RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.03■■■■■ 5.44
CTDSP2-204ENST00000548823 ABCC9O60706 1549 aa45.3■■■■■ 4.84
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.41■■■■■ 4.7
CTDSP2-204ENST00000548823 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.37■■■■■ 4.53
CTDSP2-204ENST00000548823 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.73■■■■■ 4.43
CTDSP2-204ENST00000548823 NACADO15069 1562 aa42.22■■■■■ 4.35
CTDSP2-204ENST00000548823 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.03■■■■■ 4.32
CTDSP2-204ENST00000548823 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.77■■■■■ 4.28
CTDSP2-204ENST00000548823 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.75■■■■■ 4.27
CTDSP2-204ENST00000548823 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.51■■■■■ 4.24
CTDSP2-204ENST00000548823 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.36■■■■■ 4.21
CTDSP2-204ENST00000548823 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.93■■■■■ 4.14
CTDSP2-204ENST00000548823 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.9■■■■■ 4.14
CTDSP2-204ENST00000548823 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.89■■■■■ 4.14
CTDSP2-204ENST00000548823 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.57■■■■■ 4.09
CTDSP2-204ENST00000548823 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.56■■■■■ 4.08
CTDSP2-204ENST00000548823 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.47■■■■■ 4.07
CTDSP2-204ENST00000548823 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
CTDSP2-204ENST00000548823 SCRIBQ14160 1630 aa40.36■■■■■ 4.05
CTDSP2-204ENST00000548823 CUX2O14529 1486 aa39.48■■■■□ 3.91
CTDSP2-204ENST00000548823 ERCC6Q03468 1493 aa39.2■■■■□ 3.87
CTDSP2-204ENST00000548823 NCAPD3P42695 1498 aa39■■■■□ 3.83
CTDSP2-204ENST00000548823 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.73■■■■□ 3.79
CTDSP2-204ENST00000548823 NESP48681 1621 aa38.64■■■■□ 3.78
CTDSP2-204ENST00000548823 HMGXB3Q12766 1538 aa38.61■■■■□ 3.77
CTDSP2-204ENST00000548823 SMARCA2P51531 1590 aa38.58■■■■□ 3.77
CTDSP2-204ENST00000548823 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.45■■■■□ 3.75
CTDSP2-204ENST00000548823 SMARCA4P51532 1647 aa38.44■■■■□ 3.74
CTDSP2-204ENST00000548823 TRIM41Q8WV44 630 aa38.32■■■■□ 3.73
CTDSP2-204ENST00000548823 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.29■■■■□ 3.72
CTDSP2-204ENST00000548823 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.26■■■■□ 3.72
CTDSP2-204ENST00000548823 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.13■■■■□ 3.69
CTDSP2-204ENST00000548823 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.12■■■■□ 3.69
CTDSP2-204ENST00000548823 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.1■■■■□ 3.69
CTDSP2-204ENST00000548823 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.09■■■■□ 3.69
CTDSP2-204ENST00000548823 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.79■■■■□ 3.64
CTDSP2-204ENST00000548823 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.77■■■■□ 3.64
CTDSP2-204ENST00000548823 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.74■■■■□ 3.63
CTDSP2-204ENST00000548823 WDR62O43379 1518 aa37.72■■■■□ 3.63
CTDSP2-204ENST00000548823 OSCARQ8IYS5 282 aa37.55■■■■□ 3.6
CTDSP2-204ENST00000548823 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.44■■■■□ 3.58
CTDSP2-204ENST00000548823 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.32■■■■□ 3.56
CTDSP2-204ENST00000548823 WIZO95785 1651 aa37.24■■■■□ 3.55
CTDSP2-204ENST00000548823 CFTRP13569 1480 aa37.14■■■■□ 3.54
CTDSP2-204ENST00000548823 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.11■■■■□ 3.53
CTDSP2-204ENST00000548823 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.11■■■■□ 3.53
CTDSP2-204ENST00000548823 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.11■■■■□ 3.53
CTDSP2-204ENST00000548823 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.52
CTDSP2-204ENST00000548823 ARHGEF11O15085 1522 aa36.89■■■■□ 3.5
