Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP1P29466 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP1P29466 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP1P29466 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP1P29466 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP1P29466 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP1P29466 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP1P29466 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP1P29466 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP1P29466 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP1P29466 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP1P29466 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP1P29466 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP1P29466 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP1P29466 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP1P29466 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP1P29466 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP1P29466 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP1P29466 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP1P29466 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP1P29466 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP1P29466 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP1P29466 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms