Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.592e-7■■■■■ 49.4
DKC1O60832 SEPT6-206ENST00000460411 1393 ntTSL 224.19■■□□□ 1.466e-11■■■■■ 49.4
DKC1O60832 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.376e-11■■■■■ 49.4
DKC1O60832 AC007388.1-202ENST00000443038 522 ntTSL 423.53■■□□□ 1.367e-21■■■■■ 49.4
DKC1O60832 AC007388.1-203ENST00000422128 596 ntTSL 422.86■■□□□ 1.257e-21■■■■■ 49.4
DKC1O60832 XIAP-207ENST00000468691 764 ntTSL 521.73■■□□□ 1.077e-9■■■■■ 49.4
DKC1O60832 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.067e-21■■■■■ 49.4
DKC1O60832 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.946e-11■■■■■ 49.4
DKC1O60832 XIAP-210ENST00000497640 533 ntTSL 1 (best)20.62■□□□□ 0.897e-9■■■■■ 49.4
DKC1O60832 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.66e-11■■■■■ 49.4
DKC1O60832 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.477e-21■■■■■ 49.4
DKC1O60832 XIAP-211ENST00000497906 495 ntTSL 517.84■□□□□ 0.457e-9■■■■■ 49.4
DKC1O60832 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.416e-11■■■■■ 49.4
DKC1O60832 BCRP3-201ENST00000447261 1457 ntTSL 217.59■□□□□ 0.416e-11■■■■■ 49.4
DKC1O60832 CTDSP2-202ENST00000547169 1340 ntTSL 217.55■□□□□ 0.47e-21■■■■■ 49.4
DKC1O60832 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.336e-11■■■■■ 49.4
DKC1O60832 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.336e-11■■■■■ 49.4
DKC1O60832 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.36e-11■■■■■ 49.4
DKC1O60832 XIAP-208ENST00000481776 598 ntTSL 516.64■□□□□ 0.257e-9■■■■■ 49.4
DKC1O60832 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.157e-21■■■■■ 49.4
DKC1O60832 AC007388.1-205ENST00000445520 499 ntTSL 215.68■□□□□ 0.17e-21■■■■■ 49.4
DKC1O60832 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.026e-11■■■■■ 49.4
DKC1O60832 XIAP-206ENST00000468503 157 ntTSL 315.04■□□□□ -07e-9■■■■■ 49.4
DKC1O60832 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.126e-11■■■■■ 49.4
DKC1O60832 AC007388.1-207ENST00000446698 593 ntTSL 514.18□□□□□ -0.147e-21■■■■■ 49.4
DKC1O60832 CTDSP2-205ENST00000549039 797 ntTSL 213.59□□□□□ -0.237e-21■■■■■ 49.4
DKC1O60832 C8orf44-203ENST00000519561 1835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.36e-11■■■■■ 49.4
DKC1O60832 AL591684.2-202ENST00000431840 1241 ntTSL 212.82□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 49.4
DKC1O60832 ZKSCAN7-207ENST00000447279 1502 ntTSL 1 (best)12.55□□□□□ -0.46e-11■■■■■ 49.4
DKC1O60832 SEPT6-205ENST00000394610 4694 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.436e-11■■■■■ 49.4
DKC1O60832 ARL2BP-202ENST00000562023 547 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.556e-11■■■■■ 49.4
DKC1O60832 SEPT6-203ENST00000354416 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.676e-11■■■■■ 49.4
DKC1O60832 XIAP-201ENST00000355640 8584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.757e-9■■■■■ 49.4
DKC1O60832 C8orf44-204ENST00000521113 575 ntTSL 210.31□□□□□ -0.766e-11■■■■■ 49.4
DKC1O60832 ARL2BP-203ENST00000563234 1416 ntTSL 210.3□□□□□ -0.766e-11■■■■■ 49.4
DKC1O60832 XIAP-202ENST00000371199 8591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.97e-9■■■■■ 49.4
DKC1O60832 C8orf44-SGK3-201ENST00000519289 2949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.916e-11■■■■■ 49.4
DKC1O60832 TMCO3-204ENST00000462877 491 ntTSL 28.78□□□□□ -16e-11■■■■■ 49.4
DKC1O60832 ZKSCAN7-204ENST00000419137 476 ntTSL 28.62□□□□□ -1.036e-11■■■■■ 49.4
DKC1O60832 AC007388.1-201ENST00000426083 1438 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.037e-21■■■■■ 49.4
DKC1O60832 C8orf44-205ENST00000521889 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.136e-11■■■■■ 49.4
DKC1O60832 TMCO3-211ENST00000622371 2822 ntTSL 47.56□□□□□ -1.26e-11■■■■■ 49.4
DKC1O60832 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.287e-9■■■■■ 49.4
DKC1O60832 C8orf44-SGK3-202ENST00000520044 628 ntTSL 35.76□□□□□ -1.496e-11■■■■■ 49.4
DKC1O60832 XIAP-204ENST00000430625 528 ntTSL 32.4□□□□□ -2.037e-9■■■■■ 49.4
DKC1O60832 TAF1D-205ENST00000526015 1735 ntTSL 1 (best)19.65■□□□□ 0.741e-323■■■■■ 49
DKC1O60832 TAF1D-201ENST00000323981 2540 ntTSL 214.65□□□□□ -0.061e-323■■■■■ 49
DKC1O60832 TAF1D-222ENST00000546088 1728 ntTSL 37.15□□□□□ -1.271e-323■■■■■ 49
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DKC1O60832 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.391e-6■■■■■ 48.9
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DKC1O60832 HDAC6-236ENST00000498808 566 ntTSL 517.37■□□□□ 0.373e-10■■■■■ 48.8
DKC1O60832 HDAC6-220ENST00000477528 4832 ntTSL 1 (best)16.16■□□□□ 0.183e-10■■■■■ 48.8
DKC1O60832 HDAC6-229ENST00000486665 598 ntTSL 214.26□□□□□ -0.133e-10■■■■■ 48.8
DKC1O60832 HDAC6-201ENST00000334136 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.323e-10■■■■■ 48.8
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DKC1O60832 HDAC6-203ENST00000376619 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.493e-10■■■■■ 48.8
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DKC1O60832 RCC1-203ENST00000373833 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.611e-323■■■■■ 48.7
DKC1O60832 SNHG3-201ENST00000413987 2201 ntTSL 1 (best)10.08□□□□□ -0.81e-323■■■■■ 48.7
DKC1O60832 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.612e-8■■■■■ 48.7
DKC1O60832 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.372e-8■■■■■ 48.7
DKC1O60832 RAB40B-203ENST00000570676 1104 ntTSL 216.88■□□□□ 0.292e-8■■■■■ 48.7
DKC1O60832 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.272e-8■■■■■ 48.7
DKC1O60832 RAB40B-210ENST00000576148 343 ntTSL 37.91□□□□□ -1.142e-8■■■■■ 48.7
DKC1O60832 AGPAT3-210ENST00000457068 924 ntTSL 317.83■□□□□ 0.449e-7■■■■■ 48.7
DKC1O60832 AGPAT3-206ENST00000422850 1003 ntTSL 517.83■□□□□ 0.449e-7■■■■■ 48.7
DKC1O60832 AGPAT3-209ENST00000448845 392 ntTSL 511.92□□□□□ -0.59e-7■■■■■ 48.7
DKC1O60832 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.741e-6■■■■■ 48.7
DKC1O60832 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 48.7
DKC1O60832 ANKRD11-209ENST00000564553 471 ntTSL 315.53■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 48.6
DKC1O60832 ANKRD11-202ENST00000330736 8342 ntTSL 515.2■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 48.6
DKC1O60832 ANKRD11-206ENST00000562275 2762 ntTSL 514.76□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 48.6
DKC1O60832 NDRG1-203ENST00000517331 584 ntTSL 517.76■□□□□ 0.435e-8■■■■■ 48.5
DKC1O60832 NOP56-213ENST00000480992 929 ntTSL 513.8□□□□□ -0.25e-15■■■■■ 48.5
DKC1O60832 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 48.3
DKC1O60832 NPHP4-207ENST00000470763 3156 ntTSL 214.26□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 48.3
DKC1O60832 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.75e-8■■■■■ 48.1
DKC1O60832 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.225e-8■■■■■ 48.1
DKC1O60832 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.045e-8■■■■■ 48.1
DKC1O60832 PCMTD2-203ENST00000308824 3843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.545e-8■■■■■ 48.1
DKC1O60832 PCMTD2-209ENST00000609818 551 ntTSL 47.62□□□□□ -1.195e-8■■■■■ 48.1
DKC1O60832 HSPBP1-204ENST00000585927 666 ntTSL 529.15■■■□□ 2.262e-6■■■■■ 48.1
DKC1O60832 HSPBP1-207ENST00000587959 424 ntTSL 526.72■■□□□ 1.872e-6■■■■■ 48.1
DKC1O60832 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.782e-6■■■■■ 48.1
DKC1O60832 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.692e-6■■■■■ 48.1
DKC1O60832 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.572e-6■■■■■ 48.1
DKC1O60832 PDXK-218ENST00000498040 888 ntTSL 520.3■□□□□ 0.844e-10■■■■■ 48.1
DKC1O60832 PDXK-204ENST00000398078 1069 ntTSL 218.83■□□□□ 0.64e-10■■■■■ 48.1
DKC1O60832 PDXK-211ENST00000468392 1094 ntTSL 217.19■□□□□ 0.344e-10■■■■■ 48.1
DKC1O60832 PDXK-217ENST00000490666 577 ntTSL 516.39■□□□□ 0.214e-10■■■■■ 48.1
DKC1O60832 PDXK-203ENST00000343528 1101 ntTSL 1 (best)15.94■□□□□ 0.144e-10■■■■■ 48.1
DKC1O60832 PDXK-209ENST00000467908 7194 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.474e-10■■■■■ 48.1
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