RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255389.9

PEMT-201, Transcript of phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PEMT, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMT-201ENST00000255389 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.17■■■■■ 6.74
PEMT-201ENST00000255389 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.16■■■■■ 5.78
PEMT-201ENST00000255389 ABCC9O60706 1549 aa51.06■■■■■ 5.76
PEMT-201ENST00000255389 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.6■■■■■ 5.37
PEMT-201ENST00000255389 NACADO15069 1562 aa48.3■■■■■ 5.32
PEMT-201ENST00000255389 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.18■■■■■ 5.3
PEMT-201ENST00000255389 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.73■■■■■ 5.23
PEMT-201ENST00000255389 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.68■■■■■ 5.22
PEMT-201ENST00000255389 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.59■■■■■ 5.21
PEMT-201ENST00000255389 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.59■■■■■ 5.21
PEMT-201ENST00000255389 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.45■■■■■ 5.19
PEMT-201ENST00000255389 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.27■■■■■ 5.16
PEMT-201ENST00000255389 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.17■■■■■ 5.14
PEMT-201ENST00000255389 SCRIBQ14160 1630 aa46.76■■■■■ 5.08
PEMT-201ENST00000255389 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.5■■■■■ 5.03
PEMT-201ENST00000255389 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.1■■■■■ 4.97
PEMT-201ENST00000255389 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.05■■■■■ 4.96
PEMT-201ENST00000255389 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.93■■■■■ 4.94
PEMT-201ENST00000255389 NCAPD3P42695 1498 aa44.6■■■■■ 4.73
PEMT-201ENST00000255389 SMARCA4P51532 1647 aa44.57■■■■■ 4.73
PEMT-201ENST00000255389 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.55■■■■■ 4.72
PEMT-201ENST00000255389 SMARCA2P51531 1590 aa44.39■■■■■ 4.7
PEMT-201ENST00000255389 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.34■■■■■ 4.69
PEMT-201ENST00000255389 HMGXB3Q12766 1538 aa44.31■■■■■ 4.68
PEMT-201ENST00000255389 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.12■■■■■ 4.65
PEMT-201ENST00000255389 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.11■■■■■ 4.65
PEMT-201ENST00000255389 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.09■■■■■ 4.65
PEMT-201ENST00000255389 ERCC6Q03468 1493 aa44.01■■■■■ 4.64
PEMT-201ENST00000255389 NESP48681 1621 aa43.95■■■■■ 4.63
PEMT-201ENST00000255389 CUX2O14529 1486 aa43.82■■■■■ 4.6
PEMT-201ENST00000255389 WIZO95785 1651 aa43.6■■■■■ 4.57
PEMT-201ENST00000255389 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.57■■■■■ 4.57
PEMT-201ENST00000255389 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.55■■■■■ 4.56
PEMT-201ENST00000255389 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.43■■■■■ 4.54
PEMT-201ENST00000255389 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.37■■■■■ 4.53
PEMT-201ENST00000255389 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.29■■■■■ 4.52
PEMT-201ENST00000255389 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.28■■■■■ 4.52
PEMT-201ENST00000255389 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.25■■■■■ 4.51
PEMT-201ENST00000255389 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.02■■■■■ 4.48
PEMT-201ENST00000255389 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.95■■■■■ 4.47
PEMT-201ENST00000255389 WDR62O43379 1518 aa42.85■■■■■ 4.45
PEMT-201ENST00000255389 CFTRP13569 1480 aa42.84■■■■■ 4.45
PEMT-201ENST00000255389 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.82■■■■■ 4.45
PEMT-201ENST00000255389 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.81■■■■■ 4.44
PEMT-201ENST00000255389 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.55■■■■■ 4.4
PEMT-201ENST00000255389 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.49■■■■■ 4.39
PEMT-201ENST00000255389 PRDM2Q13029 1718 aa42.42■■■■■ 4.38
PEMT-201ENST00000255389 TOPBP1Q92547 1522 aa42.05■■■■■ 4.32
PEMT-201ENST00000255389 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
PEMT-201ENST00000255389 IFT140Q96RY7 1462 aa41.95■■■■■ 4.31
PEMT-201ENST00000255389 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.89■■■■■ 4.3
PEMT-201ENST00000255389 ABCC8Q09428 1581 aa41.84■■■■■ 4.29
PEMT-201ENST00000255389 OSCARQ8IYS5 282 aa41.84■■■■■ 4.29
PEMT-201ENST00000255389 TRIM41Q8WV44 630 aa41.81■■■■■ 4.28
PEMT-201ENST00000255389 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.7■■■■■ 4.27
PEMT-201ENST00000255389 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
PEMT-201ENST00000255389 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
PEMT-201ENST00000255389 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.57■■■■■ 4.25
PEMT-201ENST00000255389 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
PEMT-201ENST00000255389 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.52■■■■■ 4.24
PEMT-201ENST00000255389 CUX1P39880 1505 aa41.43■■■■■ 4.22
PEMT-201ENST00000255389 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.41■■■■■ 4.22
PEMT-201ENST00000255389 SOGA1O94964 1423 aa41.41■■■■■ 4.22
PEMT-201ENST00000255389 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.36■■■■■ 4.21
PEMT-201ENST00000255389 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.36■■■■■ 4.21
PEMT-201ENST00000255389 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.36■■■■■ 4.21
PEMT-201ENST00000255389 CHD1O14646 1710 aa41.35■■■■■ 4.21
PEMT-201ENST00000255389 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.35■■■■■ 4.21
PEMT-201ENST00000255389 ARHGEF11O15085 1522 aa41.24■■■■■ 4.19
PEMT-201ENST00000255389 FBLN2P98095 1184 aa41.22■■■■■ 4.19
PEMT-201ENST00000255389 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.16■■■■■ 4.18
PEMT-201ENST00000255389 WDR97A6NE52 1622 aa41.15■■■■■ 4.18
PEMT-201ENST00000255389 GRIN2BQ13224 1484 aa41.02■■■■■ 4.16
PEMT-201ENST00000255389 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.99■■■■■ 4.15
PEMT-201ENST00000255389 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.92■■■■■ 4.14
PEMT-201ENST00000255389 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.92■■■■■ 4.14
PEMT-201ENST00000255389 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.92■■■■■ 4.14
PEMT-201ENST00000255389 PBRM1Q86U86 1689 aa40.91■■■■■ 4.14
PEMT-201ENST00000255389 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.91■■■■■ 4.14
PEMT-201ENST00000255389 ARAP1Q96P48 1450 aa40.89■■■■■ 4.14
PEMT-201ENST00000255389 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.88■■■■■ 4.13
PEMT-201ENST00000255389 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.87■■■■■ 4.13
PEMT-201ENST00000255389 SYNJ2O15056 1496 aa40.86■■■■■ 4.13
PEMT-201ENST00000255389 SYNJ1O43426 1573 aa40.82■■■■■ 4.12
PEMT-201ENST00000255389 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.78■■■■■ 4.12
PEMT-201ENST00000255389 TOP2BQ02880 1626 aa40.78■■■■■ 4.12
PEMT-201ENST00000255389 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.77■■■■■ 4.12
PEMT-201ENST00000255389 ADAMTS12P58397 1594 aa40.56■■■■■ 4.08
PEMT-201ENST00000255389 GRIN2AQ12879 1464 aa40.51■■■■■ 4.08
PEMT-201ENST00000255389 CEP170Q5SW79 1584 aa40.41■■■■■ 4.06
PEMT-201ENST00000255389 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.39■■■■■ 4.06
PEMT-201ENST00000255389 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.38■■■■■ 4.06
PEMT-201ENST00000255389 NUP160Q12769 1436 aa40.37■■■■■ 4.05
PEMT-201ENST00000255389 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
PEMT-201ENST00000255389 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.33■■■■■ 4.05
PEMT-201ENST00000255389 SHROOM2Q13796 1616 aa40.17■■■■■ 4.02
PEMT-201ENST00000255389 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.98■■■■□ 3.99
PEMT-201ENST00000255389 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.97■■■■□ 3.99
PEMT-201ENST00000255389 KIF27Q86VH2 1401 aa39.95■■■■□ 3.99
PEMT-201ENST00000255389 IGF1RP08069 1367 aa39.95■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.3 ms