RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492135.5

NOP56-216, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NOP56, Length 1,143 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-216ENST00000492135 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.92■■■■□ 3.18
NOP56-216ENST00000492135 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.05■■■□□ 2.56
NOP56-216ENST00000492135 ABCC9O60706 1549 aa30.39■■■□□ 2.46
NOP56-216ENST00000492135 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.19■■■□□ 2.26
NOP56-216ENST00000492135 NACADO15069 1562 aa29.16■■■□□ 2.26
NOP56-216ENST00000492135 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.1■■■□□ 2.25
NOP56-216ENST00000492135 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
NOP56-216ENST00000492135 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.97■■■□□ 2.23
NOP56-216ENST00000492135 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.87■■■□□ 2.21
NOP56-216ENST00000492135 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.66■■■□□ 2.18
NOP56-216ENST00000492135 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.41■■■□□ 2.14
NOP56-216ENST00000492135 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.39■■■□□ 2.141e-6■■□□□ 13.9
NOP56-216ENST00000492135 SCRIBQ14160 1630 aa28.36■■■□□ 2.13
NOP56-216ENST00000492135 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.97■■■□□ 2.07
NOP56-216ENST00000492135 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.96■■■□□ 2.07
NOP56-216ENST00000492135 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
NOP56-216ENST00000492135 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.51■■□□□ 1.99
NOP56-216ENST00000492135 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.28■■□□□ 1.96
NOP56-216ENST00000492135 SMARCA4P51532 1647 aa27.11■■□□□ 1.93
NOP56-216ENST00000492135 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
NOP56-216ENST00000492135 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.95■■□□□ 1.91
NOP56-216ENST00000492135 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.95■■□□□ 1.9
NOP56-216ENST00000492135 NCAPD3P42695 1498 aa26.92■■□□□ 1.9
NOP56-216ENST00000492135 SMARCA2P51531 1590 aa26.88■■□□□ 1.89
NOP56-216ENST00000492135 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.84■■□□□ 1.89
NOP56-216ENST00000492135 HMGXB3Q12766 1538 aa26.79■■□□□ 1.88
NOP56-216ENST00000492135 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
NOP56-216ENST00000492135 WIZO95785 1651 aa26.66■■□□□ 1.86
NOP56-216ENST00000492135 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
NOP56-216ENST00000492135 NESP48681 1621 aa26.34■■□□□ 1.81
NOP56-216ENST00000492135 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
NOP56-216ENST00000492135 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.2■■□□□ 1.79
NOP56-216ENST00000492135 ERCC6Q03468 1493 aa26.13■■□□□ 1.77
NOP56-216ENST00000492135 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.11■■□□□ 1.77
NOP56-216ENST00000492135 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.04■■□□□ 1.76
NOP56-216ENST00000492135 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.03■■□□□ 1.76
NOP56-216ENST00000492135 CFTRP13569 1480 aa25.98■■□□□ 1.75
NOP56-216ENST00000492135 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.98■■□□□ 1.75
NOP56-216ENST00000492135 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
NOP56-216ENST00000492135 CUX2O14529 1486 aa25.87■■□□□ 1.73
NOP56-216ENST00000492135 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
NOP56-216ENST00000492135 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.83■■□□□ 1.73
NOP56-216ENST00000492135 PRDM2Q13029 1718 aa25.83■■□□□ 1.72
NOP56-216ENST00000492135 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.79■■□□□ 1.72
NOP56-216ENST00000492135 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.77■■□□□ 1.72
NOP56-216ENST00000492135 WDR62O43379 1518 aa25.7■■□□□ 1.7
NOP56-216ENST00000492135 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
NOP56-216ENST00000492135 TOPBP1Q92547 1522 aa25.44■■□□□ 1.66
NOP56-216ENST00000492135 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.4■■□□□ 1.66
NOP56-216ENST00000492135 ABCC8Q09428 1581 aa25.35■■□□□ 1.65
NOP56-216ENST00000492135 CUX1P39880 1505 aa25.27■■□□□ 1.64
NOP56-216ENST00000492135 IFT140Q96RY7 1462 aa25.24■■□□□ 1.63
NOP56-216ENST00000492135 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
NOP56-216ENST00000492135 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
NOP56-216ENST00000492135 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
NOP56-216ENST00000492135 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.16■■□□□ 1.62
NOP56-216ENST00000492135 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.14■■□□□ 1.61
NOP56-216ENST00000492135 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.1■■□□□ 1.61
NOP56-216ENST00000492135 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
NOP56-216ENST00000492135 SOGA1O94964 1423 aa25.08■■□□□ 1.61
NOP56-216ENST00000492135 SYNJ1O43426 1573 aa25.06■■□□□ 1.6
NOP56-216ENST00000492135 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.04■■□□□ 1.6
NOP56-216ENST00000492135 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
NOP56-216ENST00000492135 TOP2BQ02880 1626 aa25.03■■□□□ 1.6
NOP56-216ENST00000492135 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.02■■□□□ 1.62e-16■■■■□ 23.9
NOP56-216ENST00000492135 WDR97A6NE52 1622 aa25.01■■□□□ 1.59
NOP56-216ENST00000492135 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
NOP56-216ENST00000492135 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.91■■□□□ 1.58
NOP56-216ENST00000492135 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.84■■□□□ 1.57
NOP56-216ENST00000492135 PBRM1Q86U86 1689 aa24.81■■□□□ 1.56
NOP56-216ENST00000492135 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.8■■□□□ 1.56
NOP56-216ENST00000492135 CHD1O14646 1710 aa24.8■■□□□ 1.56
NOP56-216ENST00000492135 GRIN2BQ13224 1484 aa24.79■■□□□ 1.56
NOP56-216ENST00000492135 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.79■■□□□ 1.56
NOP56-216ENST00000492135 OSCARQ8IYS5 282 aa24.77■■□□□ 1.56
NOP56-216ENST00000492135 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
NOP56-216ENST00000492135 FBLN2P98095 1184 aa24.65■■□□□ 1.54
NOP56-216ENST00000492135 SYNJ2O15056 1496 aa24.64■■□□□ 1.53
NOP56-216ENST00000492135 ADAMTS12P58397 1594 aa24.6■■□□□ 1.53
NOP56-216ENST00000492135 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.59■■□□□ 1.53
NOP56-216ENST00000492135 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
NOP56-216ENST00000492135 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.51■■□□□ 1.51
NOP56-216ENST00000492135 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.5■■□□□ 1.51
NOP56-216ENST00000492135 KIF27Q86VH2 1401 aa24.5■■□□□ 1.51
NOP56-216ENST00000492135 GRIN2AQ12879 1464 aa24.49■■□□□ 1.51
NOP56-216ENST00000492135 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.47■■□□□ 1.51
NOP56-216ENST00000492135 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.47■■□□□ 1.51
NOP56-216ENST00000492135 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.47■■□□□ 1.51
NOP56-216ENST00000492135 IGF1RP08069 1367 aa24.44■■□□□ 1.5
NOP56-216ENST00000492135 ARHGEF11O15085 1522 aa24.44■■□□□ 1.5
NOP56-216ENST00000492135 CEP170Q5SW79 1584 aa24.42■■□□□ 1.5
NOP56-216ENST00000492135 TRIM41Q8WV44 630 aa24.4■■□□□ 1.5
NOP56-216ENST00000492135 NUP160Q12769 1436 aa24.4■■□□□ 1.5
NOP56-216ENST00000492135 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.39■■□□□ 1.49
NOP56-216ENST00000492135 CUL7Q14999 1698 aa24.37■■□□□ 1.49
NOP56-216ENST00000492135 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.28■■□□□ 1.48
NOP56-216ENST00000492135 ARAP1Q96P48 1450 aa24.27■■□□□ 1.48
NOP56-216ENST00000492135 SHROOM2Q13796 1616 aa24.24■■□□□ 1.47
NOP56-216ENST00000492135 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.22■■□□□ 1.47
NOP56-216ENST00000492135 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.17■■□□□ 1.46
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