RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549039.5

CTDSP2-205, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTDSP2, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-205ENST00000549039 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.22■■■□□ 2.43
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CTDSP2-205ENST00000549039 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.03■■□□□ 1.92
CTDSP2-205ENST00000549039 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.83■■□□□ 1.73
CTDSP2-205ENST00000549039 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.76■■□□□ 1.71
CTDSP2-205ENST00000549039 NACADO15069 1562 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDSP2-205ENST00000549039 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.56■■□□□ 1.68
CTDSP2-205ENST00000549039 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.66
CTDSP2-205ENST00000549039 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.22■■□□□ 1.63
CTDSP2-205ENST00000549039 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDSP2-205ENST00000549039 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDSP2-205ENST00000549039 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CTDSP2-205ENST00000549039 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDSP2-205ENST00000549039 SCRIBQ14160 1630 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDSP2-205ENST00000549039 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.69■■□□□ 1.54
CTDSP2-205ENST00000549039 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.53■■□□□ 1.52
CTDSP2-205ENST00000549039 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDSP2-205ENST00000549039 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CTDSP2-205ENST00000549039 NCAPD3P42695 1498 aa23.68■■□□□ 1.38
CTDSP2-205ENST00000549039 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.63■■□□□ 1.37
CTDSP2-205ENST00000549039 ERCC6Q03468 1493 aa23.56■■□□□ 1.36
CTDSP2-205ENST00000549039 SMARCA4P51532 1647 aa23.55■■□□□ 1.36
CTDSP2-205ENST00000549039 SMARCA2P51531 1590 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDSP2-205ENST00000549039 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDSP2-205ENST00000549039 HMGXB3Q12766 1538 aa23.47■■□□□ 1.35
CTDSP2-205ENST00000549039 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CTDSP2-205ENST00000549039 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CTDSP2-205ENST00000549039 CUX2O14529 1486 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP2-205ENST00000549039 NESP48681 1621 aa23.37■■□□□ 1.33
CTDSP2-205ENST00000549039 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.3■■□□□ 1.32
CTDSP2-205ENST00000549039 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDSP2-205ENST00000549039 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.14■■□□□ 1.29
CTDSP2-205ENST00000549039 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.08■■□□□ 1.29
CTDSP2-205ENST00000549039 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CTDSP2-205ENST00000549039 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.01■■□□□ 1.27
CTDSP2-205ENST00000549039 WIZO95785 1651 aa23■■□□□ 1.27
CTDSP2-205ENST00000549039 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDSP2-205ENST00000549039 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDSP2-205ENST00000549039 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CTDSP2-205ENST00000549039 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDSP2-205ENST00000549039 WDR62O43379 1518 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDSP2-205ENST00000549039 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDSP2-205ENST00000549039 CFTRP13569 1480 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDSP2-205ENST00000549039 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CTDSP2-205ENST00000549039 TRIM41Q8WV44 630 aa22.58■■□□□ 1.21
CTDSP2-205ENST00000549039 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CTDSP2-205ENST00000549039 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.49■■□□□ 1.19
CTDSP2-205ENST00000549039 OSCARQ8IYS5 282 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDSP2-205ENST00000549039 PRDM2Q13029 1718 aa22.33■■□□□ 1.17
CTDSP2-205ENST00000549039 IFT140Q96RY7 1462 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CTDSP2-205ENST00000549039 TOPBP1Q92547 1522 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-205ENST00000549039 ABCC8Q09428 1581 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-205ENST00000549039 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-205ENST00000549039 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CTDSP2-205ENST00000549039 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.136e-9■■■■□ 24.7
CTDSP2-205ENST00000549039 FBLN2P98095 1184 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDSP2-205ENST00000549039 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CTDSP2-205ENST00000549039 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-205ENST00000549039 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-205ENST00000549039 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-205ENST00000549039 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-205ENST00000549039 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDSP2-205ENST00000549039 SOGA1O94964 1423 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDSP2-205ENST00000549039 ARHGEF11O15085 1522 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDSP2-205ENST00000549039 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2-205ENST00000549039 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.97■■□□□ 1.11
CTDSP2-205ENST00000549039 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CTDSP2-205ENST00000549039 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.94■■□□□ 1.1
CTDSP2-205ENST00000549039 CHD1O14646 1710 aa21.91■■□□□ 1.1
CTDSP2-205ENST00000549039 CUX1P39880 1505 aa21.89■■□□□ 1.09
CTDSP2-205ENST00000549039 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CTDSP2-205ENST00000549039 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.87■■□□□ 1.09
CTDSP2-205ENST00000549039 GRIN2BQ13224 1484 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-205ENST00000549039 WDR97A6NE52 1622 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-205ENST00000549039 ARAP1Q96P48 1450 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDSP2-205ENST00000549039 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CTDSP2-205ENST00000549039 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
CTDSP2-205ENST00000549039 SYNJ2O15056 1496 aa21.72■■□□□ 1.07
CTDSP2-205ENST00000549039 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.72■■□□□ 1.07
CTDSP2-205ENST00000549039 SYNJ1O43426 1573 aa21.71■■□□□ 1.07
CTDSP2-205ENST00000549039 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.68■■□□□ 1.06
CTDSP2-205ENST00000549039 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDSP2-205ENST00000549039 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
CTDSP2-205ENST00000549039 PBRM1Q86U86 1689 aa21.62■■□□□ 1.05
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CTDSP2-205ENST00000549039 GRIN2AQ12879 1464 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-205ENST00000549039 TOP2BQ02880 1626 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-205ENST00000549039 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDSP2-205ENST00000549039 ADAMTS12P58397 1594 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDSP2-205ENST00000549039 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.44■■□□□ 1.02
CTDSP2-205ENST00000549039 NUP160Q12769 1436 aa21.41■■□□□ 1.02
CTDSP2-205ENST00000549039 CEP170Q5SW79 1584 aa21.4■■□□□ 1.02
CTDSP2-205ENST00000549039 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.38■■□□□ 1.01
CTDSP2-205ENST00000549039 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.38■■□□□ 1.01
CTDSP2-205ENST00000549039 JPH4Q96JJ6 628 aa21.28■■□□□ 1
CTDSP2-205ENST00000549039 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
CTDSP2-205ENST00000549039 SHROOM2Q13796 1616 aa21.25■□□□□ 0.99
CTDSP2-205ENST00000549039 KIF27Q86VH2 1401 aa21.18■□□□□ 0.98
CTDSP2-205ENST00000549039 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
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