RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000199708.2

HBQ1-201, Transcript of hemoglobin subunit theta 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HBQ1, Length 536 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBQ1-201ENST00000199708 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.82■■■■■ 4.61
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HBQ1-201ENST00000199708 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.52■■■■□ 3.6
HBQ1-201ENST00000199708 NACADO15069 1562 aa37.21■■■■□ 3.55
HBQ1-201ENST00000199708 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.15■■■■□ 3.54
HBQ1-201ENST00000199708 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.09■■■■□ 3.53
HBQ1-201ENST00000199708 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.79■■■■□ 3.48
HBQ1-201ENST00000199708 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.71■■■■□ 3.47
HBQ1-201ENST00000199708 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.6■■■■□ 3.45
HBQ1-201ENST00000199708 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.42■■■■□ 3.42
HBQ1-201ENST00000199708 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
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HBQ1-201ENST00000199708 SCRIBQ14160 1630 aa35.95■■■■□ 3.35
HBQ1-201ENST00000199708 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.86■■■■□ 3.33
HBQ1-201ENST00000199708 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.67■■■■□ 3.3
HBQ1-201ENST00000199708 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.57■■■■□ 3.28
HBQ1-201ENST00000199708 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
HBQ1-201ENST00000199708 NCAPD3P42695 1498 aa34.33■■■■□ 3.09
HBQ1-201ENST00000199708 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.26■■■■□ 3.07
HBQ1-201ENST00000199708 SMARCA4P51532 1647 aa34.22■■■■□ 3.07
HBQ1-201ENST00000199708 SMARCA2P51531 1590 aa34.15■■■■□ 3.06
HBQ1-201ENST00000199708 ERCC6Q03468 1493 aa34.14■■■■□ 3.06
HBQ1-201ENST00000199708 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.1■■■■□ 3.05
HBQ1-201ENST00000199708 HMGXB3Q12766 1538 aa34.09■■■■□ 3.05
HBQ1-201ENST00000199708 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
HBQ1-201ENST00000199708 CUX2O14529 1486 aa34.02■■■■□ 3.04
HBQ1-201ENST00000199708 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
HBQ1-201ENST00000199708 NESP48681 1621 aa33.92■■■■□ 3.02
HBQ1-201ENST00000199708 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.83■■■■□ 3.01
HBQ1-201ENST00000199708 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.79■■■■□ 3
HBQ1-201ENST00000199708 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.61■■■□□ 2.97
HBQ1-201ENST00000199708 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.56■■■□□ 2.96
HBQ1-201ENST00000199708 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.48■■■□□ 2.95
HBQ1-201ENST00000199708 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.43■■■□□ 2.94
HBQ1-201ENST00000199708 WIZO95785 1651 aa33.42■■■□□ 2.94
HBQ1-201ENST00000199708 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.32■■■□□ 2.92
HBQ1-201ENST00000199708 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.16■■■□□ 2.9
HBQ1-201ENST00000199708 WDR62O43379 1518 aa33.07■■■□□ 2.88
HBQ1-201ENST00000199708 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.03■■■□□ 2.88
HBQ1-201ENST00000199708 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.03■■■□□ 2.88
HBQ1-201ENST00000199708 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.98■■■□□ 2.87
HBQ1-201ENST00000199708 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.95■■■□□ 2.87
HBQ1-201ENST00000199708 CFTRP13569 1480 aa32.91■■■□□ 2.86
HBQ1-201ENST00000199708 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.71■■■□□ 2.83
HBQ1-201ENST00000199708 TRIM41Q8WV44 630 aa32.69■■■□□ 2.82
HBQ1-201ENST00000199708 PRDM2Q13029 1718 aa32.63■■■□□ 2.81
HBQ1-201ENST00000199708 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.58■■■□□ 2.81
HBQ1-201ENST00000199708 OSCARQ8IYS5 282 aa32.48■■■□□ 2.79
HBQ1-201ENST00000199708 TOPBP1Q92547 1522 aa32.34■■■□□ 2.77
HBQ1-201ENST00000199708 IFT140Q96RY7 1462 aa32.34■■■□□ 2.77
HBQ1-201ENST00000199708 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.33■■■□□ 2.77
HBQ1-201ENST00000199708 ABCC8Q09428 1581 aa32.22■■■□□ 2.75
HBQ1-201ENST00000199708 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.21■■■□□ 2.75
HBQ1-201ENST00000199708 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
HBQ1-201ENST00000199708 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.1■■■□□ 2.73
HBQ1-201ENST00000199708 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.1■■■□□ 2.73
HBQ1-201ENST00000199708 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.1■■■□□ 2.73
HBQ1-201ENST00000199708 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
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HBQ1-201ENST00000199708 CHD1O14646 1710 aa31.96■■■□□ 2.71
HBQ1-201ENST00000199708 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.91■■■□□ 2.7
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HBQ1-201ENST00000199708 SOGA1O94964 1423 aa31.85■■■□□ 2.69
HBQ1-201ENST00000199708 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.83■■■□□ 2.69
HBQ1-201ENST00000199708 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.81■■■□□ 2.68
HBQ1-201ENST00000199708 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.77■■■□□ 2.68
HBQ1-201ENST00000199708 CUX1P39880 1505 aa31.75■■■□□ 2.67
HBQ1-201ENST00000199708 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.72■■■□□ 2.67
HBQ1-201ENST00000199708 WDR97A6NE52 1622 aa31.67■■■□□ 2.66
HBQ1-201ENST00000199708 ARAP1Q96P48 1450 aa31.65■■■□□ 2.66
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HBQ1-201ENST00000199708 PBRM1Q86U86 1689 aa31.5■■■□□ 2.63
HBQ1-201ENST00000199708 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
HBQ1-201ENST00000199708 SYNJ2O15056 1496 aa31.48■■■□□ 2.63
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HBQ1-201ENST00000199708 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.22■■■□□ 2.59
HBQ1-201ENST00000199708 TOP2BQ02880 1626 aa31.21■■■□□ 2.59
HBQ1-201ENST00000199708 GRIN2AQ12879 1464 aa31.18■■■□□ 2.58
HBQ1-201ENST00000199708 ADAMTS12P58397 1594 aa31.17■■■□□ 2.58
HBQ1-201ENST00000199708 CEP170Q5SW79 1584 aa31.09■■■□□ 2.57
HBQ1-201ENST00000199708 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.09■■■□□ 2.57
HBQ1-201ENST00000199708 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.05■■■□□ 2.56
HBQ1-201ENST00000199708 NUP160Q12769 1436 aa31.05■■■□□ 2.56
HBQ1-201ENST00000199708 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.01■■■□□ 2.55
HBQ1-201ENST00000199708 SHROOM2Q13796 1616 aa30.93■■■□□ 2.54
HBQ1-201ENST00000199708 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
HBQ1-201ENST00000199708 JPH4Q96JJ6 628 aa30.75■■■□□ 2.51
HBQ1-201ENST00000199708 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.73■■■□□ 2.51
HBQ1-201ENST00000199708 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
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