RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42■■■■■ 4.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.28■■■■□ 3.56
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABCC9O60706 1549 aa36.79■■■■□ 3.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.1■■■■□ 3.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.09■■■■□ 3.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NACADO15069 1562 aa35.07■■■■□ 3.2
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.19
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.9■■■■□ 3.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.76■■■■□ 3.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.76■■■■□ 3.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.26■■■■□ 3.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.2■■■■□ 3.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.06■■■■□ 3.04
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SCRIBQ14160 1630 aa34.04■■■■□ 3.04
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.74■■■□□ 2.99
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.28■■■□□ 2.92
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.18■■■□□ 2.9
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.17■■■□□ 2.9
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.57■■■□□ 2.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SMARCA4P51532 1647 aa32.56■■■□□ 2.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.39■■■□□ 2.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SMARCA2P51531 1590 aa32.37■■■□□ 2.77
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NCAPD3P42695 1498 aa32.36■■■□□ 2.77
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.36■■■□□ 2.77
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.24■■■□□ 2.75
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HMGXB3Q12766 1538 aa32.22■■■□□ 2.75
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.02■■■□□ 2.72
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WIZO95785 1651 aa31.98■■■□□ 2.71
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CUX2O14529 1486 aa31.84■■■□□ 2.69
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ERCC6Q03468 1493 aa31.72■■■□□ 2.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.66
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NESP48681 1621 aa31.59■■■□□ 2.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.5■■■□□ 2.63
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.44■■■□□ 2.62
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.32■■■□□ 2.61
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.3■■■□□ 2.6
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CFTRP13569 1480 aa31.26■■■□□ 2.59
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.19■■■□□ 2.58
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.08■■■□□ 2.57
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.05■■■□□ 2.56
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.99■■■□□ 2.55
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRDM2Q13029 1718 aa30.93■■■□□ 2.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WDR62O43379 1518 aa30.88■■■□□ 2.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABCC8Q09428 1581 aa30.6■■■□□ 2.49
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TOPBP1Q92547 1522 aa30.57■■■□□ 2.49
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.54■■■□□ 2.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IFT140Q96RY7 1462 aa30.39■■■□□ 2.46
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRIM41Q8WV44 630 aa30.39■■■□□ 2.46
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CUX1P39880 1505 aa30.36■■■□□ 2.45
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OSCARQ8IYS5 282 aa30.3■■■□□ 2.44
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.26■■■□□ 2.44
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.22■■■□□ 2.43
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SOGA1O94964 1423 aa30.21■■■□□ 2.43
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.18■■■□□ 2.42
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TOP2BQ02880 1626 aa30.11■■■□□ 2.41
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SYNJ1O43426 1573 aa30.1■■■□□ 2.41
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.08■■■□□ 2.41
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.06■■■□□ 2.4
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WDR97A6NE52 1622 aa30.01■■■□□ 2.39
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.97■■■□□ 2.39
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.96■■■□□ 2.39
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.96■■■□□ 2.39
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.96■■■□□ 2.39
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.87■■■□□ 2.37
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GRIN2BQ13224 1484 aa29.86■■■□□ 2.37
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARHGEF11O15085 1522 aa29.86■■■□□ 2.37
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.82■■■□□ 2.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.81■■■□□ 2.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHD1O14646 1710 aa29.75■■■□□ 2.35
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PBRM1Q86U86 1689 aa29.73■■■□□ 2.35
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FBLN2P98095 1184 aa29.72■■■□□ 2.35
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SYNJ2O15056 1496 aa29.66■■■□□ 2.34
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.62■■■□□ 2.33
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIF27Q86VH2 1401 aa29.6■■■□□ 2.33
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADAMTS12P58397 1594 aa29.56■■■□□ 2.32
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.56■■■□□ 2.32
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARAP1Q96P48 1450 aa29.55■■■□□ 2.32
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.54■■■□□ 2.32
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GRIN2AQ12879 1464 aa29.48■■■□□ 2.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.45■■■□□ 2.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IGF1RP08069 1367 aa29.42■■■□□ 2.3
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CUL7Q14999 1698 aa29.35■■■□□ 2.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NUP160Q12769 1436 aa29.34■■■□□ 2.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CEP170Q5SW79 1584 aa29.29■■■□□ 2.28
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.27■■■□□ 2.28
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.27■■■□□ 2.28
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms