RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360779.3

SDCBP2-202, Transcript of syndecan binding protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SDCBP2, Length 1,519 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2-202ENST00000360779 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.24■■■■□ 3.71
SDCBP2-202ENST00000360779 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.55■■■□□ 2.96
SDCBP2-202ENST00000360779 ABCC9O60706 1549 aa32.13■■■□□ 2.73
SDCBP2-202ENST00000360779 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
SDCBP2-202ENST00000360779 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.89■■■□□ 2.7
SDCBP2-202ENST00000360779 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.58■■■□□ 2.65
SDCBP2-202ENST00000360779 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.34■■■□□ 2.61
SDCBP2-202ENST00000360779 NACADO15069 1562 aa31.34■■■□□ 2.61
SDCBP2-202ENST00000360779 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.21■■■□□ 2.59
SDCBP2-202ENST00000360779 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.05■■■□□ 2.56
SDCBP2-202ENST00000360779 SCRIBQ14160 1630 aa30.86■■■□□ 2.53
SDCBP2-202ENST00000360779 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.45■■■□□ 2.47
SDCBP2-202ENST00000360779 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.22■■■□□ 2.43
SDCBP2-202ENST00000360779 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.16■■■□□ 2.42
SDCBP2-202ENST00000360779 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.73■■■□□ 2.35
SDCBP2-202ENST00000360779 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
SDCBP2-202ENST00000360779 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
SDCBP2-202ENST00000360779 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.52■■■□□ 2.32
SDCBP2-202ENST00000360779 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
SDCBP2-202ENST00000360779 SMARCA4P51532 1647 aa29.5■■■□□ 2.31
SDCBP2-202ENST00000360779 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
SDCBP2-202ENST00000360779 WIZO95785 1651 aa29.28■■■□□ 2.28
SDCBP2-202ENST00000360779 SMARCA2P51531 1590 aa29.12■■■□□ 2.25
SDCBP2-202ENST00000360779 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.1■■■□□ 2.25
SDCBP2-202ENST00000360779 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.08■■■□□ 2.25
SDCBP2-202ENST00000360779 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.02■■■□□ 2.24
SDCBP2-202ENST00000360779 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
SDCBP2-202ENST00000360779 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
SDCBP2-202ENST00000360779 NCAPD3P42695 1498 aa28.89■■■□□ 2.21
SDCBP2-202ENST00000360779 HMGXB3Q12766 1538 aa28.85■■■□□ 2.21
SDCBP2-202ENST00000360779 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.67■■■□□ 2.18
SDCBP2-202ENST00000360779 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.56■■■□□ 2.16
SDCBP2-202ENST00000360779 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.17■■■□□ 2.1
SDCBP2-202ENST00000360779 CFTRP13569 1480 aa28.15■■■□□ 2.1
SDCBP2-202ENST00000360779 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.12■■■□□ 2.09
SDCBP2-202ENST00000360779 NESP48681 1621 aa28.03■■■□□ 2.08
SDCBP2-202ENST00000360779 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.02■■■□□ 2.08
SDCBP2-202ENST00000360779 PRDM2Q13029 1718 aa28.01■■■□□ 2.07
SDCBP2-202ENST00000360779 ABCC8Q09428 1581 aa27.97■■■□□ 2.07
SDCBP2-202ENST00000360779 TRIM41Q8WV44 630 aa27.94■■■□□ 2.06
SDCBP2-202ENST00000360779 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.87■■■□□ 2.05
SDCBP2-202ENST00000360779 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.86■■■□□ 2.05
SDCBP2-202ENST00000360779 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.85■■■□□ 2.05
SDCBP2-202ENST00000360779 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.77■■■□□ 2.04
SDCBP2-202ENST00000360779 SYNJ1O43426 1573 aa27.71■■■□□ 2.03
SDCBP2-202ENST00000360779 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.7■■■□□ 2.03
SDCBP2-202ENST00000360779 ERCC6Q03468 1493 aa27.66■■■□□ 2.02
SDCBP2-202ENST00000360779 CUX1P39880 1505 aa27.65■■■□□ 2.02
