RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628077.2

DNAJC4-212, Transcript of DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene DNAJC4, Length 938 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4-212ENST00000628077 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.4■■■■■ 6.78
DNAJC4-212ENST00000628077 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.51■■■■■ 5.84
DNAJC4-212ENST00000628077 ABCC9O60706 1549 aa51.07■■■■■ 5.77
DNAJC4-212ENST00000628077 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.83■■■■■ 5.41
DNAJC4-212ENST00000628077 NACADO15069 1562 aa48.59■■■■■ 5.37
DNAJC4-212ENST00000628077 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.08■■■■■ 5.29
DNAJC4-212ENST00000628077 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.03■■■■■ 5.28
DNAJC4-212ENST00000628077 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.81■■■■■ 5.24
DNAJC4-212ENST00000628077 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.7■■■■■ 5.23
DNAJC4-212ENST00000628077 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.65■■■■■ 5.22
DNAJC4-212ENST00000628077 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.53■■■■■ 5.2
DNAJC4-212ENST00000628077 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.5■■■■■ 5.19
DNAJC4-212ENST00000628077 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.45■■■■■ 5.19
DNAJC4-212ENST00000628077 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.9■■■■■ 5.1
DNAJC4-212ENST00000628077 SCRIBQ14160 1630 aa46.79■■■■■ 5.08
DNAJC4-212ENST00000628077 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.24■■■■■ 4.99
DNAJC4-212ENST00000628077 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.22■■■■■ 4.99
DNAJC4-212ENST00000628077 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.02■■■■■ 4.96
DNAJC4-212ENST00000628077 NCAPD3P42695 1498 aa44.84■■■■■ 4.77
DNAJC4-212ENST00000628077 SMARCA4P51532 1647 aa44.75■■■■■ 4.75
DNAJC4-212ENST00000628077 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.7■■■■■ 4.75
DNAJC4-212ENST00000628077 SMARCA2P51531 1590 aa44.61■■■■■ 4.73
DNAJC4-212ENST00000628077 HMGXB3Q12766 1538 aa44.56■■■■■ 4.72
DNAJC4-212ENST00000628077 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.54■■■■■ 4.72
DNAJC4-212ENST00000628077 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.39■■■■■ 4.7
DNAJC4-212ENST00000628077 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.24■■■■■ 4.67
DNAJC4-212ENST00000628077 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.2■■■■■ 4.67
DNAJC4-212ENST00000628077 ERCC6Q03468 1493 aa44.06■■■■■ 4.64
DNAJC4-212ENST00000628077 CUX2O14529 1486 aa44.03■■■■■ 4.64
DNAJC4-212ENST00000628077 NESP48681 1621 aa43.97■■■■■ 4.63
DNAJC4-212ENST00000628077 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.8■■■■■ 4.6
DNAJC4-212ENST00000628077 WIZO95785 1651 aa43.68■■■■■ 4.58
DNAJC4-212ENST00000628077 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.67■■■■■ 4.58
DNAJC4-212ENST00000628077 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.58■■■■■ 4.57
DNAJC4-212ENST00000628077 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.49■■■■■ 4.55
DNAJC4-212ENST00000628077 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.46■■■■■ 4.55
DNAJC4-212ENST00000628077 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.42■■■■■ 4.54
DNAJC4-212ENST00000628077 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.36■■■■■ 4.53
DNAJC4-212ENST00000628077 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.17■■■■■ 4.5
DNAJC4-212ENST00000628077 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.1■■■■■ 4.49
DNAJC4-212ENST00000628077 WDR62O43379 1518 aa43.04■■■■■ 4.48
DNAJC4-212ENST00000628077 CFTRP13569 1480 aa43.03■■■■■ 4.48
DNAJC4-212ENST00000628077 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.95■■■■■ 4.47
DNAJC4-212ENST00000628077 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.93■■■■■ 4.46
DNAJC4-212ENST00000628077 PRDM2Q13029 1718 aa42.72■■■■■ 4.43
DNAJC4-212ENST00000628077 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.63■■■■■ 4.42
DNAJC4-212ENST00000628077 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.58■■■■■ 4.41
