RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620978.1

GDF6-202, Transcript of growth differentiation factor 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GDF6, Length 973 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6-202ENST00000620978 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.42■■■■■ 6.62
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GDF6-202ENST00000620978 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.45■■■■■ 5.19
GDF6-202ENST00000620978 NACADO15069 1562 aa47.34■■■■■ 5.17
GDF6-202ENST00000620978 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.27■■■■■ 5.16
GDF6-202ENST00000620978 MYO15BQ96JP2 1530 aa47■■■■■ 5.11
GDF6-202ENST00000620978 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.92■■■■■ 5.1
GDF6-202ENST00000620978 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.69■■■■■ 5.06
GDF6-202ENST00000620978 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.29■■■■■ 5
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GDF6-202ENST00000620978 SCRIBQ14160 1630 aa45.8■■■■■ 4.92
GDF6-202ENST00000620978 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.64■■■■■ 4.9
GDF6-202ENST00000620978 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.55■■■■■ 4.88
GDF6-202ENST00000620978 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.82■■■■■ 4.76
GDF6-202ENST00000620978 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.69■■■■■ 4.74
GDF6-202ENST00000620978 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.47■■■■■ 4.71
GDF6-202ENST00000620978 SMARCA4P51532 1647 aa43.81■■■■■ 4.6
GDF6-202ENST00000620978 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.75■■■■■ 4.59
GDF6-202ENST00000620978 NCAPD3P42695 1498 aa43.7■■■■■ 4.59
GDF6-202ENST00000620978 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.67■■■■■ 4.58
GDF6-202ENST00000620978 SMARCA2P51531 1590 aa43.6■■■■■ 4.57
GDF6-202ENST00000620978 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.46■■■■■ 4.55
GDF6-202ENST00000620978 HMGXB3Q12766 1538 aa43.43■■■■■ 4.54
GDF6-202ENST00000620978 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.41■■■■■ 4.54
GDF6-202ENST00000620978 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.28■■■■■ 4.52
GDF6-202ENST00000620978 WIZO95785 1651 aa42.95■■■■■ 4.47
GDF6-202ENST00000620978 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.88■■■■■ 4.46
GDF6-202ENST00000620978 NESP48681 1621 aa42.68■■■■■ 4.42
GDF6-202ENST00000620978 ERCC6Q03468 1493 aa42.64■■■■■ 4.42
GDF6-202ENST00000620978 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.57■■■■■ 4.41
GDF6-202ENST00000620978 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.5■■■■■ 4.39
GDF6-202ENST00000620978 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.42■■■■■ 4.38
GDF6-202ENST00000620978 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.33■■■■■ 4.37
GDF6-202ENST00000620978 CUX2O14529 1486 aa42.3■■■■■ 4.36
GDF6-202ENST00000620978 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.14■■■■■ 4.34
GDF6-202ENST00000620978 CFTRP13569 1480 aa42.11■■■■■ 4.33
GDF6-202ENST00000620978 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.08■■■■■ 4.33
GDF6-202ENST00000620978 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.02■■■■■ 4.32
GDF6-202ENST00000620978 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.91■■■■■ 4.3
GDF6-202ENST00000620978 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.87■■■■■ 4.29
GDF6-202ENST00000620978 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.87■■■■■ 4.29
GDF6-202ENST00000620978 WDR62O43379 1518 aa41.74■■■■■ 4.27
GDF6-202ENST00000620978 PRDM2Q13029 1718 aa41.67■■■■■ 4.26
GDF6-202ENST00000620978 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
GDF6-202ENST00000620978 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
GDF6-202ENST00000620978 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.36■■■■■ 4.21
GDF6-202ENST00000620978 ABCC8Q09428 1581 aa41.23■■■■■ 4.19
GDF6-202ENST00000620978 TOPBP1Q92547 1522 aa41.2■■■■■ 4.19
GDF6-202ENST00000620978 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.12■■■■■ 4.17
GDF6-202ENST00000620978 IFT140Q96RY7 1462 aa41.02■■■■■ 4.16
GDF6-202ENST00000620978 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
GDF6-202ENST00000620978 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
GDF6-202ENST00000620978 CUX1P39880 1505 aa40.77■■■■■ 4.12
GDF6-202ENST00000620978 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
GDF6-202ENST00000620978 SOGA1O94964 1423 aa40.69■■■■■ 4.1
GDF6-202ENST00000620978 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.69■■■■■ 4.1
GDF6-202ENST00000620978 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.65■■■■■ 4.1
GDF6-202ENST00000620978 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
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GDF6-202ENST00000620978 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.48■■■■■ 4.07
GDF6-202ENST00000620978 WDR97A6NE52 1622 aa40.45■■■■■ 4.07
GDF6-202ENST00000620978 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.44■■■■■ 4.06
GDF6-202ENST00000620978 TOP2BQ02880 1626 aa40.36■■■■■ 4.05
GDF6-202ENST00000620978 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.34■■■■■ 4.05
GDF6-202ENST00000620978 SYNJ1O43426 1573 aa40.31■■■■■ 4.04
GDF6-202ENST00000620978 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.31■■■■■ 4.04
GDF6-202ENST00000620978 GRIN2BQ13224 1484 aa40.24■■■■■ 4.03
GDF6-202ENST00000620978 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.2■■■■■ 4.03
GDF6-202ENST00000620978 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.19■■■■■ 4.02
GDF6-202ENST00000620978 FBLN2P98095 1184 aa40.17■■■■■ 4.02
GDF6-202ENST00000620978 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
GDF6-202ENST00000620978 CHD1O14646 1710 aa40.16■■■■■ 4.02
GDF6-202ENST00000620978 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.13■■■■■ 4.01
GDF6-202ENST00000620978 PBRM1Q86U86 1689 aa40.06■■■■■ 4
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GDF6-202ENST00000620978 SYNJ2O15056 1496 aa40■■■■□ 3.99
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GDF6-202ENST00000620978 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.84■■■■□ 3.97
GDF6-202ENST00000620978 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.84■■■■□ 3.97
GDF6-202ENST00000620978 TRIM41Q8WV44 630 aa39.84■■■■□ 3.97
GDF6-202ENST00000620978 ARHGEF11O15085 1522 aa39.83■■■■□ 3.97
GDF6-202ENST00000620978 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.81■■■■□ 3.96
GDF6-202ENST00000620978 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.76■■■■□ 3.96
GDF6-202ENST00000620978 ADAMTS12P58397 1594 aa39.76■■■■□ 3.95
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GDF6-202ENST00000620978 CEP170Q5SW79 1584 aa39.49■■■■□ 3.91
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GDF6-202ENST00000620978 SHROOM2Q13796 1616 aa39.25■■■■□ 3.87
GDF6-202ENST00000620978 JPH4Q96JJ6 628 aa39.19■■■■□ 3.86
GDF6-202ENST00000620978 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.18■■■■□ 3.86
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