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.47
CTDSP2-204ENST00000548823 IFT140Q96RY7 1462 aa36.75■■■■□ 3.47
CTDSP2-204ENST00000548823 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
CTDSP2-204ENST00000548823 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.7■■■■□ 3.47
CTDSP2-204ENST00000548823 PRDM2Q13029 1718 aa36.66■■■■□ 3.46
CTDSP2-204ENST00000548823 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
CTDSP2-204ENST00000548823 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
CTDSP2-204ENST00000548823 TOPBP1Q92547 1522 aa36.51■■■■□ 3.43
CTDSP2-204ENST00000548823 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
CTDSP2-204ENST00000548823 ARAP1Q96P48 1450 aa36.46■■■■□ 3.43
CTDSP2-204ENST00000548823 CHD1O14646 1710 aa36.41■■■■□ 3.42
CTDSP2-204ENST00000548823 ABCC8Q09428 1581 aa36.41■■■■□ 3.42
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.32■■■■□ 3.4
CTDSP2-204ENST00000548823 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.32■■■■□ 3.47e-7■■■■□ 25.9
CTDSP2-204ENST00000548823 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.29■■■■□ 3.4
CTDSP2-204ENST00000548823 FBLN2P98095 1184 aa36.27■■■■□ 3.4
CTDSP2-204ENST00000548823 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
CTDSP2-204ENST00000548823 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
CTDSP2-204ENST00000548823 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.36
CTDSP2-204ENST00000548823 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.99■■■■□ 3.35
CTDSP2-204ENST00000548823 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
CTDSP2-204ENST00000548823 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.94■■■■□ 3.34
CTDSP2-204ENST00000548823 SOGA1O94964 1423 aa35.91■■■■□ 3.34
CTDSP2-204ENST00000548823 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.9■■■■□ 3.34
CTDSP2-204ENST00000548823 SYNJ1O43426 1573 aa35.89■■■■□ 3.34
CTDSP2-204ENST00000548823 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
CTDSP2-204ENST00000548823 WDR97A6NE52 1622 aa35.85■■■■□ 3.33
CTDSP2-204ENST00000548823 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
CTDSP2-204ENST00000548823 GRIN2BQ13224 1484 aa35.7■■■■□ 3.31
CTDSP2-204ENST00000548823 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.7■■■■□ 3.31
CTDSP2-204ENST00000548823 SYNJ2O15056 1496 aa35.69■■■■□ 3.3
CTDSP2-204ENST00000548823 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.68■■■■□ 3.3
CTDSP2-204ENST00000548823 CUX1P39880 1505 aa35.51■■■■□ 3.28
CTDSP2-204ENST00000548823 PBRM1Q86U86 1689 aa35.46■■■■□ 3.27
CTDSP2-204ENST00000548823 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.33■■■■□ 3.25
CTDSP2-204ENST00000548823 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.27■■■■□ 3.24
CTDSP2-204ENST00000548823 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.27■■■■□ 3.24
CTDSP2-204ENST00000548823 GRIN2AQ12879 1464 aa35.23■■■■□ 3.23
CTDSP2-204ENST00000548823 CEP170Q5SW79 1584 aa35.21■■■■□ 3.23
CTDSP2-204ENST00000548823 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.16■■■■□ 3.22
CTDSP2-204ENST00000548823 NUP160Q12769 1436 aa35.16■■■■□ 3.22
CTDSP2-204ENST00000548823 SHROOM2Q13796 1616 aa35.11■■■■□ 3.21
CTDSP2-204ENST00000548823 ADAMTS12P58397 1594 aa35.07■■■■□ 3.2
CTDSP2-204ENST00000548823 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.97■■■■□ 3.19
CTDSP2-204ENST00000548823 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.95■■■■□ 3.18
CTDSP2-204ENST00000548823 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.9■■■■□ 3.18
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.89■■■■□ 3.18
CTDSP2-204ENST00000548823 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.88■■■■□ 3.17
CTDSP2-204ENST00000548823 JPH4Q96JJ6 628 aa34.82■■■■□ 3.16
CTDSP2-204ENST00000548823 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.81■■■■□ 3.16
CTDSP2-204ENST00000548823 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.81■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms