Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGY1

NOL12, Nucleolar protein 12, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL12Q9UGY1 MCF2L-202ENST00000375597 3413 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.144e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 GGA2-201ENST00000309859 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.294e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 MCF2L-220ENST00000464800 720 ntTSL 212.48□□□□□ -0.414e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 SLC6A8-205ENST00000442457 523 ntTSL 311.26□□□□□ -0.614e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 CKAP4-202ENST00000552828 831 ntTSL 311.07□□□□□ -0.644e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 TMEM2-205ENST00000377066 5217 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.764e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 ORM1-202ENST00000477456 422 ntTSL 29.7□□□□□ -0.869e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 TMEM2-210ENST00000542935 5372 ntTSL 1 (best)9.15□□□□□ -0.954e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 AP1G2-210ENST00000554312 635 ntTSL 28.58□□□□□ -1.044e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 ORM1-201ENST00000259396 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.19e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 TMEM2-203ENST00000377055 722 ntTSL 37.4□□□□□ -1.224e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 GGA2-209ENST00000567201 576 ntTSL 46.24□□□□□ -1.414e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 TMEM2-201ENST00000377043 675 ntTSL 26.04□□□□□ -1.444e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 CKAP4-203ENST00000553039 573 ntTSL 44.67□□□□□ -1.664e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 TMEM2-208ENST00000537329 581 ntTSL 24.17□□□□□ -1.744e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 CABIN1-209ENST00000474981 426 ntTSL 21.61□□□□□ -2.154e-7■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.881e-6■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 AL355987.2-201ENST00000471502 561 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.471e-6■■□□□ 14
NOL12Q9UGY1 ATP13A1-207ENST00000473243 4729 ntTSL 216.57■□□□□ 0.244e-6■■□□□ 13.9
NOL12Q9UGY1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.735e-6■■□□□ 13.9
NOL12Q9UGY1 LRP1-201ENST00000243077 14897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.731e-6■■□□□ 13.9
NOL12Q9UGY1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.112e-22■■□□□ 13.8
NOL12Q9UGY1 TSR1-203ENST00000575049 387 ntTSL 35.86□□□□□ -1.472e-22■■□□□ 13.8
NOL12Q9UGY1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.771e-7■■□□□ 13.8
NOL12Q9UGY1 COL27A1-205ENST00000485397 463 ntTSL 516.86■□□□□ 0.297e-20■■□□□ 13.8
NOL12Q9UGY1 AGRN-209ENST00000492947 690 ntTSL 215.66■□□□□ 0.11e-7■■□□□ 13.8
NOL12Q9UGY1 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.125e-7■■□□□ 13.8
NOL12Q9UGY1 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.155e-7■■□□□ 13.8
NOL12Q9UGY1 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.175e-7■■□□□ 13.8
NOL12Q9UGY1 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.335e-7■■□□□ 13.8
NOL12Q9UGY1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.022e-8■■□□□ 13.7
NOL12Q9UGY1 ATG4B-217ENST00000475693 2237 ntTSL 219.16■□□□□ 0.662e-8■■□□□ 13.7
NOL12Q9UGY1 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.542e-8■■□□□ 13.7
NOL12Q9UGY1 ATG4B-225ENST00000494465 2365 ntTSL 518.01■□□□□ 0.472e-8■■□□□ 13.7
NOL12Q9UGY1 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.462e-8■■□□□ 13.7
NOL12Q9UGY1 ATG4B-220ENST00000482507 2414 ntTSL 1 (best)17.18■□□□□ 0.342e-8■■□□□ 13.7
NOL12Q9UGY1 ATG4B-201ENST00000344376 1566 ntTSL 514.89□□□□□ -0.032e-8■■□□□ 13.7
NOL12Q9UGY1 FGFR3-206ENST00000469068 821 ntTSL 314.48□□□□□ -0.093e-6■■□□□ 13.7
NOL12Q9UGY1 ATG4B-224ENST00000494132 828 ntTSL 213.77□□□□□ -0.212e-8■■□□□ 13.7
NOL12Q9UGY1 SLC12A4-215ENST00000575857 588 ntTSL 310.52□□□□□ -0.732e-8■■□□□ 13.7
NOL12Q9UGY1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.831e-7■■□□□ 13.7
NOL12Q9UGY1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.541e-7■■□□□ 13.7
NOL12Q9UGY1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.423e-7■■□□□ 13.7
NOL12Q9UGY1 PTPRS-206ENST00000588552 5443 ntTSL 1 (best)17.25■□□□□ 0.353e-7■■□□□ 13.7
NOL12Q9UGY1 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.053e-7■■□□□ 13.7
NOL12Q9UGY1 PTPRS-202ENST00000353284 4518 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.163e-7■■□□□ 13.7
NOL12Q9UGY1 PTPRS-201ENST00000262963 4766 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.233e-7■■□□□ 13.7
NOL12Q9UGY1 PTPRS-210ENST00000592099 4766 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.233e-7■■□□□ 13.7
NOL12Q9UGY1 SLC16A3-216ENST00000583025 955 ntTSL 218.08■□□□□ 0.482e-8■■□□□ 13.6
NOL12Q9UGY1 COL18A1-201ENST00000342220 3386 ntTSL 214.71□□□□□ -0.052e-9■■□□□ 13.6
NOL12Q9UGY1 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.113e-6■■□□□ 13.6
NOL12Q9UGY1 VEGFA-211ENST00000476772 1683 ntTSL 1 (best)30.27■■■□□ 2.444e-9■■□□□ 13.6
NOL12Q9UGY1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.655e-6■■□□□ 13.6
NOL12Q9UGY1 GAA-207ENST00000573556 756 ntTSL 218.02■□□□□ 0.484e-7■■□□□ 13.6
NOL12Q9UGY1 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.285e-6■■□□□ 13.6
NOL12Q9UGY1 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.165e-6■■□□□ 13.6
NOL12Q9UGY1 CCDC183-207ENST00000496839 744 ntTSL 514.48□□□□□ -0.097e-7■■□□□ 13.6
NOL12Q9UGY1 GAA-202ENST00000390015 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.214e-7■■□□□ 13.6
NOL12Q9UGY1 GAA-201ENST00000302262 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.274e-7■■□□□ 13.6
NOL12Q9UGY1 LAMB2-211ENST00000483321 408 ntTSL 310.72□□□□□ -0.696e-6■■□□□ 13.6
NOL12Q9UGY1 COL27A1-207ENST00000494090 5329 ntTSL 1 (best)21.63■■□□□ 1.051e-9■■□□□ 13.6
NOL12Q9UGY1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.85e-6■■□□□ 13.6
NOL12Q9UGY1 CLU-208ENST00000521770 520 ntTSL 28.55□□□□□ -1.041e-8■■□□□ 13.6
NOL12Q9UGY1 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.133e-6■■□□□ 13.5
NOL12Q9UGY1 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.113e-6■■□□□ 13.5
NOL12Q9UGY1 ZFAS1-207ENST00000458653 596 ntTSL 226.71■■□□□ 1.871e-323■■□□□ 13.5
NOL12Q9UGY1 ZFAS1-202ENST00000371743 1008 ntTSL 1 (best)22.87■■□□□ 1.251e-323■■□□□ 13.5
NOL12Q9UGY1 ZFAS1-203ENST00000417721 860 ntTSL 1 (best)20.79■□□□□ 0.921e-323■■□□□ 13.5
NOL12Q9UGY1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.911e-323■■□□□ 13.5
NOL12Q9UGY1 ZFAS1-205ENST00000441722 946 ntTSL 1 (best)20.73■□□□□ 0.911e-323■■□□□ 13.5
NOL12Q9UGY1 ZFAS1-210ENST00000623640 732 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.711e-323■■□□□ 13.5
NOL12Q9UGY1 ZFAS1-209ENST00000620594 508 ntTSL 37.64□□□□□ -1.191e-323■■□□□ 13.5
NOL12Q9UGY1 ZFAS1-204ENST00000428008 566 ntTSL 26.69□□□□□ -1.341e-323■■□□□ 13.5
NOL12Q9UGY1 ZFAS1-201ENST00000326677 504 ntTSL 1 (best)5.71□□□□□ -1.51e-323■■□□□ 13.5
NOL12Q9UGY1 MED24-225ENST00000580885 1963 ntTSL 519.61■□□□□ 0.732e-9■■□□□ 13.5
NOL12Q9UGY1 MED24-213ENST00000535071 2441 ntTSL 518.52■□□□□ 0.552e-9■■□□□ 13.5
NOL12Q9UGY1 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.042e-9■■□□□ 13.5
NOL12Q9UGY1 MED24-214ENST00000535508 3334 ntTSL 215.22■□□□□ 0.032e-9■■□□□ 13.5
NOL12Q9UGY1 MED24-201ENST00000356271 3446 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.12e-9■■□□□ 13.5
NOL12Q9UGY1 MED24-203ENST00000394127 3456 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.132e-9■■□□□ 13.5
NOL12Q9UGY1 MED24-212ENST00000501516 3037 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.182e-9■■□□□ 13.5
NOL12Q9UGY1 MED24-202ENST00000394126 3896 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.362e-9■■□□□ 13.5
NOL12Q9UGY1 MED24-219ENST00000578901 728 ntTSL 1 (best)6.78□□□□□ -1.322e-9■■□□□ 13.5
NOL12Q9UGY1 MED24-234ENST00000614384 454 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.332e-9■■□□□ 13.5
NOL12Q9UGY1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.881e-7■■□□□ 13.5
NOL12Q9UGY1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.113e-8■■□□□ 13.5
NOL12Q9UGY1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.362e-10■■□□□ 13.5
NOL12Q9UGY1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.762e-10■■□□□ 13.5
NOL12Q9UGY1 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.082e-10■■□□□ 13.5
NOL12Q9UGY1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.741e-9■■□□□ 13.5
NOL12Q9UGY1 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.34e-6■■□□□ 13.5
NOL12Q9UGY1 ATP13A1-201ENST00000291503 3483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.384e-6■■□□□ 13.5
NOL12Q9UGY1 TMEM94-206ENST00000577380 554 ntTSL 423.39■■□□□ 1.334e-16■■□□□ 13.4
NOL12Q9UGY1 TMEM94-224ENST00000582186 565 ntTSL 420.39■□□□□ 0.854e-16■■□□□ 13.4
NOL12Q9UGY1 TMEM94-225ENST00000582455 564 ntTSL 416.6■□□□□ 0.254e-16■■□□□ 13.4
NOL12Q9UGY1 TMEM94-233ENST00000585277 581 ntTSL 316.54■□□□□ 0.244e-16■■□□□ 13.4
NOL12Q9UGY1 TMEM94-222ENST00000581834 484 ntTSL 311.52□□□□□ -0.574e-16■■□□□ 13.4
NOL12Q9UGY1 NOTUM-204ENST00000489218 972 ntTSL 217.77■□□□□ 0.442e-63■■□□□ 13.4
NOL12Q9UGY1 CFB-271ENST00000425368 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.344e-6■■□□□ 13.4
NOL12Q9UGY1 PTPRF-213ENST00000481019 459 ntTSL 312.1□□□□□ -0.471e-10■■□□□ 13.4
Retrieved 100 of 4,605 protein–RNA pairs in 273 ms