Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CASP1P29466 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CASP1P29466 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
CASP1P29466 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CASP1P29466 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CASP1P29466 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CASP1P29466 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CASP1P29466 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CASP1P29466 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CASP1P29466 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CASP1P29466 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CASP1P29466 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CASP1P29466 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CASP1P29466 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CASP1P29466 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CASP1P29466 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CASP1P29466 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CASP1P29466 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CASP1P29466 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CASP1P29466 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CASP1P29466 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CASP1P29466 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CASP1P29466 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CASP1P29466 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CASP1P29466 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CASP1P29466 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CASP1P29466 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CASP1P29466 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CASP1P29466 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CASP1P29466 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CASP1P29466 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CASP1P29466 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CASP1P29466 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CASP1P29466 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CASP1P29466 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CASP1P29466 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CASP1P29466 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CASP1P29466 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CASP1P29466 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CASP1P29466 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CASP1P29466 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CASP1P29466 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CASP1P29466 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CASP1P29466 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CASP1P29466 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CASP1P29466 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CASP1P29466 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CASP1P29466 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CASP1P29466 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CASP1P29466 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CASP1P29466 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CASP1P29466 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CASP1P29466 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CASP1P29466 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CASP1P29466 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CASP1P29466 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CASP1P29466 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CASP1P29466 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CASP1P29466 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CASP1P29466 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CASP1P29466 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CASP1P29466 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CASP1P29466 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CASP1P29466 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CASP1P29466 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CASP1P29466 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CASP1P29466 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CASP1P29466 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CASP1P29466 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CASP1P29466 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CASP1P29466 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CASP1P29466 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CASP1P29466 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CASP1P29466 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
CASP1P29466 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CASP1P29466 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CASP1P29466 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CASP1P29466 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CASP1P29466 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CASP1P29466 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CASP1P29466 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CASP1P29466 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CASP1P29466 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CASP1P29466 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CASP1P29466 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CASP1P29466 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CASP1P29466 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CASP1P29466 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CASP1P29466 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CASP1P29466 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
CASP1P29466 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CASP1P29466 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CASP1P29466 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CASP1P29466 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CASP1P29466 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CASP1P29466 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CASP1P29466 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CASP1P29466 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CASP1P29466 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CASP1P29466 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms