Protein–RNA interactions for Protein: P49643

PRIM2, DNA primase large subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM2P49643 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRIM2P49643 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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