RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498682.3

AC073111.5-204, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene AC073111.5, Length 1,167 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC073111.5-204ENST00000498682 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.01■■■■■ 6.72
AC073111.5-204ENST00000498682 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.97■■■■■ 5.75
AC073111.5-204ENST00000498682 ABCC9O60706 1549 aa50.34■■■■■ 5.65
AC073111.5-204ENST00000498682 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.22■■■■■ 5.31
AC073111.5-204ENST00000498682 NACADO15069 1562 aa48.03■■■■■ 5.28
AC073111.5-204ENST00000498682 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.77■■■■■ 5.24
AC073111.5-204ENST00000498682 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.57■■■■■ 5.21
AC073111.5-204ENST00000498682 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.37■■■■■ 5.17
AC073111.5-204ENST00000498682 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.19■■■■■ 5.14
AC073111.5-204ENST00000498682 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.16■■■■■ 5.14
AC073111.5-204ENST00000498682 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.92■■■■■ 5.1
AC073111.5-204ENST00000498682 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.81■■■■■ 5.08
AC073111.5-204ENST00000498682 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.72■■■■■ 5.07
AC073111.5-204ENST00000498682 SCRIBQ14160 1630 aa46.41■■■■■ 5.02
AC073111.5-204ENST00000498682 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.24■■■■■ 4.99
AC073111.5-204ENST00000498682 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.59■■■■■ 4.89
AC073111.5-204ENST00000498682 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.55■■■■■ 4.88
AC073111.5-204ENST00000498682 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.29■■■■■ 4.84
AC073111.5-204ENST00000498682 SMARCA4P51532 1647 aa44.37■■■■■ 4.69
AC073111.5-204ENST00000498682 NCAPD3P42695 1498 aa44.32■■■■■ 4.69
AC073111.5-204ENST00000498682 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.25■■■■■ 4.67
AC073111.5-204ENST00000498682 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.22■■■■■ 4.67
AC073111.5-204ENST00000498682 SMARCA2P51531 1590 aa44.17■■■■■ 4.66
AC073111.5-204ENST00000498682 HMGXB3Q12766 1538 aa44.05■■■■■ 4.64
AC073111.5-204ENST00000498682 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.95■■■■■ 4.63
AC073111.5-204ENST00000498682 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.92■■■■■ 4.62
AC073111.5-204ENST00000498682 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.83■■■■■ 4.61
AC073111.5-204ENST00000498682 WIZO95785 1651 aa43.44■■■■■ 4.54
AC073111.5-204ENST00000498682 NESP48681 1621 aa43.42■■■■■ 4.54
AC073111.5-204ENST00000498682 ERCC6Q03468 1493 aa43.41■■■■■ 4.54
AC073111.5-204ENST00000498682 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.24■■■■■ 4.51
AC073111.5-204ENST00000498682 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.22■■■■■ 4.51
AC073111.5-204ENST00000498682 CUX2O14529 1486 aa43.19■■■■■ 4.51
AC073111.5-204ENST00000498682 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.97■■■■■ 4.47
AC073111.5-204ENST00000498682 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.94■■■■■ 4.46
AC073111.5-204ENST00000498682 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
AC073111.5-204ENST00000498682 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.92■■■■■ 4.46
AC073111.5-204ENST00000498682 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.91■■■■■ 4.46
AC073111.5-204ENST00000498682 CFTRP13569 1480 aa42.62■■■■■ 4.41
AC073111.5-204ENST00000498682 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.55■■■■■ 4.4
AC073111.5-204ENST00000498682 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.51■■■■■ 4.4
AC073111.5-204ENST00000498682 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.49■■■■■ 4.39
AC073111.5-204ENST00000498682 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.49■■■■■ 4.39
AC073111.5-204ENST00000498682 WDR62O43379 1518 aa42.44■■■■■ 4.38
AC073111.5-204ENST00000498682 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.42■■■■■ 4.38
AC073111.5-204ENST00000498682 PRDM2Q13029 1718 aa42.32■■■■■ 4.36
AC073111.5-204ENST00000498682 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.11■■■■■ 4.33
AC073111.5-204ENST00000498682 TOPBP1Q92547 1522 aa41.75■■■■■ 4.27
AC073111.5-204ENST00000498682 ABCC8Q09428 1581 aa41.72■■■■■ 4.27
AC073111.5-204ENST00000498682 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.67■■■■■ 4.26
AC073111.5-204ENST00000498682 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
AC073111.5-204ENST00000498682 IFT140Q96RY7 1462 aa41.62■■■■■ 4.25
AC073111.5-204ENST00000498682 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.49■■■■■ 4.23
AC073111.5-204ENST00000498682 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
AC073111.5-204ENST00000498682 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
AC073111.5-204ENST00000498682 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.32■■■■■ 4.2
AC073111.5-204ENST00000498682 OSCARQ8IYS5 282 aa41.27■■■■■ 4.2
AC073111.5-204ENST00000498682 CUX1P39880 1505 aa41.24■■■■■ 4.19
AC073111.5-204ENST00000498682 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.18■■■■■ 4.18
AC073111.5-204ENST00000498682 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.18■■■■■ 4.18
AC073111.5-204ENST00000498682 SOGA1O94964 1423 aa41.17■■■■■ 4.18
AC073111.5-204ENST00000498682 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.16■■■■■ 4.186e-10■■■□□ 18.1
AC073111.5-204ENST00000498682 WDR97A6NE52 1622 aa41.01■■■■■ 4.16
AC073111.5-204ENST00000498682 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
AC073111.5-204ENST00000498682 CHD1O14646 1710 aa40.93■■■■■ 4.14
AC073111.5-204ENST00000498682 TRIM41Q8WV44 630 aa40.82■■■■■ 4.13
AC073111.5-204ENST00000498682 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.77■■■■■ 4.12
AC073111.5-204ENST00000498682 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.77■■■■■ 4.12
AC073111.5-204ENST00000498682 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.76■■■■■ 4.12
AC073111.5-204ENST00000498682 GRIN2BQ13224 1484 aa40.76■■■■■ 4.12
AC073111.5-204ENST00000498682 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.75■■■■■ 4.11
AC073111.5-204ENST00000498682 TOP2BQ02880 1626 aa40.75■■■■■ 4.11
AC073111.5-204ENST00000498682 FBLN2P98095 1184 aa40.74■■■■■ 4.11
AC073111.5-204ENST00000498682 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.72■■■■■ 4.11
AC073111.5-204ENST00000498682 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.72■■■■■ 4.11
AC073111.5-204ENST00000498682 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.72■■■■■ 4.11
AC073111.5-204ENST00000498682 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.71■■■■■ 4.11
AC073111.5-204ENST00000498682 SYNJ1O43426 1573 aa40.7■■■■■ 4.11
AC073111.5-204ENST00000498682 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.69■■■■■ 4.1
AC073111.5-204ENST00000498682 PBRM1Q86U86 1689 aa40.69■■■■■ 4.1
AC073111.5-204ENST00000498682 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.67■■■■■ 4.1
AC073111.5-204ENST00000498682 ARHGEF11O15085 1522 aa40.64■■■■■ 4.1
AC073111.5-204ENST00000498682 SYNJ2O15056 1496 aa40.57■■■■■ 4.08
AC073111.5-204ENST00000498682 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
AC073111.5-204ENST00000498682 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.46■■■■■ 4.07
AC073111.5-204ENST00000498682 ADAMTS12P58397 1594 aa40.31■■■■■ 4.04
AC073111.5-204ENST00000498682 ARAP1Q96P48 1450 aa40.27■■■■■ 4.04
AC073111.5-204ENST00000498682 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.26■■■■■ 4.04
AC073111.5-204ENST00000498682 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.26■■■■■ 4.04
AC073111.5-204ENST00000498682 GRIN2AQ12879 1464 aa40.24■■■■■ 4.03
AC073111.5-204ENST00000498682 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.2■■■■■ 4.03
AC073111.5-204ENST00000498682 NUP160Q12769 1436 aa40.09■■■■■ 4.01
AC073111.5-204ENST00000498682 CEP170Q5SW79 1584 aa40.08■■■■■ 4.01
AC073111.5-204ENST00000498682 KIF27Q86VH2 1401 aa39.93■■■■□ 3.98
AC073111.5-204ENST00000498682 SHROOM2Q13796 1616 aa39.88■■■■□ 3.97
AC073111.5-204ENST00000498682 IGF1RP08069 1367 aa39.85■■■■□ 3.97
AC073111.5-204ENST00000498682 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.84■■■■□ 3.97
AC073111.5-204ENST00000498682 CUL7Q14999 1698 aa39.8■■■■□ 3.96
AC073111.5-204ENST00000498682 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.73■■■■□ 3.95
AC073111.5-204ENST00000498682 JPH4Q96JJ6 628 aa39.65■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms