RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257536.11

CCNJL-201, Transcript of cyclin J like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCNJL, Length 1,848 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJL-201ENST00000257536 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.59■■■■■ 6.49
CCNJL-201ENST00000257536 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.89■■■■■ 5.42
CCNJL-201ENST00000257536 ABCC9O60706 1549 aa46.96■■■■■ 5.11
CCNJL-201ENST00000257536 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.56■■■■■ 5.04
CCNJL-201ENST00000257536 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.26■■■■■ 5
CCNJL-201ENST00000257536 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.89■■■■■ 4.94
CCNJL-201ENST00000257536 NACADO15069 1562 aa45.65■■■■■ 4.9
CCNJL-201ENST00000257536 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.61■■■■■ 4.89
CCNJL-201ENST00000257536 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.5■■■■■ 4.87
CCNJL-201ENST00000257536 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.95■■■■■ 4.79
CCNJL-201ENST00000257536 SCRIBQ14160 1630 aa44.94■■■■■ 4.79
CCNJL-201ENST00000257536 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.65■■■■■ 4.74
CCNJL-201ENST00000257536 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.12■■■■■ 4.65
CCNJL-201ENST00000257536 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.1■■■■■ 4.65
CCNJL-201ENST00000257536 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.29■■■■■ 4.52
CCNJL-201ENST00000257536 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.01■■■■■ 4.48
CCNJL-201ENST00000257536 SMARCA4P51532 1647 aa42.96■■■■■ 4.47
CCNJL-201ENST00000257536 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.95■■■■■ 4.47
CCNJL-201ENST00000257536 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.88■■■■■ 4.46
CCNJL-201ENST00000257536 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.82■■■■■ 4.45
CCNJL-201ENST00000257536 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.81■■■■■ 4.44
CCNJL-201ENST00000257536 WIZO95785 1651 aa42.62■■■■■ 4.41
CCNJL-201ENST00000257536 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.47■■■■■ 4.39
CCNJL-201ENST00000257536 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.38■■■■■ 4.37
CCNJL-201ENST00000257536 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.37■■■■■ 4.37
CCNJL-201ENST00000257536 SMARCA2P51531 1590 aa42.35■■■■■ 4.37
CCNJL-201ENST00000257536 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
CCNJL-201ENST00000257536 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.11■■■■■ 4.33
CCNJL-201ENST00000257536 NCAPD3P42695 1498 aa42.09■■■■■ 4.33
CCNJL-201ENST00000257536 HMGXB3Q12766 1538 aa42.03■■■■■ 4.32
CCNJL-201ENST00000257536 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.01■■■■■ 4.32
CCNJL-201ENST00000257536 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.64■■■■■ 4.26
CCNJL-201ENST00000257536 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.98■■■■■ 4.15
CCNJL-201ENST00000257536 CFTRP13569 1480 aa40.97■■■■■ 4.15
CCNJL-201ENST00000257536 NESP48681 1621 aa40.97■■■■■ 4.15
CCNJL-201ENST00000257536 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.87■■■■■ 4.13
CCNJL-201ENST00000257536 PRDM2Q13029 1718 aa40.87■■■■■ 4.13
CCNJL-201ENST00000257536 ABCC8Q09428 1581 aa40.62■■■■■ 4.09
CCNJL-201ENST00000257536 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.59■■■■■ 4.09
CCNJL-201ENST00000257536 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.54■■■■■ 4.08
CCNJL-201ENST00000257536 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.54■■■■■ 4.08
CCNJL-201ENST00000257536 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.48■■■■■ 4.07
CCNJL-201ENST00000257536 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.44■■■■■ 4.06
CCNJL-201ENST00000257536 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.36■■■■■ 4.05
CCNJL-201ENST00000257536 ERCC6Q03468 1493 aa40.36■■■■■ 4.05
CCNJL-201ENST00000257536 SYNJ1O43426 1573 aa40.28■■■■■ 4.04
CCNJL-201ENST00000257536 TRIM41Q8WV44 630 aa40.26■■■■■ 4.03
CCNJL-201ENST00000257536 CUX1P39880 1505 aa40.23■■■■■ 4.03
CCNJL-201ENST00000257536 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
CCNJL-201ENST00000257536 TOP2BQ02880 1626 aa40.14■■■■■ 4.02
CCNJL-201ENST00000257536 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.13■■■■■ 4.01
CCNJL-201ENST00000257536 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.11■■■■■ 4.01
CCNJL-201ENST00000257536 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.1■■■■■ 4.01
CCNJL-201ENST00000257536 TOPBP1Q92547 1522 aa40.07■■■■■ 4
CCNJL-201ENST00000257536 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
CCNJL-201ENST00000257536 WDR62O43379 1518 aa39.92■■■■□ 3.98
CCNJL-201ENST00000257536 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.92■■■■□ 3.98
CCNJL-201ENST00000257536 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.97
CCNJL-201ENST00000257536 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.71■■■■□ 3.95
CCNJL-201ENST00000257536 SOGA1O94964 1423 aa39.65■■■■□ 3.94
CCNJL-201ENST00000257536 CUX2O14529 1486 aa39.6■■■■□ 3.93
CCNJL-201ENST00000257536 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.59■■■■□ 3.93
CCNJL-201ENST00000257536 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.54■■■■□ 3.92
CCNJL-201ENST00000257536 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
CCNJL-201ENST00000257536 WDR97A6NE52 1622 aa39.52■■■■□ 3.92
CCNJL-201ENST00000257536 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.49■■■■□ 3.91
CCNJL-201ENST00000257536 IFT140Q96RY7 1462 aa39.47■■■■□ 3.91
CCNJL-201ENST00000257536 KIF27Q86VH2 1401 aa39.39■■■■□ 3.9
CCNJL-201ENST00000257536 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.36■■■■□ 3.89
CCNJL-201ENST00000257536 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.33■■■■□ 3.89
CCNJL-201ENST00000257536 EEA1Q15075 1411 aa39.31■■■■□ 3.88
CCNJL-201ENST00000257536 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.3■■■■□ 3.88
CCNJL-201ENST00000257536 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.25■■■■□ 3.87
CCNJL-201ENST00000257536 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.23■■■■□ 3.87
CCNJL-201ENST00000257536 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.22■■■■□ 3.87
CCNJL-201ENST00000257536 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.18■■■■□ 3.86
CCNJL-201ENST00000257536 PBRM1Q86U86 1689 aa39.17■■■■□ 3.86
CCNJL-201ENST00000257536 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.16■■■■□ 3.86
CCNJL-201ENST00000257536 IGF1RP08069 1367 aa39.06■■■■□ 3.84
CCNJL-201ENST00000257536 GRIN2BQ13224 1484 aa39.02■■■■□ 3.84
CCNJL-201ENST00000257536 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.02■■■■□ 3.84
CCNJL-201ENST00000257536 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.96■■■■□ 3.83
CCNJL-201ENST00000257536 CUL7Q14999 1698 aa38.95■■■■□ 3.83
CCNJL-201ENST00000257536 KIF21BO75037 1637 aa38.92■■■■□ 3.82
CCNJL-201ENST00000257536 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.92■■■■□ 3.82
CCNJL-201ENST00000257536 PRXQ9BXM0 1461 aa38.9■■■■□ 3.82
CCNJL-201ENST00000257536 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.9■■■■□ 3.82
CCNJL-201ENST00000257536 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.86■■■■□ 3.81
CCNJL-201ENST00000257536 ADAMTS12P58397 1594 aa38.86■■■■□ 3.81
CCNJL-201ENST00000257536 GOLGA3Q08378 1498 aa38.82■■■■□ 3.8
CCNJL-201ENST00000257536 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.78■■■■□ 3.8
CCNJL-201ENST00000257536 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.76■■■■□ 3.79
CCNJL-201ENST00000257536 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.7■■■■□ 3.79
CCNJL-201ENST00000257536 FBLN2P98095 1184 aa38.66■■■■□ 3.78
CCNJL-201ENST00000257536 SYNJ2O15056 1496 aa38.64■■■■□ 3.78
CCNJL-201ENST00000257536 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.6■■■■□ 3.77
CCNJL-201ENST00000257536 CHD1O14646 1710 aa38.57■■■■□ 3.76
CCNJL-201ENST00000257536 GRIN2AQ12879 1464 aa38.56■■■■□ 3.76
CCNJL-201ENST00000257536 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.48■■■■□ 3.75
CCNJL-201ENST00000257536 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.47■■■■□ 3.75
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