Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 RPS3-202ENST00000422465 903 ntTSL 211.94□□□□□ -0.52e-7■■■■■ 33.7
AATFQ9NY61 RPS3-203ENST00000524851 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 33.7
AATFQ9NY61 RPS3-207ENST00000526608 710 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 33.7
AATFQ9NY61 RPL23A-207ENST00000578181 593 ntTSL 23.92□□□□□ -1.785e-28■■■■■ 33.6
AATFQ9NY61 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.3□□□□□ -2.21e-323■■■■■ 33.4
AATFQ9NY61 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.462e-10■■■■■ 33
AATFQ9NY61 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.791e-6■■■■■ 32.9
AATFQ9NY61 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.762e-6■■■■■ 32.9
AATFQ9NY61 LINC02001-201ENST00000592381 1298 ntTSL 218.17■□□□□ 0.51e-28■■■■■ 32.9
AATFQ9NY61 LINC02001-202ENST00000638682 1504 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.291e-28■■■■■ 32.9
AATFQ9NY61 RXRA-203ENST00000484822 5215 ntTSL 216.58■□□□□ 0.243e-6■■■■■ 32.8
AATFQ9NY61 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.982e-7■■■■■ 32.8
AATFQ9NY61 PRPF39-202ENST00000424478 3174 ntTSL 216.21■□□□□ 0.192e-7■■■■■ 32.8
AATFQ9NY61 PRPF39-203ENST00000477626 3507 ntTSL 214.32□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 32.8
AATFQ9NY61 PRPF39-205ENST00000554081 3223 ntTSL 53.06□□□□□ -1.922e-7■■■■■ 32.8
AATFQ9NY61 PRPF39-206ENST00000554429 2977 ntTSL 52.98□□□□□ -1.932e-7■■■■■ 32.8
AATFQ9NY61 PRPF39-207ENST00000554439 2982 ntTSL 52.84□□□□□ -1.952e-7■■■■■ 32.8
AATFQ9NY61 PRPF39-208ENST00000554785 2121 ntTSL 21.39□□□□□ -2.192e-7■■■■■ 32.8
AATFQ9NY61 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.432e-7■■■■■ 32.8
AATFQ9NY61 TBRG4-214ENST00000488222 972 ntTSL 321.08■□□□□ 0.972e-58■■■■■ 32.8
AATFQ9NY61 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.82e-58■■■■■ 32.8
AATFQ9NY61 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.712e-58■■■■■ 32.8
AATFQ9NY61 TBRG4-213ENST00000484326 835 ntTSL 218.79■□□□□ 0.62e-58■■■■■ 32.8
AATFQ9NY61 TBRG4-204ENST00000461363 856 ntTSL 218.79■□□□□ 0.62e-58■■■■■ 32.8
AATFQ9NY61 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.552e-58■■■■■ 32.8
AATFQ9NY61 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.372e-58■■■■■ 32.8
AATFQ9NY61 TBRG4-209ENST00000478532 945 ntTSL 515.72■□□□□ 0.112e-58■■■■■ 32.8
AATFQ9NY61 TBRG4-217ENST00000495973 3409 ntTSL 1 (best)13□□□□□ -0.332e-58■■■■■ 32.8
AATFQ9NY61 ACAP3-208ENST00000472541 1946 ntTSL 523.13■■□□□ 1.292e-6■■■■■ 32.7
AATFQ9NY61 RPS3-205ENST00000525933 1307 ntTSL 512.79□□□□□ -0.361e-323■■■■■ 32.6
AATFQ9NY61 RPS3-204ENST00000525690 421 ntTSL 311.99□□□□□ -0.491e-323■■■■■ 32.6
AATFQ9NY61 RPS3-215ENST00000530170 531 ntTSL 510.51□□□□□ -0.731e-323■■■■■ 32.6
AATFQ9NY61 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.73□□□□□ -1.811e-323■■■■■ 32.6
AATFQ9NY61 RPL3-206ENST00000453303 916 ntTSL 516.18■□□□□ 0.181e-323■■■■■ 32.5
AATFQ9NY61 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.081e-39■■■■■ 32.3
AATFQ9NY61 NOP56-216ENST00000492135 1143 ntTSL 1 (best)17.39■□□□□ 0.371e-39■■■■■ 32.3
AATFQ9NY61 NOP56-220ENST00000616692 2662 ntTSL 1 (best)17.13■□□□□ 0.331e-39■■■■■ 32.3
AATFQ9NY61 NOP56-219ENST00000612233 2980 nt15.82■□□□□ 0.121e-39■■■■■ 32.3
AATFQ9NY61 NOP56-206ENST00000466447 1094 ntTSL 214.54□□□□□ -0.081e-39■■■■■ 32.3
AATFQ9NY61 NOP56-215ENST00000490753 640 ntTSL 211.92□□□□□ -0.51e-39■■■■■ 32.3
AATFQ9NY61 NOP56-202ENST00000415272 1628 ntTSL 511.63□□□□□ -0.551e-39■■■■■ 32.3
AATFQ9NY61 NOP56-207ENST00000467196 1320 ntTSL 510.56□□□□□ -0.721e-39■■■■■ 32.3
AATFQ9NY61 NOP56-211ENST00000471023 592 ntTSL 28.98□□□□□ -0.971e-39■■■■■ 32.3
AATFQ9NY61 NOP56-212ENST00000480447 651 ntTSL 27.61□□□□□ -1.191e-39■■■■■ 32.3
AATFQ9NY61 RPL4-204ENST00000563473 475 ntTSL 36.98□□□□□ -1.291e-323■■■■■ 32.2
AATFQ9NY61 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.81e-323■■■■■ 32.2
