RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585746.1

TBCB-205, Transcript of tubulin folding cofactor B, human

TSL 3 BASIC

Gene TBCB, Length 875 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBCB-205	ENST00000585746	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		44.56	■■■■■ 4.72
TBCB-205	ENST00000585746	ABCC9	O60706	1549 aa		39.73	■■■■□ 3.95
TBCB-205	ENST00000585746	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		39.73	■■■■□ 3.95
TBCB-205	ENST00000585746	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		37.81	■■■■□ 3.64
TBCB-205	ENST00000585746	NACAD	O15069	1562 aa		37.66	■■■■□ 3.62
TBCB-205	ENST00000585746	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		37.56	■■■■□ 3.6
TBCB-205	ENST00000585746	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		37.42	■■■■□ 3.58
TBCB-205	ENST00000585746	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		37.28	■■■■□ 3.56
TBCB-205	ENST00000585746	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	37.14	■■■■□ 3.54
TBCB-205	ENST00000585746	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	36.93	■■■■□ 3.5
TBCB-205	ENST00000585746	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		36.84	■■■■□ 3.49
TBCB-205	ENST00000585746	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		36.83	■■■■□ 3.49
TBCB-205	ENST00000585746	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		36.82	■■■■□ 3.48
TBCB-205	ENST00000585746	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		36.29	■■■■□ 3.4
TBCB-205	ENST00000585746	SCRIB	Q14160	1630 aa		36.22	■■■■□ 3.39
TBCB-205	ENST00000585746	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		35.86	■■■■□ 3.33
TBCB-205	ENST00000585746	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	35.84	■■■■□ 3.33
TBCB-205	ENST00000585746	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		35.8	■■■■□ 3.32
TBCB-205	ENST00000585746	NCAPD3	P42695	1498 aa		34.9	■■■■□ 3.18
TBCB-205	ENST00000585746	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		34.77	■■■■□ 3.16
TBCB-205	ENST00000585746	SMARCA4	P51532	1647 aa		34.62	■■■■□ 3.13
TBCB-205	ENST00000585746	SMARCA2	P51531	1590 aa		34.56	■■■■□ 3.12
TBCB-205	ENST00000585746	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	34.5	■■■■□ 3.11
TBCB-205	ENST00000585746	HMGXB3	Q12766	1538 aa		34.5	■■■■□ 3.11
TBCB-205	ENST00000585746	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		34.37	■■■■□ 3.09
TBCB-205	ENST00000585746	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		34.34	■■■■□ 3.09
TBCB-205	ENST00000585746	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	34.32	■■■■□ 3.08
TBCB-205	ENST00000585746	ERCC6	Q03468	1493 aa		34.21	■■■■□ 3.07
TBCB-205	ENST00000585746	NES	P48681	1621 aa		34.21	■■■■□ 3.07
TBCB-205	ENST00000585746	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		34.2	■■■■□ 3.07
TBCB-205	ENST00000585746	CUX2	O14529	1486 aa		34.19	■■■■□ 3.06
TBCB-205	ENST00000585746	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		33.91	■■■■□ 3.02
TBCB-205	ENST00000585746	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		33.84	■■■■□ 3.01
TBCB-205	ENST00000585746	WIZ	O95785	1651 aa		33.83	■■■■□ 3.01
TBCB-205	ENST00000585746	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		33.8	■■■■□ 3
TBCB-205	ENST00000585746	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	33.76	■■■□□ 2.99
TBCB-205	ENST00000585746	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	33.72	■■■□□ 2.99
TBCB-205	ENST00000585746	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		33.58	■■■□□ 2.97
TBCB-205	ENST00000585746	CFTR	P13569	1480 aa		33.45	■■■□□ 2.95
TBCB-205	ENST00000585746	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		33.44	■■■□□ 2.94
TBCB-205	ENST00000585746	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
TBCB-205	ENST00000585746	WDR62	O43379	1518 aa		33.35	■■■□□ 2.93
TBCB-205	ENST00000585746	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		33.35	■■■□□ 2.93
TBCB-205	ENST00000585746	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		33.31	■■■□□ 2.92
TBCB-205	ENST00000585746	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91
TBCB-205	ENST00000585746	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		33.18	■■■□□ 2.9
TBCB-205	ENST00000585746	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
