Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 CERS2-203ENST00000361419 997 ntTSL 225.74■■□□□ 1.711e-8■■■■■ 29
PRPF8Q6P2Q9 CARS2-230ENST00000543487 870 ntTSL 516.57■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 29
PRPF8Q6P2Q9 PRPF4B-205ENST00000480058 6775 ntTSL 1 (best)5.21□□□□□ -1.572e-7■■■■■ 29
PRPF8Q6P2Q9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.332e-10■■■■■ 29
PRPF8Q6P2Q9 ANKFY1-209ENST00000574367 5033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.312e-10■■■■■ 29
PRPF8Q6P2Q9 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.442e-10■■■■■ 29
PRPF8Q6P2Q9 ANKFY1-205ENST00000572412 3352 ntTSL 25.23□□□□□ -1.572e-10■■■■■ 29
PRPF8Q6P2Q9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.411e-6■■■■■ 29
PRPF8Q6P2Q9 ZNF346-210ENST00000513587 977 ntTSL 217.51■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 29
PRPF8Q6P2Q9 ZNF346-206ENST00000508155 1622 ntTSL 216.83■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 29
PRPF8Q6P2Q9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 29
PRPF8Q6P2Q9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 29
PRPF8Q6P2Q9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 01e-6■■■■■ 29
PRPF8Q6P2Q9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 29
PRPF8Q6P2Q9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 29
PRPF8Q6P2Q9 CRAMP1-203ENST00000415022 550 ntTSL 38.93□□□□□ -0.982e-7■■■■■ 29
PRPF8Q6P2Q9 CRAMP1-207ENST00000492778 573 ntTSL 47.45□□□□□ -1.222e-7■■■■■ 29
PRPF8Q6P2Q9 CERS2-208ENST00000460664 850 ntTSL 312.72□□□□□ -0.372e-10■■■■■ 29
PRPF8Q6P2Q9 TMEM147-208ENST00000596232 562 ntTSL 217.41■□□□□ 0.386e-8■■■■■ 29
PRPF8Q6P2Q9 SMARCD2-204ENST00000450364 993 ntTSL 511.69□□□□□ -0.543e-8■■■■■ 29
PRPF8Q6P2Q9 IL4R-201ENST00000170630 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.21e-6■■■■■ 29
PRPF8Q6P2Q9 TYMS-204ENST00000579128 925 ntTSL 210.93□□□□□ -0.664e-9■■■■■ 29
PRPF8Q6P2Q9 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.66e-7■■■■■ 29
PRPF8Q6P2Q9 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.636e-7■■■■■ 29
PRPF8Q6P2Q9 CNOT1-211ENST00000567188 7830 ntTSL 1 (best)4.72□□□□□ -1.656e-7■■■■■ 29
PRPF8Q6P2Q9 WDR90-214ENST00000549024 2257 ntTSL 213.7□□□□□ -0.228e-7■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 NEMF-205ENST00000554626 570 ntTSL 55.59□□□□□ -1.517e-7■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 MUS81-212ENST00000530282 755 ntTSL 212.36□□□□□ -0.434e-10■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 AFDN-209ENST00000400825 963 ntTSL 524.72■■□□□ 1.551e-10■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 AFDN-208ENST00000400824 875 ntTSL 523.31■■□□□ 1.321e-10■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 PPRC1-202ENST00000370012 2163 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.079e-8■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 PPRC1-206ENST00000495914 564 ntTSL 27.09□□□□□ -1.282e-9■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.872e-9■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.841e-8■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 TTC3-218ENST00000484047 1945 ntTSL 25.26□□□□□ -1.571e-7■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.23e-8■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.263e-8■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 TINF2-206ENST00000558476 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.65□□□□□ -0.383e-8■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.453e-8■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.593e-8■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 TINF2-213ENST00000559969 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.99□□□□□ -0.653e-8■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 TINF2-210ENST00000559019 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.823e-8■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 MACF1-224ENST00000496804 5065 ntTSL 56.67□□□□□ -1.341e-7■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 ATP5G1-205ENST00000504591 401 ntTSL 29.25□□□□□ -0.937e-9■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 EIF3B-206ENST00000463229 552 ntTSL 53.53□□□□□ -1.842e-7■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 DDX55-206ENST00000539934 2240 ntTSL 59.88□□□□□ -0.833e-7■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.661e-6■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 FAF1-201ENST00000371778 1643 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.091e-6■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 TRMT2A-209ENST00000463710 757 ntTSL 314.81□□□□□ -0.041e-9■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 TRMT2A-212ENST00000471040 848 ntTSL 314.81□□□□□ -0.041e-9■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 RBFOX2-208ENST00000416721 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 RBFOX2-203ENST00000397303 1354 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 RBFOX2-210ENST00000449924 1935 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.942e-6■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 RBFOX2-202ENST00000359369 1409 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.032e-6■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 RBFOX2-207ENST00000414461 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.42e-6■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.522e-6■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 AURKB-213ENST00000584972 739 ntTSL 39.1□□□□□ -0.952e-9■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 RCC1-208ENST00000429051 538 ntTSL 39.78□□□□□ -0.847e-7■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 CHD2-209ENST00000627185 533 ntTSL 36.31□□□□□ -1.46e-8■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.457e-8■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 RAD9A-205ENST00000538013 924 ntTSL 516.37■□□□□ 0.217e-8■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 ACAA1-218ENST00000489559 579 ntTSL 418.97■□□□□ 0.631e-9■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 NSMF-209ENST00000482448 551 ntTSL 39.36□□□□□ -0.918e-11■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 DGCR8-209ENST00000495826 4695 ntTSL 1 (best)10.44□□□□□ -0.743e-7■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 DGCR8-203ENST00000407755 4129 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.813e-7■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 USP10-206ENST00000563023 574 ntTSL 44.41□□□□□ -1.73e-6■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 USP10-213ENST00000566512 575 ntTSL 22.24□□□□□ -2.053e-6■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.249e-7■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.649e-7■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 UPF1-213ENST00000601981 556 ntTSL 58.43□□□□□ -1.064e-10■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.436e-8■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 ABR-233ENST00000575934 689 ntTSL 317.78■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.325e-9■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.217e-9■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 CENPU-205ENST00000510146 1549 ntTSL 1 (best)16.17■□□□□ 0.187e-9■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.185e-9■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.124e-12■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.15e-9■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 ATP5L-204ENST00000529460 457 ntTSL 39.45□□□□□ -0.94e-12■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 ATP5L-207ENST00000533172 336 ntTSL 28.59□□□□□ -1.034e-12■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 ZCCHC6-205ENST00000375960 4939 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.043e-6■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 RNF38-206ENST00000377885 4985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.245e-9■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 ATP5L-202ENST00000524422 720 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.244e-12■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 ATP5L-208ENST00000534385 623 ntTSL 26.56□□□□□ -1.364e-12■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.523e-6■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.563e-6■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 ATP5L-205ENST00000529770 575 ntTSL 25.27□□□□□ -1.574e-12■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 ATP5L-206ENST00000529790 900 ntTSL 25□□□□□ -1.614e-12■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.895e-9■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.935e-9■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.975e-9■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 NR1H2-205ENST00000595730 713 ntTSL 214.52□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 NR1H2-209ENST00000597790 718 ntTSL 214.1□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 NR1H2-207ENST00000597130 894 ntTSL 313.85□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 NADK2-204ENST00000404560 3317 ntTSL 1 (best)3.37□□□□□ -1.872e-6■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 CDC27-209ENST00000532893 515 ntTSL 312.97□□□□□ -0.333e-8■■■■■ 28.9
PRPF8Q6P2Q9 CDC27-208ENST00000532575 765 ntTSL 37.22□□□□□ -1.253e-8■■■■■ 28.9
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 1457.7 ms