AATFQ9NY61 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.61e-45■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 RANBP1-210ENST00000435265 1879 ntTSL 223.32■■□□□ 1.321e-45■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 RANBP1-207ENST00000423859 832 ntTSL 322.4■■□□□ 1.181e-45■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 RANBP1-205ENST00000418705 932 ntTSL 320.25■□□□□ 0.831e-45■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 RANBP1-203ENST00000411892 584 ntTSL 218.05■□□□□ 0.481e-45■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 RANBP1-211ENST00000448394 688 ntTSL 217.6■□□□□ 0.411e-45■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.411e-45■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.331e-45■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 CPSF1-205ENST00000531042 580 ntTSL 519.35■□□□□ 0.694e-12■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.554e-12■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.114e-12■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 RPL4-207ENST00000564647 1110 ntTSL 26.65□□□□□ -1.343e-57■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.786e-6■■■■■ 31.9
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AATFQ9NY61 RPS7-205ENST00000462576 907 ntTSL 1 (best)32.31■■■□□ 2.763e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.636e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 DENND1B-207ENST00000468589 2141 ntTSL 1 (best)29.19■■■□□ 2.263e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 CLCN7-204ENST00000561665 561 ntTSL 427.6■■■□□ 2.013e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 ZBTB7B-206ENST00000487542 873 ntTSL 227.28■■□□□ 1.963e-6■■■■■ 31.9
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AATFQ9NY61 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.833e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 GADD45A-204ENST00000484245 688 ntTSL 1 (best)26.14■■□□□ 1.783e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 CLCN7-210ENST00000566812 434 ntTSL 425.54■■□□□ 1.683e-6■■■■■ 31.9
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AATFQ9NY61 NDUFS7-220ENST00000622587 802 ntTSL 522.32■■□□□ 1.163e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 ABHD17A-203ENST00000588598 5425 ntTSL 221.97■■□□□ 1.116e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.093e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.083e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 DENND1B-205ENST00000422998 583 ntTSL 321.71■■□□□ 1.073e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 NDUFS7-215ENST00000546172 869 ntTSL 521.69■■□□□ 1.063e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.046e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 INTS11-242ENST00000531377 816 ntTSL 521.44■■□□□ 1.023e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 NDUFS7-212ENST00000540530 1707 ntTSL 221.37■■□□□ 1.013e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 DENND1B-202ENST00000294737 3043 ntTSL 221.32■■□□□ 13e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 NDUFS7-207ENST00000538523 931 ntTSL 221.27■■□□□ 13e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.993e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 NDUFS7-213ENST00000543289 3356 ntTSL 221.12■□□□□ 0.973e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 NDUFS7-211ENST00000539882 555 ntTSL 420.5■□□□□ 0.873e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.843e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.833e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 ABHD17A-205ENST00000591351 4647 ntTSL 220.1■□□□□ 0.816e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 CLCN7-214ENST00000569851 1014 ntTSL 519.44■□□□□ 0.73e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 RPS7-207ENST00000479123 511 ntTSL 1 (best)19.34■□□□□ 0.693e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.683e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 ARAP1-218ENST00000543868 507 ntTSL 219.13■□□□□ 0.653e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.633e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.633e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.583e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 NDUFS7-205ENST00000534853 745 ntTSL 518.65■□□□□ 0.583e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 NDUFS7-208ENST00000538662 1186 ntTSL 218.53■□□□□ 0.563e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.533e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 ARAP1-216ENST00000542596 699 ntTSL 518.02■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 31.9
AATFQ9NY61 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.02■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 31.9
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