Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.164e-6■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.064e-6■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.144e-6■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 DEF8-205ENST00000561959 558 ntTSL 513.1□□□□□ -0.314e-6■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 DEF8-227ENST00000570182 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.644e-6■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 DEF8-201ENST00000268676 3725 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.654e-6■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 DEF8-229ENST00000617948 3883 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.684e-6■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 11e-6■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 TBL1XR1-222ENST00000631253 4186 ntTSL 52.21□□□□□ -2.062e-6■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 TIAL1-211ENST00000489822 2222 ntTSL 216.15■□□□□ 0.183e-10■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 TIAL1-213ENST00000497671 2321 ntTSL 1 (best)14.5□□□□□ -0.093e-10■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 SEMA4G-201ENST00000210633 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.84e-7■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 LRP6-202ENST00000535731 562 ntTSL 318.05■□□□□ 0.483e-9■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 NDUFA10-205ENST00000414580 562 ntTSL 49.62□□□□□ -0.877e-8■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 TMEM63B-209ENST00000533121 2465 ntTSL 1 (best)15.23■□□□□ 0.033e-7■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 CCDC144NL-AS1-212ENST00000580056 521 ntTSL 414.55□□□□□ -0.084e-7■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 CCDC144NL-AS1-205ENST00000439794 481 ntTSL 313.17□□□□□ -0.34e-7■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 CCDC144NL-AS1-217ENST00000583481 710 ntTSL 38.77□□□□□ -1.014e-7■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 CCDC144NL-AS1-202ENST00000423473 839 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.074e-7■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 PCMTD2-209ENST00000609818 551 ntTSL 46.41□□□□□ -1.384e-8■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 GFPT1-201ENST00000357308 8703 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.16e-7■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.356e-7■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.311e-6■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 SLC7A2-204ENST00000494857 7622 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.111e-6■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.161e-6■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.025e-7■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 05e-7■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 EIF4G1-224ENST00000444861 2384 ntTSL 1 (best)21.52■■□□□ 1.048e-7■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 EIF4G1-236ENST00000484862 590 ntTSL 29.53□□□□□ -0.888e-7■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 SORBS3-215ENST00000522721 601 ntTSL 421.79■■□□□ 1.084e-10■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 SORBS3-202ENST00000517500 1228 ntTSL 220.04■□□□□ 0.84e-10■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 SORBS3-218ENST00000523740 983 ntTSL 319.15■□□□□ 0.664e-10■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 SORBS3-212ENST00000521787 561 ntTSL 418.4■□□□□ 0.544e-10■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 SORBS3-214ENST00000522315 563 ntTSL 416.58■□□□□ 0.244e-10■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 SORBS3-207ENST00000519453 560 ntTSL 414.17□□□□□ -0.144e-10■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 SORBS3-219ENST00000523900 670 ntTSL 313.18□□□□□ -0.34e-10■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.53e-6■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.331e-9■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 11e-9■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 NR2F1-AS1-204ENST00000510254 862 ntTSL 214.47□□□□□ -0.091e-9■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 NR2F1-AS1-213ENST00000607797 3380 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.531e-9■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 NR2F1-AS1-208ENST00000606233 2264 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.11e-9■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 NBAS-204ENST00000427792 442 ntTSL 24.2□□□□□ -1.741e-9■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.336e-8■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.046e-8■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.316e-8■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.516e-8■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 LARP4-206ENST00000518444 2853 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.546e-8■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 LARP4-204ENST00000429001 4000 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.756e-8■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.56e-8■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.736e-8■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.192e-6■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.192e-6■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.132e-6■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.072e-6■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.082e-6■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.162e-6■■■■□ 20.4
PCBP2Q15366 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.681e-6■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.041e-6■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 SRCIN1-211ENST00000612431 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)22.93■■□□□ 1.263e-7■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.012e-6■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.37e-8■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.337e-8■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.347e-8■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 TRPV1-204ENST00000425167 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.47e-8■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 TRPV1-208ENST00000574085 2644 ntTSL 212.33□□□□□ -0.447e-8■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 TRPV1-202ENST00000399756 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.847e-8■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 TRPV1-203ENST00000399759 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.937e-8■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 TPT1-AS1-221ENST00000618947 520 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.254e-8■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 ACTB-205ENST00000432588 568 ntTSL 414.9□□□□□ -0.021e-7■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 ACTB-206ENST00000443528 569 ntTSL 414.9□□□□□ -0.021e-7■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 ACTB-202ENST00000414620 561 ntTSL 414.37□□□□□ -0.111e-7■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.52e-6■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.281e-6■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.23e-7■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 LINC00963-216ENST00000623185 786 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.483e-7■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 LINC00963-217ENST00000624009 663 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.533e-7■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 LINC00963-220ENST00000625171 830 ntTSL 511.55□□□□□ -0.563e-7■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 LINC00963-202ENST00000419300 9557 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.873e-7■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 LINC00963-219ENST00000624390 472 ntTSL 57.91□□□□□ -1.143e-7■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 LINC00963-215ENST00000622972 444 ntTSL 55.55□□□□□ -1.523e-7■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 HERC2-207ENST00000564734 3121 ntTSL 1 (best)15.07■□□□□ 01e-9■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.11e-7■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.291e-7■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 ABCC10-207ENST00000463024 4542 ntTSL 212.66□□□□□ -0.381e-7■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.311e-9■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 HERC2-205ENST00000564383 471 ntTSL 36.65□□□□□ -1.341e-9■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.244e-6■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.424e-6■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 ZNF407-207ENST00000582337 5662 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.132e-6■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.292e-6■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.332e-10■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.793e-6■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 PKP4-209ENST00000479398 550 ntTSL 519.54■□□□□ 0.724e-8■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 MATR3-221ENST00000513121 573 ntTSL 217.83■□□□□ 0.443e-6■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 MATR3-208ENST00000504045 1530 ntTSL 515.84■□□□□ 0.133e-6■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 MATR3-222ENST00000513678 444 ntTSL 215.69■□□□□ 0.13e-6■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 MATR3-220ENST00000512876 575 ntTSL 315.56■□□□□ 0.083e-6■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.084e-6■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.12e-6■■■■□ 20.3
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