RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366728.6

GUK1-208, Transcript of guanylate kinase 1, human

TSL 2 BASIC

Gene GUK1, Length 842 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GUK1-208	ENST00000366728	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		60.05	■■■■■ 7.2
GUK1-208	ENST00000366728	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		53.68	■■■■■ 6.18
GUK1-208	ENST00000366728	ABCC9	O60706	1549 aa		53.61	■■■■■ 6.17
GUK1-208	ENST00000366728	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		51.05	■■■■■ 5.76
GUK1-208	ENST00000366728	NACAD	O15069	1562 aa		50.77	■■■■■ 5.72
GUK1-208	ENST00000366728	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		50.69	■■■■■ 5.71
GUK1-208	ENST00000366728	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		50.13	■■■■■ 5.62
GUK1-208	ENST00000366728	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		50.12	■■■■■ 5.61
GUK1-208	ENST00000366728	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	49.99	■■■■■ 5.59
GUK1-208	ENST00000366728	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	49.82	■■■■■ 5.57
GUK1-208	ENST00000366728	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		49.81	■■■■■ 5.56
GUK1-208	ENST00000366728	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		49.58	■■■■■ 5.53
GUK1-208	ENST00000366728	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		49.56	■■■■■ 5.52
GUK1-208	ENST00000366728	SCRIB	Q14160	1630 aa		49.01	■■■■■ 5.44
GUK1-208	ENST00000366728	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		48.9	■■■■■ 5.42
GUK1-208	ENST00000366728	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		48.38	■■■■■ 5.34
GUK1-208	ENST00000366728	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	48.34	■■■■■ 5.33
GUK1-208	ENST00000366728	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		48.25	■■■■■ 5.31
GUK1-208	ENST00000366728	NCAPD3	P42695	1498 aa		46.9	■■■■■ 5.1
GUK1-208	ENST00000366728	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		46.81	■■■■■ 5.08
GUK1-208	ENST00000366728	SMARCA4	P51532	1647 aa		46.76	■■■■■ 5.08
GUK1-208	ENST00000366728	SMARCA2	P51531	1590 aa		46.64	■■■■■ 5.06
GUK1-208	ENST00000366728	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	46.57	■■■■■ 5.05
GUK1-208	ENST00000366728	HMGXB3	Q12766	1538 aa		46.54	■■■■■ 5.04
GUK1-208	ENST00000366728	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	46.35	■■■■■ 5.01
GUK1-208	ENST00000366728	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		46.3	■■■■■ 5
GUK1-208	ENST00000366728	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		46.28	■■■■■ 5
GUK1-208	ENST00000366728	ERCC6	Q03468	1493 aa		46.25	■■■■■ 5
GUK1-208	ENST00000366728	NES	P48681	1621 aa		46.1	■■■■■ 4.97
GUK1-208	ENST00000366728	CUX2	O14529	1486 aa		46.06	■■■■■ 4.96
GUK1-208	ENST00000366728	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		45.83	■■■■■ 4.93
GUK1-208	ENST00000366728	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		45.75	■■■■■ 4.92
GUK1-208	ENST00000366728	WIZ	O95785	1651 aa		45.7	■■■■■ 4.91
GUK1-208	ENST00000366728	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		45.54	■■■■■ 4.88
GUK1-208	ENST00000366728	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	45.53	■■■■■ 4.88
GUK1-208	ENST00000366728	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		45.51	■■■■■ 4.88
GUK1-208	ENST00000366728	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		45.43	■■■■■ 4.86
GUK1-208	ENST00000366728	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	45.43	■■■■■ 4.86
GUK1-208	ENST00000366728	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	45.16	■■■■■ 4.82
GUK1-208	ENST00000366728	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		45.13	■■■■■ 4.82
GUK1-208	ENST00000366728	CFTR	P13569	1480 aa		45.02	■■■■■ 4.8
GUK1-208	ENST00000366728	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		45	■■■■■ 4.79
GUK1-208	ENST00000366728	WDR62	O43379	1518 aa		44.99	■■■■■ 4.79
GUK1-208	ENST00000366728	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		44.98	■■■■■ 4.79
GUK1-208	ENST00000366728	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		44.68	■■■■■ 4.74