TBCB-205	ENST00000585746	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		32.78	■■■□□ 2.84
TBCB-205	ENST00000585746	PRDM2	Q13029	1718 aa		32.77	■■■□□ 2.84
TBCB-205	ENST00000585746	TOPBP1	Q92547	1522 aa		32.74	■■■□□ 2.83
TBCB-205	ENST00000585746	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.7	■■■□□ 2.83
TBCB-205	ENST00000585746	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32.67	■■■□□ 2.82
TBCB-205	ENST00000585746	ABCC8	Q09428	1581 aa		32.67	■■■□□ 2.82
TBCB-205	ENST00000585746	TRIM41	Q8WV44	630 aa		32.59	■■■□□ 2.81
TBCB-205	ENST00000585746	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		32.56	■■■□□ 2.8
TBCB-205	ENST00000585746	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	32.42	■■■□□ 2.78	3e-6	■■□□□ 14.3
TBCB-205	ENST00000585746	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
TBCB-205	ENST00000585746	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
TBCB-205	ENST00000585746	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		32.33	■■■□□ 2.77
TBCB-205	ENST00000585746	SOGA1	O94964	1423 aa		32.33	■■■□□ 2.77
TBCB-205	ENST00000585746	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.32	■■■□□ 2.77
TBCB-205	ENST00000585746	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	32.32	■■■□□ 2.76
TBCB-205	ENST00000585746	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
TBCB-205	ENST00000585746	CUX1	P39880	1505 aa		32.23	■■■□□ 2.75
TBCB-205	ENST00000585746	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		32.2	■■■□□ 2.75
TBCB-205	ENST00000585746	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TBCB-205	ENST00000585746	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TBCB-205	ENST00000585746	FBLN2	P98095	1184 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TBCB-205	ENST00000585746	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TBCB-205	ENST00000585746	ARHGEF11	O15085	1522 aa		32.11	■■■□□ 2.73
TBCB-205	ENST00000585746	WDR97	A6NE52	1622 aa		32.02	■■■□□ 2.72
TBCB-205	ENST00000585746	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		31.99	■■■□□ 2.71
TBCB-205	ENST00000585746	CHD1	O14646	1710 aa		31.99	■■■□□ 2.71
TBCB-205	ENST00000585746	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		31.98	■■■□□ 2.71
TBCB-205	ENST00000585746	GRIN2B	Q13224	1484 aa		31.97	■■■□□ 2.71
TBCB-205	ENST00000585746	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
TBCB-205	ENST00000585746	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	31.93	■■■□□ 2.7
TBCB-205	ENST00000585746	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		31.91	■■■□□ 2.7
TBCB-205	ENST00000585746	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		31.9	■■■□□ 2.7
TBCB-205	ENST00000585746	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		31.88	■■■□□ 2.69
TBCB-205	ENST00000585746	SYNJ2	O15056	1496 aa		31.84	■■■□□ 2.69
TBCB-205	ENST00000585746	ARAP1	Q96P48	1450 aa		31.84	■■■□□ 2.69
TBCB-205	ENST00000585746	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	31.81	■■■□□ 2.68
TBCB-205	ENST00000585746	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		31.8	■■■□□ 2.68
TBCB-205	ENST00000585746	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		31.73	■■■□□ 2.67
TBCB-205	ENST00000585746	SYNJ1	O43426	1573 aa		31.71	■■■□□ 2.67
TBCB-205	ENST00000585746	TOP2B	Q02880	1626 aa		31.7	■■■□□ 2.66
TBCB-205	ENST00000585746	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		31.64	■■■□□ 2.66
TBCB-205	ENST00000585746	PBRM1	Q86U86	1689 aa		31.63	■■■□□ 2.65
TBCB-205	ENST00000585746	GRIN2A	Q12879	1464 aa		31.54	■■■□□ 2.64
TBCB-205	ENST00000585746	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		31.5	■■■□□ 2.63
TBCB-205	ENST00000585746	NUP160	Q12769	1436 aa		31.5	■■■□□ 2.63
TBCB-205	ENST00000585746	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	31.48	■■■□□ 2.63
TBCB-205	ENST00000585746	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		31.45	■■■□□ 2.63
TBCB-205	ENST00000585746	ADAMTS12	P58397	1594 aa		31.45	■■■□□ 2.63
TBCB-205	ENST00000585746	CEP170	Q5SW79	1584 aa		31.39	■■■□□ 2.62
TBCB-205	ENST00000585746	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		31.34	■■■□□ 2.61
TBCB-205	ENST00000585746	IGF1R	P08069	1367 aa		31.28	■■■□□ 2.6
TBCB-205	ENST00000585746	JPH4	Q96JJ6	628 aa		31.27	■■■□□ 2.6
TBCB-205	ENST00000585746	SHROOM2	Q13796	1616 aa		31.24	■■■□□ 2.59

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