Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL20Q9Y2M5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL20Q9Y2M5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL20Q9Y2M5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 715.9 ms