RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547169.5

CTDSP2-202, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTDSP2, Length 1,340 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-202ENST00000547169 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.48■■■■□ 3.59
CTDSP2-202ENST00000547169 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.15■■■□□ 2.9
CTDSP2-202ENST00000547169 ABCC9O60706 1549 aa32.27■■■□□ 2.76
CTDSP2-202ENST00000547169 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.29■■■□□ 2.6
CTDSP2-202ENST00000547169 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
CTDSP2-202ENST00000547169 NACADO15069 1562 aa31.17■■■□□ 2.58
CTDSP2-202ENST00000547169 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.13■■■□□ 2.57
CTDSP2-202ENST00000547169 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDSP2-202ENST00000547169 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDSP2-202ENST00000547169 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.4■■■□□ 2.46
CTDSP2-202ENST00000547169 SCRIBQ14160 1630 aa30.27■■■□□ 2.44
CTDSP2-202ENST00000547169 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.25■■■□□ 2.43
CTDSP2-202ENST00000547169 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.19■■■□□ 2.42
CTDSP2-202ENST00000547169 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.92■■■□□ 2.38
CTDSP2-202ENST00000547169 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.88■■■□□ 2.37
CTDSP2-202ENST00000547169 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
CTDSP2-202ENST00000547169 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.19■■■□□ 2.26
CTDSP2-202ENST00000547169 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.19■■■□□ 2.26
CTDSP2-202ENST00000547169 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
CTDSP2-202ENST00000547169 SMARCA4P51532 1647 aa28.99■■■□□ 2.23
CTDSP2-202ENST00000547169 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.88■■■□□ 2.21
CTDSP2-202ENST00000547169 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.83■■■□□ 2.21
CTDSP2-202ENST00000547169 NCAPD3P42695 1498 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDSP2-202ENST00000547169 SMARCA2P51531 1590 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDSP2-202ENST00000547169 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.73■■■□□ 2.19
CTDSP2-202ENST00000547169 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
CTDSP2-202ENST00000547169 HMGXB3Q12766 1538 aa28.61■■■□□ 2.17
CTDSP2-202ENST00000547169 WIZO95785 1651 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDSP2-202ENST00000547169 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
CTDSP2-202ENST00000547169 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
CTDSP2-202ENST00000547169 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.09
CTDSP2-202ENST00000547169 NESP48681 1621 aa28■■■□□ 2.07
CTDSP2-202ENST00000547169 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.99■■■□□ 2.07
CTDSP2-202ENST00000547169 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.98■■■□□ 2.07
CTDSP2-202ENST00000547169 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.95■■■□□ 2.06
CTDSP2-202ENST00000547169 CFTRP13569 1480 aa27.83■■■□□ 2.05
CTDSP2-202ENST00000547169 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.8■■■□□ 2.04
CTDSP2-202ENST00000547169 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.78■■■□□ 2.04
CTDSP2-202ENST00000547169 ERCC6Q03468 1493 aa27.77■■■□□ 2.04
CTDSP2-202ENST00000547169 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.62■■■□□ 2.01
CTDSP2-202ENST00000547169 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.61■■■□□ 2.01
CTDSP2-202ENST00000547169 PRDM2Q13029 1718 aa27.6■■■□□ 2.01
CTDSP2-202ENST00000547169 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.53■■■□□ 2
CTDSP2-202ENST00000547169 CUX2O14529 1486 aa27.49■■□□□ 1.99
CTDSP2-202ENST00000547169 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
CTDSP2-202ENST00000547169 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.46■■□□□ 1.99
CTDSP2-202ENST00000547169 WDR62O43379 1518 aa27.35■■□□□ 1.97
CTDSP2-202ENST00000547169 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