DNAJC4-212ENST00000628077 TOPBP1Q92547 1522 aa42.16■■■■■ 4.34
DNAJC4-212ENST00000628077 ABCC8Q09428 1581 aa42.12■■■■■ 4.33
DNAJC4-212ENST00000628077 IFT140Q96RY7 1462 aa42.11■■■■■ 4.33
DNAJC4-212ENST00000628077 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.05■■■■■ 4.32
DNAJC4-212ENST00000628077 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.99■■■■■ 4.31
DNAJC4-212ENST00000628077 OSCARQ8IYS5 282 aa41.94■■■■■ 4.3
DNAJC4-212ENST00000628077 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
DNAJC4-212ENST00000628077 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
DNAJC4-212ENST00000628077 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.74■■■■■ 4.27
DNAJC4-212ENST00000628077 TRIM41Q8WV44 630 aa41.68■■■■■ 4.26
DNAJC4-212ENST00000628077 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.6■■■■■ 4.258e-7■■■■□ 23.9
DNAJC4-212ENST00000628077 CUX1P39880 1505 aa41.53■■■■■ 4.24
DNAJC4-212ENST00000628077 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.53■■■■■ 4.24
DNAJC4-212ENST00000628077 SOGA1O94964 1423 aa41.5■■■■■ 4.23
DNAJC4-212ENST00000628077 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.49■■■■■ 4.23
DNAJC4-212ENST00000628077 CHD1O14646 1710 aa41.48■■■■■ 4.23
DNAJC4-212ENST00000628077 WDR97A6NE52 1622 aa41.47■■■■■ 4.23
DNAJC4-212ENST00000628077 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.47■■■■■ 4.23
DNAJC4-212ENST00000628077 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.47■■■■■ 4.23
DNAJC4-212ENST00000628077 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.47■■■■■ 4.23
DNAJC4-212ENST00000628077 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
DNAJC4-212ENST00000628077 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.36■■■■■ 4.21
DNAJC4-212ENST00000628077 ARHGEF11O15085 1522 aa41.35■■■■■ 4.21
DNAJC4-212ENST00000628077 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.21■■■■■ 4.19
DNAJC4-212ENST00000628077 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
DNAJC4-212ENST00000628077 GRIN2BQ13224 1484 aa41.16■■■■■ 4.18
DNAJC4-212ENST00000628077 FBLN2P98095 1184 aa41.14■■■■■ 4.18
DNAJC4-212ENST00000628077 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.09■■■■■ 4.17
DNAJC4-212ENST00000628077 PBRM1Q86U86 1689 aa41.07■■■■■ 4.16
DNAJC4-212ENST00000628077 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.04■■■■■ 4.16
DNAJC4-212ENST00000628077 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.03■■■■■ 4.16
DNAJC4-212ENST00000628077 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.03■■■■■ 4.16
DNAJC4-212ENST00000628077 SYNJ2O15056 1496 aa41.02■■■■■ 4.16
DNAJC4-212ENST00000628077 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.99■■■■■ 4.15
DNAJC4-212ENST00000628077 SYNJ1O43426 1573 aa40.98■■■■■ 4.15
DNAJC4-212ENST00000628077 TOP2BQ02880 1626 aa40.96■■■■■ 4.15
DNAJC4-212ENST00000628077 ARAP1Q96P48 1450 aa40.96■■■■■ 4.15
DNAJC4-212ENST00000628077 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.95■■■■■ 4.15
DNAJC4-212ENST00000628077 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.91■■■■■ 4.14
DNAJC4-212ENST00000628077 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.88■■■■■ 4.13
DNAJC4-212ENST00000628077 ADAMTS12P58397 1594 aa40.69■■■■■ 4.1
DNAJC4-212ENST00000628077 GRIN2AQ12879 1464 aa40.64■■■■■ 4.1
DNAJC4-212ENST00000628077 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.59■■■■■ 4.09
DNAJC4-212ENST00000628077 NUP160Q12769 1436 aa40.54■■■■■ 4.08
DNAJC4-212ENST00000628077 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.53■■■■■ 4.08
DNAJC4-212ENST00000628077 CEP170Q5SW79 1584 aa40.5■■■■■ 4.07
DNAJC4-212ENST00000628077 SHROOM2Q13796 1616 aa40.39■■■■■ 4.06
DNAJC4-212ENST00000628077 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.34■■■■■ 4.05
DNAJC4-212ENST00000628077 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
DNAJC4-212ENST00000628077 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.11■■■■■ 4.01
DNAJC4-212ENST00000628077 KIF27Q86VH2 1401 aa40.08■■■■■ 4.01
DNAJC4-212ENST00000628077 IGF1RP08069 1367 aa40.06■■■■■ 4
DNAJC4-212ENST00000628077 CUL7Q14999 1698 aa40.05■■■■■ 4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms