RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585927.1

HSPBP1-204, Transcript of HSPA (Hsp70) binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene HSPBP1, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPBP1-204ENST00000585927 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.47■■■■■ 7.75
HSPBP1-204ENST00000585927 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.57■■■■■ 6.65
HSPBP1-204ENST00000585927 ABCC9O60706 1549 aa55.43■■■■■ 6.46
HSPBP1-204ENST00000585927 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.33■■■■■ 6.13
HSPBP1-204ENST00000585927 NACADO15069 1562 aa53.24■■■■■ 6.11
HSPBP1-204ENST00000585927 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.97■■■■■ 6.07
HSPBP1-204ENST00000585927 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.91■■■■■ 6.06
HSPBP1-204ENST00000585927 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.82■■■■■ 6.05
HSPBP1-204ENST00000585927 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.59■■■■■ 6.01
HSPBP1-204ENST00000585927 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.12■■■■■ 5.93
HSPBP1-204ENST00000585927 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.73■■■■■ 5.87
HSPBP1-204ENST00000585927 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.7■■■■■ 5.87
HSPBP1-204ENST00000585927 SCRIBQ14160 1630 aa51.47■■■■■ 5.83
HSPBP1-204ENST00000585927 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.23■■■■■ 5.79
HSPBP1-204ENST00000585927 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.09■■■■■ 5.77
HSPBP1-204ENST00000585927 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.35■■■■■ 5.65
HSPBP1-204ENST00000585927 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.19■■■■■ 5.63
HSPBP1-204ENST00000585927 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.88■■■■■ 5.57
HSPBP1-204ENST00000585927 SMARCA4P51532 1647 aa49.28■■■■■ 5.48
HSPBP1-204ENST00000585927 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.22■■■■■ 5.47
HSPBP1-204ENST00000585927 NCAPD3P42695 1498 aa49.12■■■■■ 5.45
HSPBP1-204ENST00000585927 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.08■■■■■ 5.45
HSPBP1-204ENST00000585927 SMARCA2P51531 1590 aa49.03■■■■■ 5.44
HSPBP1-204ENST00000585927 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.88■■■■■ 5.42
HSPBP1-204ENST00000585927 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.87■■■■■ 5.41
HSPBP1-204ENST00000585927 HMGXB3Q12766 1538 aa48.86■■■■■ 5.41
HSPBP1-204ENST00000585927 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.63■■■■■ 5.38
HSPBP1-204ENST00000585927 WIZO95785 1651 aa48.33■■■■■ 5.33
HSPBP1-204ENST00000585927 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.24■■■■■ 5.31
HSPBP1-204ENST00000585927 NESP48681 1621 aa47.91■■■■■ 5.26
HSPBP1-204ENST00000585927 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.86■■■■■ 5.25
HSPBP1-204ENST00000585927 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.83■■■■■ 5.25
HSPBP1-204ENST00000585927 ERCC6Q03468 1493 aa47.81■■■■■ 5.24
HSPBP1-204ENST00000585927 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.64■■■■■ 5.22
HSPBP1-204ENST00000585927 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.52■■■■■ 5.2
HSPBP1-204ENST00000585927 CUX2O14529 1486 aa47.47■■■■■ 5.19
HSPBP1-204ENST00000585927 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.38■■■■■ 5.17
HSPBP1-204ENST00000585927 CFTRP13569 1480 aa47.33■■■■■ 5.17
HSPBP1-204ENST00000585927 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.29■■■■■ 5.16
HSPBP1-204ENST00000585927 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.26■■■■■ 5.16
HSPBP1-204ENST00000585927 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.08■■■■■ 5.13
HSPBP1-204ENST00000585927 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.04■■■■■ 5.12
HSPBP1-204ENST00000585927 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.02■■■■■ 5.12
HSPBP1-204ENST00000585927 PRDM2Q13029 1718 aa46.99■■■■■ 5.11
HSPBP1-204ENST00000585927 WDR62O43379 1518 aa46.89■■■■■ 5.1
HSPBP1-204ENST00000585927 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.74■■■■■ 5.07
HSPBP1-204ENST00000585927 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.62■■■■■ 5.05
HSPBP1-204ENST00000585927 ABCC8Q09428 1581 aa46.36■■■■■ 5.01
HSPBP1-204ENST00000585927 TOPBP1Q92547 1522 aa46.31■■■■■ 5
HSPBP1-204ENST00000585927 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.26■■■■■ 5
HSPBP1-204ENST00000585927 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.25■■■■■ 4.99
HSPBP1-204ENST00000585927 IFT140Q96RY7 1462 aa46.08■■■■■ 4.97
HSPBP1-204ENST00000585927 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.9■■■■■ 4.94
HSPBP1-204ENST00000585927 CUX1P39880 1505 aa45.86■■■■■ 4.93
HSPBP1-204ENST00000585927 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.85■■■■■ 4.93
HSPBP1-204ENST00000585927 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.84■■■■■ 4.93
HSPBP1-204ENST00000585927 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.74■■■■■ 4.91
HSPBP1-204ENST00000585927 SOGA1O94964 1423 aa45.7■■■■■ 4.91
HSPBP1-204ENST00000585927 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.68■■■■■ 4.9
HSPBP1-204ENST00000585927 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.66■■■■■ 4.9
HSPBP1-204ENST00000585927 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.55■■■■■ 4.88
HSPBP1-204ENST00000585927 WDR97A6NE52 1622 aa45.54■■■■■ 4.88
HSPBP1-204ENST00000585927 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.49■■■■■ 4.87
HSPBP1-204ENST00000585927 TOP2BQ02880 1626 aa45.45■■■■■ 4.87
HSPBP1-204ENST00000585927 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.45■■■■■ 4.87
HSPBP1-204ENST00000585927 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.44■■■■■ 4.86
HSPBP1-204ENST00000585927 OSCARQ8IYS5 282 aa45.43■■■■■ 4.86
HSPBP1-204ENST00000585927 SYNJ1O43426 1573 aa45.37■■■■■ 4.85
HSPBP1-204ENST00000585927 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.32■■■■■ 4.85
HSPBP1-204ENST00000585927 GRIN2BQ13224 1484 aa45.22■■■■■ 4.83
HSPBP1-204ENST00000585927 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.17■■■■■ 4.82
HSPBP1-204ENST00000585927 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.16■■■■■ 4.82
HSPBP1-204ENST00000585927 CHD1O14646 1710 aa45.15■■■■■ 4.82
HSPBP1-204ENST00000585927 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.13■■■■■ 4.82
HSPBP1-204ENST00000585927 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.13■■■■■ 4.82
HSPBP1-204ENST00000585927 PBRM1Q86U86 1689 aa45.1■■■■■ 4.81
HSPBP1-204ENST00000585927 FBLN2P98095 1184 aa45■■■■■ 4.79
HSPBP1-204ENST00000585927 SYNJ2O15056 1496 aa44.95■■■■■ 4.79
HSPBP1-204ENST00000585927 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.91■■■■■ 4.78
HSPBP1-204ENST00000585927 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.8■■■■■ 4.76
HSPBP1-204ENST00000585927 ADAMTS12P58397 1594 aa44.72■■■■■ 4.75
HSPBP1-204ENST00000585927 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.72■■■■■ 4.75
HSPBP1-204ENST00000585927 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.72■■■■■ 4.75
HSPBP1-204ENST00000585927 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.72■■■■■ 4.75
HSPBP1-204ENST00000585927 ARHGEF11O15085 1522 aa44.69■■■■■ 4.74
HSPBP1-204ENST00000585927 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.69■■■■■ 4.74
HSPBP1-204ENST00000585927 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.66■■■■■ 4.74
HSPBP1-204ENST00000585927 GRIN2AQ12879 1464 aa44.62■■■■■ 4.73
HSPBP1-204ENST00000585927 KIF27Q86VH2 1401 aa44.57■■■■■ 4.72
HSPBP1-204ENST00000585927 TRIM41Q8WV44 630 aa44.52■■■■■ 4.72
HSPBP1-204ENST00000585927 NUP160Q12769 1436 aa44.45■■■■■ 4.71
HSPBP1-204ENST00000585927 IGF1RP08069 1367 aa44.43■■■■■ 4.7
HSPBP1-204ENST00000585927 CEP170Q5SW79 1584 aa44.39■■■■■ 4.7
HSPBP1-204ENST00000585927 CUL7Q14999 1698 aa44.34■■■■■ 4.69
HSPBP1-204ENST00000585927 ARAP1Q96P48 1450 aa44.3■■■■■ 4.68
HSPBP1-204ENST00000585927 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.24■■■■■ 4.67
HSPBP1-204ENST00000585927 SHROOM2Q13796 1616 aa44.17■■■■■ 4.66
HSPBP1-204ENST00000585927 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.14■■■■■ 4.66
HSPBP1-204ENST00000585927 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.07■■■■■ 4.65
HSPBP1-204ENST00000585927 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.99■■■■■ 4.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 212 ms