00000578845 SOGA1O94964 1423 aa41.14■■■■■ 4.18
CDKN2A-212ENST00000578845 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.13■■■■■ 4.17
CDKN2A-212ENST00000578845 TRIM41Q8WV44 630 aa41.12■■■■■ 4.17
CDKN2A-212ENST00000578845 WDR97A6NE52 1622 aa41.06■■■■■ 4.16
CDKN2A-212ENST00000578845 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
CDKN2A-212ENST00000578845 CHD1O14646 1710 aa40.94■■■■■ 4.14
CDKN2A-212ENST00000578845 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.91■■■■■ 4.14
CDKN2A-212ENST00000578845 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.91■■■■■ 4.14
CDKN2A-212ENST00000578845 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.91■■■■■ 4.14
CDKN2A-212ENST00000578845 ARHGEF11O15085 1522 aa40.84■■■■■ 4.13
CDKN2A-212ENST00000578845 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.82■■■■■ 4.12
CDKN2A-212ENST00000578845 GRIN2BQ13224 1484 aa40.78■■■■■ 4.12
CDKN2A-212ENST00000578845 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
CDKN2A-212ENST00000578845 FBLN2P98095 1184 aa40.76■■■■■ 4.12
CDKN2A-212ENST00000578845 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.74■■■■■ 4.11
CDKN2A-212ENST00000578845 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.66■■■■■ 4.1
CDKN2A-212ENST00000578845 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.64■■■■■ 4.1
CDKN2A-212ENST00000578845 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.63■■■■■ 4.09
CDKN2A-212ENST00000578845 TOP2BQ02880 1626 aa40.62■■■■■ 4.09
CDKN2A-212ENST00000578845 SYNJ2O15056 1496 aa40.62■■■■■ 4.09
CDKN2A-212ENST00000578845 PBRM1Q86U86 1689 aa40.61■■■■■ 4.09
CDKN2A-212ENST00000578845 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.6■■■■■ 4.09
CDKN2A-212ENST00000578845 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
CDKN2A-212ENST00000578845 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.57■■■■■ 4.09
CDKN2A-212ENST00000578845 SYNJ1O43426 1573 aa40.55■■■■■ 4.08
CDKN2A-212ENST00000578845 ARAP1Q96P48 1450 aa40.47■■■■■ 4.07
CDKN2A-212ENST00000578845 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.41■■■■■ 4.06
CDKN2A-212ENST00000578845 ADAMTS12P58397 1594 aa40.3■■■■■ 4.04
CDKN2A-212ENST00000578845 GRIN2AQ12879 1464 aa40.26■■■■■ 4.04
CDKN2A-212ENST00000578845 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.24■■■■■ 4.03
CDKN2A-212ENST00000578845 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.19■■■■■ 4.02
CDKN2A-212ENST00000578845 NUP160Q12769 1436 aa40.16■■■■■ 4.02
CDKN2A-212ENST00000578845 CEP170Q5SW79 1584 aa40.09■■■■■ 4.01
CDKN2A-212ENST00000578845 SHROOM2Q13796 1616 aa39.94■■■■□ 3.98
CDKN2A-212ENST00000578845 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.89■■■■□ 3.98
CDKN2A-212ENST00000578845 KIF27Q86VH2 1401 aa39.82■■■■□ 3.96
CDKN2A-212ENST00000578845 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.8■■■■□ 3.96
CDKN2A-212ENST00000578845 IGF1RP08069 1367 aa39.77■■■■□ 3.96
CDKN2A-212ENST00000578845 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.73■■■■□ 3.95
CDKN2A-212ENST00000578845 CUL7Q14999 1698 aa39.7■■■■□ 3.95
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