CTDSP2-202ENST00000547169 ABCC8Q09428 1581 aa27.24■■□□□ 1.95
CTDSP2-202ENST00000547169 TOPBP1Q92547 1522 aa27.19■■□□□ 1.94
CTDSP2-202ENST00000547169 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.16■■□□□ 1.94
CTDSP2-202ENST00000547169 CUX1P39880 1505 aa27.06■■□□□ 1.92
CTDSP2-202ENST00000547169 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.99■■□□□ 1.91
CTDSP2-202ENST00000547169 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
CTDSP2-202ENST00000547169 IFT140Q96RY7 1462 aa26.97■■□□□ 1.91
CTDSP2-202ENST00000547169 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.93■■□□□ 1.9
CTDSP2-202ENST00000547169 SOGA1O94964 1423 aa26.92■■□□□ 1.9
CTDSP2-202ENST00000547169 TOP2BQ02880 1626 aa26.89■■□□□ 1.89
CTDSP2-202ENST00000547169 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDSP2-202ENST00000547169 SYNJ1O43426 1573 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDSP2-202ENST00000547169 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDSP2-202ENST00000547169 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
CTDSP2-202ENST00000547169 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
CTDSP2-202ENST00000547169 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.73■■□□□ 1.87
CTDSP2-202ENST00000547169 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CTDSP2-202ENST00000547169 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.71■■□□□ 1.87
CTDSP2-202ENST00000547169 WDR97A6NE52 1622 aa26.67■■□□□ 1.86
CTDSP2-202ENST00000547169 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
CTDSP2-202ENST00000547169 TRIM41Q8WV44 630 aa26.58■■□□□ 1.85
CTDSP2-202ENST00000547169 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.58■■□□□ 1.84
CTDSP2-202ENST00000547169 GRIN2BQ13224 1484 aa26.54■■□□□ 1.84
CTDSP2-202ENST00000547169 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDSP2-202ENST00000547169 PBRM1Q86U86 1689 aa26.46■■□□□ 1.83
CTDSP2-202ENST00000547169 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.44■■□□□ 1.82
CTDSP2-202ENST00000547169 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CTDSP2-202ENST00000547169 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.43■■□□□ 1.82
CTDSP2-202ENST00000547169 OSCARQ8IYS5 282 aa26.42■■□□□ 1.82
CTDSP2-202ENST00000547169 KIF27Q86VH2 1401 aa26.42■■□□□ 1.82
CTDSP2-202ENST00000547169 FBLN2P98095 1184 aa26.39■■□□□ 1.81
CTDSP2-202ENST00000547169 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.38■■□□□ 1.81
CTDSP2-202ENST00000547169 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
CTDSP2-202ENST00000547169 IGF1RP08069 1367 aa26.35■■□□□ 1.81
CTDSP2-202ENST00000547169 SYNJ2O15056 1496 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDSP2-202ENST00000547169 CHD1O14646 1710 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDSP2-202ENST00000547169 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.29■■□□□ 1.8
CTDSP2-202ENST00000547169 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.28■■□□□ 1.8
CTDSP2-202ENST00000547169 ADAMTS12P58397 1594 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDSP2-202ENST00000547169 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.18■■□□□ 1.78
CTDSP2-202ENST00000547169 GRIN2AQ12879 1464 aa26.18■■□□□ 1.78
CTDSP2-202ENST00000547169 CUL7Q14999 1698 aa26.15■■□□□ 1.78
CTDSP2-202ENST00000547169 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDSP2-202ENST00000547169 NUP160Q12769 1436 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDSP2-202ENST00000547169 EEA1Q15075 1411 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDSP2-202ENST00000547169 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.05■■□□□ 1.76
CTDSP2-202ENST00000547169 CEP170Q5SW79 1584 aa26.03■■□□□ 1.76
CTDSP2-202ENST00000547169 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.01■■□□□ 1.75
CTDSP2-202ENST00000547169 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CTDSP2-202ENST00000547169 PRXQ9BXM0 1461 aa25.99■■□□□ 1.75
CTDSP2-202ENST00000547169 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.91■■□□□ 1.74
CTDSP2-202ENST00000547169 JPH4Q96JJ6 628 aa25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms