RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.7■■■□□ 2.18
CTDSP2-201ENST00000398073 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDSP2-201ENST00000398073 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
CTDSP2-201ENST00000398073 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDSP2-201ENST00000398073 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.94■■□□□ 1.74
CTDSP2-201ENST00000398073 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.85■■□□□ 1.73
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
CTDSP2-201ENST00000398073 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CTDSP2-201ENST00000398073 TRIM41Q8WV44 630 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDSP2-201ENST00000398073 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
CTDSP2-201ENST00000398073 APLP2Q06481 763 aa25.32■■□□□ 1.64
CTDSP2-201ENST00000398073 HRCP23327 699 aa25.22■■□□□ 1.63
CTDSP2-201ENST00000398073 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CTDSP2-201ENST00000398073 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDSP2-201ENST00000398073 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
CTDSP2-201ENST00000398073 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
CTDSP2-201ENST00000398073 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CTDSP2-201ENST00000398073 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.79■■□□□ 1.56
CTDSP2-201ENST00000398073 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CTDSP2-201ENST00000398073 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
CTDSP2-201ENST00000398073 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
CTDSP2-201ENST00000398073 MYT1Q01538 1121 aa24.43■■□□□ 1.5
CTDSP2-201ENST00000398073 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
CTDSP2-201ENST00000398073 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
CTDSP2-201ENST00000398073 NEFLP07196 543 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDSP2-201ENST00000398073 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.14■■□□□ 1.45
CTDSP2-201ENST00000398073 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CTDSP2-201ENST00000398073 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CTDSP2-201ENST00000398073 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CTDSP2-201ENST00000398073 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
CTDSP2-201ENST00000398073 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.85■■□□□ 1.41
CTDSP2-201ENST00000398073 ITGAEP38570 1179 aa23.83■■□□□ 1.41
CTDSP2-201ENST00000398073 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.66■■□□□ 1.38
CTDSP2-201ENST00000398073 ABCC9O60706 1549 aa23.65■■□□□ 1.38
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CTDSP2-201ENST00000398073 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDSP2-201ENST00000398073 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDSP2-201ENST00000398073 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.47■■□□□ 1.35
CTDSP2-201ENST00000398073 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.33
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CTDSP2-201ENST00000398073 SCRIBQ14160 1630 aa23.33■■□□□ 1.32
CTDSP2-201ENST00000398073 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.26■■□□□ 1.31
CTDSP2-201ENST00000398073 NEUROD1Q13562 356 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP2-201ENST00000398073 ANP32CO43423 234 aa23.14■■□□□ 1.29
CTDSP2-201ENST00000398073 BCANQ96GW7 911 aa23.1■■□□□ 1.29
CTDSP2-201ENST00000398073 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
CTDSP2-201ENST00000398073 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
CTDSP2-201ENST00000398073 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CTDSP2-201ENST00000398073 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
CTDSP2-201ENST00000398073 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.07■■□□□ 1.28
CTDSP2-201ENST00000398073 TRIM52Q96A61 297 aa23.03■■□□□ 1.28
CTDSP2-201ENST00000398073 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2-201ENST00000398073 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2-201ENST00000398073 EEA1Q15075 1411 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDSP2-201ENST00000398073 CEP162Q5TB80 1403 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDSP2-201ENST00000398073 P3H3Q8IVL6 736 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDSP2-201ENST00000398073 MIER1Q8N108 512 aa22.79■■□□□ 1.24
CTDSP2-201ENST00000398073 CLIP1P30622 1438 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDSP2-201ENST00000398073 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDSP2-201ENST00000398073 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDSP2-201ENST00000398073 GOLGA3Q08378 1498 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDSP2-201ENST00000398073 FKBP8Q14318 412 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDSP2-201ENST00000398073 TONSLQ96HA7 1378 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDSP2-201ENST00000398073 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CTDSP2-201ENST00000398073 NACADO15069 1562 aa22.59■■□□□ 1.21
CTDSP2-201ENST00000398073 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
CTDSP2-201ENST00000398073 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
CTDSP2-201ENST00000398073 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.5■■□□□ 1.19
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CTDSP2-201ENST00000398073 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CTDSP2-201ENST00000398073 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDSP2-201ENST00000398073 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
CTDSP2-201ENST00000398073 ARID3CA6NKF2 412 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDSP2-201ENST00000398073 FBLN2P98095 1184 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDSP2-201ENST00000398073 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.33■■□□□ 1.17
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CTDSP2-201ENST00000398073 SOGA1O94964 1423 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDSP2-201ENST00000398073 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-201ENST00000398073 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-201ENST00000398073 KIF27Q86VH2 1401 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-201ENST00000398073 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-201ENST00000398073 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-201ENST00000398073 MRS2Q9HD23 443 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-201ENST00000398073 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.155e-13■■□□□ 11.6
CTDSP2-201ENST00000398073 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-201ENST00000398073 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-201ENST00000398073 TMC1Q8TDI8 760 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-201ENST00000398073 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-201ENST00000398073 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDSP2-201ENST00000398073 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CTDSP2-201ENST00000398073 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP2-201ENST00000398073 ABCC8Q09428 1581 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP2-201ENST00000398073 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDSP2-201ENST00000398073 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8 ms