SDCBP2-202ENST00000360779 TOP2BQ02880 1626 aa27.63■■■□□ 2.01
SDCBP2-202ENST00000360779 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.6■■■□□ 2.01
SDCBP2-202ENST00000360779 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.55■■■□□ 2
SDCBP2-202ENST00000360779 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.51■■□□□ 1.99
SDCBP2-202ENST00000360779 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
SDCBP2-202ENST00000360779 TOPBP1Q92547 1522 aa27.51■■□□□ 1.99
SDCBP2-202ENST00000360779 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
SDCBP2-202ENST00000360779 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.44■■□□□ 1.98
SDCBP2-202ENST00000360779 SOGA1O94964 1423 aa27.34■■□□□ 1.97
SDCBP2-202ENST00000360779 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
SDCBP2-202ENST00000360779 WDR62O43379 1518 aa27.34■■□□□ 1.97
SDCBP2-202ENST00000360779 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
SDCBP2-202ENST00000360779 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.27■■□□□ 1.96
SDCBP2-202ENST00000360779 EEA1Q15075 1411 aa27.26■■□□□ 1.95
SDCBP2-202ENST00000360779 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.24■■□□□ 1.95
SDCBP2-202ENST00000360779 CUX2O14529 1486 aa27.22■■□□□ 1.95
SDCBP2-202ENST00000360779 KIF27Q86VH2 1401 aa27.21■■□□□ 1.95
SDCBP2-202ENST00000360779 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.16■■□□□ 1.94
SDCBP2-202ENST00000360779 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.15■■□□□ 1.94
SDCBP2-202ENST00000360779 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.13■■□□□ 1.93
SDCBP2-202ENST00000360779 IFT140Q96RY7 1462 aa27.12■■□□□ 1.93
SDCBP2-202ENST00000360779 WDR97A6NE52 1622 aa27.09■■□□□ 1.93
SDCBP2-202ENST00000360779 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
SDCBP2-202ENST00000360779 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
SDCBP2-202ENST00000360779 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.05■■□□□ 1.92
SDCBP2-202ENST00000360779 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.98■■□□□ 1.91
SDCBP2-202ENST00000360779 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.97■■□□□ 1.91
SDCBP2-202ENST00000360779 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
SDCBP2-202ENST00000360779 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.9
SDCBP2-202ENST00000360779 IGF1RP08069 1367 aa26.92■■□□□ 1.9
SDCBP2-202ENST00000360779 KIF21BO75037 1637 aa26.9■■□□□ 1.9
SDCBP2-202ENST00000360779 GOLGA3Q08378 1498 aa26.89■■□□□ 1.9
SDCBP2-202ENST00000360779 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
SDCBP2-202ENST00000360779 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
SDCBP2-202ENST00000360779 PBRM1Q86U86 1689 aa26.85■■□□□ 1.89
SDCBP2-202ENST00000360779 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.85■■□□□ 1.89
SDCBP2-202ENST00000360779 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.84■■□□□ 1.89
SDCBP2-202ENST00000360779 GRIN2BQ13224 1484 aa26.83■■□□□ 1.89
SDCBP2-202ENST00000360779 PRXQ9BXM0 1461 aa26.83■■□□□ 1.89
SDCBP2-202ENST00000360779 CUL7Q14999 1698 aa26.81■■□□□ 1.88
SDCBP2-202ENST00000360779 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.81■■□□□ 1.88
SDCBP2-202ENST00000360779 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.71■■□□□ 1.87
SDCBP2-202ENST00000360779 ADAMTS12P58397 1594 aa26.68■■□□□ 1.86
SDCBP2-202ENST00000360779 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.68■■□□□ 1.86
SDCBP2-202ENST00000360779 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.68■■□□□ 1.86
SDCBP2-202ENST00000360779 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
SDCBP2-202ENST00000360779 FBLN2P98095 1184 aa26.59■■□□□ 1.85
SDCBP2-202ENST00000360779 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
SDCBP2-202ENST00000360779 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
SDCBP2-202ENST00000360779 SYNJ2O15056 1496 aa26.54■■□□□ 1.84
SDCBP2-202ENST00000360779 CEP162Q5TB80 1403 aa26.53■■□□□ 1.84
SDCBP2-202ENST00000360779 GRIN2AQ12879 1464 aa26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 193.5 ms