RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407308.1

DUSP18-206, Transcript of dual specificity phosphatase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene DUSP18, Length 1,978 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP18-206ENST00000407308 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.92■■■■□ 3.66
DUSP18-206ENST00000407308 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.8■■■■□ 3
DUSP18-206ENST00000407308 ABCC9O60706 1549 aa32.92■■■□□ 2.86
DUSP18-206ENST00000407308 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.78■■■□□ 2.68
DUSP18-206ENST00000407308 NACADO15069 1562 aa31.76■■■□□ 2.67
DUSP18-206ENST00000407308 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.6■■■□□ 2.65
DUSP18-206ENST00000407308 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
DUSP18-206ENST00000407308 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.59■■■□□ 2.65
DUSP18-206ENST00000407308 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.45■■■□□ 2.63
DUSP18-206ENST00000407308 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.01■■■□□ 2.55
DUSP18-206ENST00000407308 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.74■■■□□ 2.51
DUSP18-206ENST00000407308 SCRIBQ14160 1630 aa30.72■■■□□ 2.51
DUSP18-206ENST00000407308 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.72■■■□□ 2.51
DUSP18-206ENST00000407308 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.57■■■□□ 2.49
DUSP18-206ENST00000407308 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.13■■■□□ 2.41
DUSP18-206ENST00000407308 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
DUSP18-206ENST00000407308 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.82■■■□□ 2.36
DUSP18-206ENST00000407308 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.62■■■□□ 2.33
DUSP18-206ENST00000407308 SMARCA4P51532 1647 aa29.43■■■□□ 2.3
DUSP18-206ENST00000407308 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
DUSP18-206ENST00000407308 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
DUSP18-206ENST00000407308 SMARCA2P51531 1590 aa29.29■■■□□ 2.28
DUSP18-206ENST00000407308 NCAPD3P42695 1498 aa29.27■■■□□ 2.28
DUSP18-206ENST00000407308 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.26■■■□□ 2.27
DUSP18-206ENST00000407308 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.18■■■□□ 2.26
DUSP18-206ENST00000407308 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.18■■■□□ 2.26
DUSP18-206ENST00000407308 HMGXB3Q12766 1538 aa29.16■■■□□ 2.26
DUSP18-206ENST00000407308 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
DUSP18-206ENST00000407308 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
DUSP18-206ENST00000407308 WIZO95785 1651 aa28.87■■■□□ 2.21
DUSP18-206ENST00000407308 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
DUSP18-206ENST00000407308 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.53■■■□□ 2.16
DUSP18-206ENST00000407308 NESP48681 1621 aa28.46■■■□□ 2.15
DUSP18-206ENST00000407308 ERCC6Q03468 1493 aa28.44■■■□□ 2.14
DUSP18-206ENST00000407308 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.4■■■□□ 2.14
DUSP18-206ENST00000407308 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.33■■■□□ 2.13
DUSP18-206ENST00000407308 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.24■■■□□ 2.11
DUSP18-206ENST00000407308 CFTRP13569 1480 aa28.24■■■□□ 2.11
DUSP18-206ENST00000407308 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.19■■■□□ 2.1
DUSP18-206ENST00000407308 CUX2O14529 1486 aa28.19■■■□□ 2.1
DUSP18-206ENST00000407308 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.12■■■□□ 2.09
DUSP18-206ENST00000407308 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
DUSP18-206ENST00000407308 PRDM2Q13029 1718 aa28.09■■■□□ 2.09
DUSP18-206ENST00000407308 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.07■■■□□ 2.08
DUSP18-206ENST00000407308 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.06■■■□□ 2.08
DUSP18-206ENST00000407308 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.01■■■□□ 2.08
DUSP18-206ENST00000407308 WDR62O43379 1518 aa27.92■■■□□ 2.06
DUSP18-206ENST00000407308 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
DUSP18-206ENST00000407308 ABCC8Q09428 1581 aa27.71■■■□□ 2.03
DUSP18-206ENST00000407308 TRIM41Q8WV44 630 aa27.66■■■□□ 2.02
DUSP18-206ENST00000407308 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.62■■■□□ 2.01
DUSP18-206ENST00000407308 TOPBP1Q92547 1522 aa27.62■■■□□ 2.01
DUSP18-206ENST00000407308 IFT140Q96RY7 1462 aa27.48■■□□□ 1.99
DUSP18-206ENST00000407308 CUX1P39880 1505 aa27.39■■□□□ 1.97
DUSP18-206ENST00000407308 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.37■■□□□ 1.97
DUSP18-206ENST00000407308 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
DUSP18-206ENST00000407308 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
DUSP18-206ENST00000407308 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.31■■□□□ 1.96
DUSP18-206ENST00000407308 SOGA1O94964 1423 aa27.27■■□□□ 1.96
DUSP18-206ENST00000407308 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
DUSP18-206ENST00000407308 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.24■■□□□ 1.95
DUSP18-206ENST00000407308 WDR97A6NE52 1622 aa27.22■■□□□ 1.95
DUSP18-206ENST00000407308 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
DUSP18-206ENST00000407308 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.21■■□□□ 1.95
DUSP18-206ENST00000407308 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.21■■□□□ 1.95
DUSP18-206ENST00000407308 TOP2BQ02880 1626 aa27.2■■□□□ 1.94
DUSP18-206ENST00000407308 SYNJ1O43426 1573 aa27.18■■□□□ 1.94
DUSP18-206ENST00000407308 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.11■■□□□ 1.93
DUSP18-206ENST00000407308 EEA1Q15075 1411 aa27.11■■□□□ 1.93
DUSP18-206ENST00000407308 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.08■■□□□ 1.93
DUSP18-206ENST00000407308 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
DUSP18-206ENST00000407308 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
DUSP18-206ENST00000407308 GRIN2BQ13224 1484 aa26.98■■□□□ 1.91
DUSP18-206ENST00000407308 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.97■■□□□ 1.91
DUSP18-206ENST00000407308 OSCARQ8IYS5 282 aa26.97■■□□□ 1.91
DUSP18-206ENST00000407308 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.96■■□□□ 1.91
DUSP18-206ENST00000407308 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.95■■□□□ 1.91
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DUSP18-206ENST00000407308 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.9■■□□□ 1.9
DUSP18-206ENST00000407308 CHD1O14646 1710 aa26.87■■□□□ 1.89
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DUSP18-206ENST00000407308 FBLN2P98095 1184 aa26.79■■□□□ 1.88
DUSP18-206ENST00000407308 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.79■■□□□ 1.88
DUSP18-206ENST00000407308 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.78■■□□□ 1.88
DUSP18-206ENST00000407308 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
DUSP18-206ENST00000407308 KIF27Q86VH2 1401 aa26.72■■□□□ 1.87
DUSP18-206ENST00000407308 ADAMTS12P58397 1594 aa26.71■■□□□ 1.87
DUSP18-206ENST00000407308 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.67■■□□□ 1.86
DUSP18-206ENST00000407308 KIF21BO75037 1637 aa26.67■■□□□ 1.86
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DUSP18-206ENST00000407308 GRIN2AQ12879 1464 aa26.62■■□□□ 1.85
DUSP18-206ENST00000407308 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.59■■□□□ 1.85
DUSP18-206ENST00000407308 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.57■■□□□ 1.84
DUSP18-206ENST00000407308 CUL7Q14999 1698 aa26.56■■□□□ 1.84
DUSP18-206ENST00000407308 IGF1RP08069 1367 aa26.54■■□□□ 1.84
DUSP18-206ENST00000407308 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.53■■□□□ 1.84
DUSP18-206ENST00000407308 ARHGEF11O15085 1522 aa26.52■■□□□ 1.84
DUSP18-206ENST00000407308 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.52■■□□□ 1.84
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