RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392273.7

LATS1-202, Transcript of large tumor suppressor kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LATS1, Length 2,567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATS1-202ENST00000392273 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.33■■■■□ 3.25
LATS1-202ENST00000392273 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.37■■■□□ 2.45
LATS1-202ENST00000392273 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
LATS1-202ENST00000392273 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.64■■■□□ 2.33
LATS1-202ENST00000392273 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.35■■■□□ 2.29
LATS1-202ENST00000392273 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.01■■■□□ 2.23
LATS1-202ENST00000392273 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.2
LATS1-202ENST00000392273 ABCC9O60706 1549 aa28.54■■■□□ 2.16
LATS1-202ENST00000392273 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.39■■■□□ 2.13
LATS1-202ENST00000392273 SCRIBQ14160 1630 aa28.33■■■□□ 2.13
LATS1-202ENST00000392273 NACADO15069 1562 aa28.17■■■□□ 2.1
LATS1-202ENST00000392273 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.85■■■□□ 2.05
LATS1-202ENST00000392273 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
LATS1-202ENST00000392273 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.7■■■□□ 2.03
LATS1-202ENST00000392273 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.58■■■□□ 2.01
LATS1-202ENST00000392273 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.48■■□□□ 1.99
LATS1-202ENST00000392273 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.43■■□□□ 1.98
LATS1-202ENST00000392273 WIZO95785 1651 aa27.28■■□□□ 1.96
LATS1-202ENST00000392273 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
LATS1-202ENST00000392273 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.13■■□□□ 1.93
LATS1-202ENST00000392273 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.11■■□□□ 1.93
LATS1-202ENST00000392273 SMARCA4P51532 1647 aa27.05■■□□□ 1.92
LATS1-202ENST00000392273 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
LATS1-202ENST00000392273 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.84■■□□□ 1.89
LATS1-202ENST00000392273 TRIM41Q8WV44 630 aa26.84■■□□□ 1.89
LATS1-202ENST00000392273 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.68■■□□□ 1.86
LATS1-202ENST00000392273 SMARCA2P51531 1590 aa26.68■■□□□ 1.86
LATS1-202ENST00000392273 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
LATS1-202ENST00000392273 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
LATS1-202ENST00000392273 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.56■■□□□ 1.84
LATS1-202ENST00000392273 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.46■■□□□ 1.83
LATS1-202ENST00000392273 ABCC8Q09428 1581 aa26.45■■□□□ 1.82
LATS1-202ENST00000392273 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.38■■□□□ 1.81
LATS1-202ENST00000392273 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
LATS1-202ENST00000392273 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.23■■□□□ 1.79
LATS1-202ENST00000392273 SOGA1O94964 1423 aa26.05■■□□□ 1.76
LATS1-202ENST00000392273 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.05■■□□□ 1.76
LATS1-202ENST00000392273 NCAPD3P42695 1498 aa26.04■■□□□ 1.76
LATS1-202ENST00000392273 HMGXB3Q12766 1538 aa26.03■■□□□ 1.76
LATS1-202ENST00000392273 SYNJ1O43426 1573 aa25.99■■□□□ 1.75
LATS1-202ENST00000392273 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.96■■□□□ 1.75
LATS1-202ENST00000392273 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
LATS1-202ENST00000392273 HRCP23327 699 aa25.82■■□□□ 1.72
LATS1-202ENST00000392273 EEA1Q15075 1411 aa25.82■■□□□ 1.72
LATS1-202ENST00000392273 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.81■■□□□ 1.72
LATS1-202ENST00000392273 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.74■■□□□ 1.71
LATS1-202ENST00000392273 TOP2BQ02880 1626 aa25.71■■□□□ 1.71
LATS1-202ENST00000392273 CFTRP13569 1480 aa25.68■■□□□ 1.7
LATS1-202ENST00000392273 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
LATS1-202ENST00000392273 CEP162Q5TB80 1403 aa25.66■■□□□ 1.7
LATS1-202ENST00000392273 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
LATS1-202ENST00000392273 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.65■■□□□ 1.7
LATS1-202ENST00000392273 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.64■■□□□ 1.7
LATS1-202ENST00000392273 GOLGA3Q08378 1498 aa25.63■■□□□ 1.69
LATS1-202ENST00000392273 CUX1P39880 1505 aa25.59■■□□□ 1.69
LATS1-202ENST00000392273 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.54■■□□□ 1.68
LATS1-202ENST00000392273 KIF21BO75037 1637 aa25.54■■□□□ 1.68
LATS1-202ENST00000392273 PRDM2Q13029 1718 aa25.54■■□□□ 1.68
LATS1-202ENST00000392273 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.49■■□□□ 1.67
LATS1-202ENST00000392273 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.46■■□□□ 1.67
LATS1-202ENST00000392273 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
LATS1-202ENST00000392273 CLIP1P30622 1438 aa25.3■■□□□ 1.64
LATS1-202ENST00000392273 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
LATS1-202ENST00000392273 KIF27Q86VH2 1401 aa25.29■■□□□ 1.64
LATS1-202ENST00000392273 NESP48681 1621 aa25.28■■□□□ 1.64
LATS1-202ENST00000392273 PRXQ9BXM0 1461 aa25.27■■□□□ 1.64
LATS1-202ENST00000392273 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.26■■□□□ 1.63
LATS1-202ENST00000392273 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.23■■□□□ 1.63
LATS1-202ENST00000392273 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.21■■□□□ 1.63
LATS1-202ENST00000392273 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.19■■□□□ 1.62
LATS1-202ENST00000392273 CUX2O14529 1486 aa25.18■■□□□ 1.62
LATS1-202ENST00000392273 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.12■■□□□ 1.61
LATS1-202ENST00000392273 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.07■■□□□ 1.6
LATS1-202ENST00000392273 IGF1RP08069 1367 aa25.06■■□□□ 1.6
LATS1-202ENST00000392273 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.06■■□□□ 1.6
LATS1-202ENST00000392273 TOPBP1Q92547 1522 aa25.05■■□□□ 1.6
LATS1-202ENST00000392273 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.02■■□□□ 1.6
LATS1-202ENST00000392273 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
LATS1-202ENST00000392273 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
LATS1-202ENST00000392273 ARAP1Q96P48 1450 aa24.99■■□□□ 1.59
LATS1-202ENST00000392273 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
LATS1-202ENST00000392273 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
LATS1-202ENST00000392273 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.94■■□□□ 1.58
LATS1-202ENST00000392273 APLP2Q06481 763 aa24.93■■□□□ 1.58
LATS1-202ENST00000392273 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.9■■□□□ 1.58
LATS1-202ENST00000392273 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.89■■□□□ 1.58
LATS1-202ENST00000392273 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.87■■□□□ 1.57
LATS1-202ENST00000392273 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.87■■□□□ 1.57
LATS1-202ENST00000392273 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
LATS1-202ENST00000392273 WDR97A6NE52 1622 aa24.79■■□□□ 1.56
LATS1-202ENST00000392273 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
LATS1-202ENST00000392273 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
LATS1-202ENST00000392273 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
LATS1-202ENST00000392273 CUL7Q14999 1698 aa24.7■■□□□ 1.54
LATS1-202ENST00000392273 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.68■■□□□ 1.54
LATS1-202ENST00000392273 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.63■■□□□ 1.53
LATS1-202ENST00000392273 P3H3Q8IVL6 736 aa24.63■■□□□ 1.53
LATS1-202ENST00000392273 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
LATS1-202ENST00000392273 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.59■■□□□ 1.53
LATS1-202ENST00000392273 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 132.9 ms