RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370882.1

LRRC1-201, Transcript of leucine rich repeat containing 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LRRC1, Length 808 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC1-201ENST00000370882 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.09■■■■■ 6.57
LRRC1-201ENST00000370882 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.84■■■■■ 5.57
LRRC1-201ENST00000370882 ABCC9O60706 1549 aa48.61■■■■■ 5.37
LRRC1-201ENST00000370882 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.88■■■■■ 5.1
LRRC1-201ENST00000370882 NACADO15069 1562 aa46.87■■■■■ 5.09
LRRC1-201ENST00000370882 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.8■■■■■ 5.08
LRRC1-201ENST00000370882 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.75■■■■■ 5.07
LRRC1-201ENST00000370882 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.67■■■■■ 5.06
LRRC1-201ENST00000370882 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.49■■■■■ 5.03
LRRC1-201ENST00000370882 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.66■■■■■ 4.9
LRRC1-201ENST00000370882 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.43■■■■■ 4.86
LRRC1-201ENST00000370882 SCRIBQ14160 1630 aa45.41■■■■■ 4.86
LRRC1-201ENST00000370882 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.37■■■■■ 4.85
LRRC1-201ENST00000370882 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.09■■■■■ 4.81
LRRC1-201ENST00000370882 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.46■■■■■ 4.71
LRRC1-201ENST00000370882 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.22■■■■■ 4.67
LRRC1-201ENST00000370882 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.98■■■■■ 4.63
LRRC1-201ENST00000370882 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.71■■■■■ 4.59
LRRC1-201ENST00000370882 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.51■■■■■ 4.56
LRRC1-201ENST00000370882 SMARCA4P51532 1647 aa43.48■■■■■ 4.55
LRRC1-201ENST00000370882 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.25■■■■■ 4.51
LRRC1-201ENST00000370882 SMARCA2P51531 1590 aa43.24■■■■■ 4.51
LRRC1-201ENST00000370882 NCAPD3P42695 1498 aa43.24■■■■■ 4.51
LRRC1-201ENST00000370882 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.18■■■■■ 4.5
LRRC1-201ENST00000370882 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.11■■■■■ 4.49
LRRC1-201ENST00000370882 HMGXB3Q12766 1538 aa43.04■■■■■ 4.48
LRRC1-201ENST00000370882 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.92■■■■■ 4.46
LRRC1-201ENST00000370882 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.77■■■■■ 4.44
LRRC1-201ENST00000370882 WIZO95785 1651 aa42.69■■■■■ 4.42
LRRC1-201ENST00000370882 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.33■■■■■ 4.37
LRRC1-201ENST00000370882 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.08■■■■■ 4.33
LRRC1-201ENST00000370882 NESP48681 1621 aa42.06■■■■■ 4.32
LRRC1-201ENST00000370882 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.99■■■■■ 4.31
LRRC1-201ENST00000370882 ERCC6Q03468 1493 aa41.97■■■■■ 4.31
LRRC1-201ENST00000370882 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.83■■■■■ 4.29
LRRC1-201ENST00000370882 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.81■■■■■ 4.28
LRRC1-201ENST00000370882 CFTRP13569 1480 aa41.75■■■■■ 4.27
LRRC1-201ENST00000370882 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.74■■■■■ 4.27
LRRC1-201ENST00000370882 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.56■■■■■ 4.24
LRRC1-201ENST00000370882 CUX2O14529 1486 aa41.5■■■■■ 4.23
LRRC1-201ENST00000370882 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.48■■■■■ 4.23
LRRC1-201ENST00000370882 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.43■■■■■ 4.22
LRRC1-201ENST00000370882 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.43■■■■■ 4.22
LRRC1-201ENST00000370882 PRDM2Q13029 1718 aa41.37■■■■■ 4.21
LRRC1-201ENST00000370882 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.35■■■■■ 4.21
LRRC1-201ENST00000370882 WDR62O43379 1518 aa41.2■■■■■ 4.19
LRRC1-201ENST00000370882 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
LRRC1-201ENST00000370882 ABCC8Q09428 1581 aa40.91■■■■■ 4.14
LRRC1-201ENST00000370882 TOPBP1Q92547 1522 aa40.82■■■■■ 4.12
LRRC1-201ENST00000370882 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.79■■■■■ 4.12
LRRC1-201ENST00000370882 IFT140Q96RY7 1462 aa40.58■■■■■ 4.09
LRRC1-201ENST00000370882 CUX1P39880 1505 aa40.52■■■■■ 4.08
LRRC1-201ENST00000370882 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.48■■■■■ 4.07
LRRC1-201ENST00000370882 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.39■■■■■ 4.06
LRRC1-201ENST00000370882 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.35■■■■■ 4.05
LRRC1-201ENST00000370882 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
LRRC1-201ENST00000370882 SOGA1O94964 1423 aa40.33■■■■■ 4.05
LRRC1-201ENST00000370882 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
LRRC1-201ENST00000370882 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.26■■■■■ 4.03
LRRC1-201ENST00000370882 TOP2BQ02880 1626 aa40.24■■■■■ 4.03
LRRC1-201ENST00000370882 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.2■■■■■ 4.03
LRRC1-201ENST00000370882 SYNJ1O43426 1573 aa40.18■■■■■ 4.02
LRRC1-201ENST00000370882 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
LRRC1-201ENST00000370882 WDR97A6NE52 1622 aa40.13■■■■■ 4.01
LRRC1-201ENST00000370882 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.11■■■■■ 4.01
LRRC1-201ENST00000370882 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.07■■■■■ 4.01
LRRC1-201ENST00000370882 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4
LRRC1-201ENST00000370882 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.04■■■■■ 4
LRRC1-201ENST00000370882 GRIN2BQ13224 1484 aa39.88■■■■□ 3.97
LRRC1-201ENST00000370882 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.87■■■■□ 3.97
LRRC1-201ENST00000370882 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.83■■■■□ 3.97
LRRC1-201ENST00000370882 OSCARQ8IYS5 282 aa39.8■■■■□ 3.96
LRRC1-201ENST00000370882 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.77■■■■□ 3.96
LRRC1-201ENST00000370882 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.75■■■■□ 3.95
LRRC1-201ENST00000370882 PBRM1Q86U86 1689 aa39.7■■■■□ 3.95
LRRC1-201ENST00000370882 FBLN2P98095 1184 aa39.64■■■■□ 3.94
LRRC1-201ENST00000370882 SYNJ2O15056 1496 aa39.61■■■■□ 3.93
LRRC1-201ENST00000370882 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.59■■■■□ 3.93
LRRC1-201ENST00000370882 CHD1O14646 1710 aa39.59■■■■□ 3.93
LRRC1-201ENST00000370882 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.58■■■■□ 3.93
LRRC1-201ENST00000370882 KIF27Q86VH2 1401 aa39.54■■■■□ 3.92
LRRC1-201ENST00000370882 TRIM41Q8WV44 630 aa39.49■■■■□ 3.91
LRRC1-201ENST00000370882 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.44■■■■□ 3.9
LRRC1-201ENST00000370882 ADAMTS12P58397 1594 aa39.44■■■■□ 3.9
LRRC1-201ENST00000370882 GRIN2AQ12879 1464 aa39.34■■■■□ 3.89
LRRC1-201ENST00000370882 IGF1RP08069 1367 aa39.32■■■■□ 3.88
LRRC1-201ENST00000370882 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.23■■■■□ 3.87
LRRC1-201ENST00000370882 CUL7Q14999 1698 aa39.22■■■■□ 3.87
LRRC1-201ENST00000370882 NUP160Q12769 1436 aa39.16■■■■□ 3.86
LRRC1-201ENST00000370882 ARHGEF11O15085 1522 aa39.1■■■■□ 3.85
LRRC1-201ENST00000370882 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.09■■■■□ 3.85
LRRC1-201ENST00000370882 CEP170Q5SW79 1584 aa39.08■■■■□ 3.85
LRRC1-201ENST00000370882 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.06■■■■□ 3.84
LRRC1-201ENST00000370882 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.06■■■■□ 3.84
LRRC1-201ENST00000370882 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.06■■■■□ 3.84
LRRC1-201ENST00000370882 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.06■■■■□ 3.84
LRRC1-201ENST00000370882 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.01■■■■□ 3.84
LRRC1-201ENST00000370882 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.89■■■■□ 3.82
LRRC1-201ENST00000370882 EEA1Q15075 1411 aa38.89■■■■□ 3.82
LRRC1-201ENST00000370882 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.84■■■■□ 3.81
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