GUK1-208	ENST00000366728	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	44.59	■■■■■ 4.73
GUK1-208	ENST00000366728	PRDM2	Q13029	1718 aa		44.44	■■■■■ 4.7
GUK1-208	ENST00000366728	TOPBP1	Q92547	1522 aa		44.14	■■■■■ 4.66
GUK1-208	ENST00000366728	IFT140	Q96RY7	1462 aa		44.08	■■■■■ 4.65
GUK1-208	ENST00000366728	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		44.05	■■■■■ 4.64
GUK1-208	ENST00000366728	ABCC8	Q09428	1581 aa		44.05	■■■■■ 4.64
GUK1-208	ENST00000366728	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	44.01	■■■■■ 4.64
GUK1-208	ENST00000366728	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		43.97	■■■■■ 4.63
GUK1-208	ENST00000366728	TRIM41	Q8WV44	630 aa		43.96	■■■■■ 4.63
GUK1-208	ENST00000366728	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	43.72	■■■■■ 4.59
GUK1-208	ENST00000366728	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	43.72	■■■■■ 4.59
GUK1-208	ENST00000366728	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	43.69	■■■■■ 4.58
GUK1-208	ENST00000366728	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	43.66	■■■■■ 4.58	2e-9	■■■■■ 44.3
GUK1-208	ENST00000366728	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	43.65	■■■■■ 4.58
GUK1-208	ENST00000366728	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		43.57	■■■■■ 4.57
GUK1-208	ENST00000366728	SOGA1	O94964	1423 aa		43.55	■■■■■ 4.56
GUK1-208	ENST00000366728	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		43.48	■■■■■ 4.55
GUK1-208	ENST00000366728	CUX1	P39880	1505 aa		43.47	■■■■■ 4.55
GUK1-208	ENST00000366728	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	43.44	■■■■■ 4.54
GUK1-208	ENST00000366728	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		43.37	■■■■■ 4.53
GUK1-208	ENST00000366728	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		43.37	■■■■■ 4.53
GUK1-208	ENST00000366728	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		43.37	■■■■■ 4.53
GUK1-208	ENST00000366728	FBLN2	P98095	1184 aa		43.36	■■■■■ 4.53
GUK1-208	ENST00000366728	CHD1	O14646	1710 aa		43.32	■■■■■ 4.53
GUK1-208	ENST00000366728	ARHGEF11	O15085	1522 aa		43.3	■■■■■ 4.52
GUK1-208	ENST00000366728	WDR97	A6NE52	1622 aa		43.23	■■■■■ 4.51
GUK1-208	ENST00000366728	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		43.2	■■■■■ 4.51
GUK1-208	ENST00000366728	GRIN2B	Q13224	1484 aa		43.12	■■■■■ 4.49
GUK1-208	ENST00000366728	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	43.07	■■■■■ 4.49
GUK1-208	ENST00000366728	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	43.07	■■■■■ 4.49
GUK1-208	ENST00000366728	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		43.04	■■■■■ 4.48
GUK1-208	ENST00000366728	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		43	■■■■■ 4.47
GUK1-208	ENST00000366728	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		42.98	■■■■■ 4.47
GUK1-208	ENST00000366728	SYNJ2	O15056	1496 aa		42.94	■■■■■ 4.47
GUK1-208	ENST00000366728	ARAP1	Q96P48	1450 aa		42.91	■■■■■ 4.46
GUK1-208	ENST00000366728	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	42.88	■■■■■ 4.46
GUK1-208	ENST00000366728	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		42.88	■■■■■ 4.46
GUK1-208	ENST00000366728	SYNJ1	O43426	1573 aa		42.87	■■■■■ 4.45
GUK1-208	ENST00000366728	PBRM1	Q86U86	1689 aa		42.87	■■■■■ 4.45
GUK1-208	ENST00000366728	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		42.86	■■■■■ 4.45
GUK1-208	ENST00000366728	TOP2B	Q02880	1626 aa		42.79	■■■■■ 4.44
GUK1-208	ENST00000366728	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		42.77	■■■■■ 4.44
GUK1-208	ENST00000366728	GRIN2A	Q12879	1464 aa		42.56	■■■■■ 4.4
GUK1-208	ENST00000366728	ADAMTS12	P58397	1594 aa		42.53	■■■■■ 4.4
GUK1-208	ENST00000366728	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	42.48	■■■■■ 4.39
GUK1-208	ENST00000366728	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		42.46	■■■■■ 4.39
GUK1-208	ENST00000366728	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		42.43	■■■■■ 4.38
GUK1-208	ENST00000366728	NUP160	Q12769	1436 aa		42.42	■■■■■ 4.38
GUK1-208	ENST00000366728	CEP170	Q5SW79	1584 aa		42.38	■■■■■ 4.37
GUK1-208	ENST00000366728	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		42.26	■■■■■ 4.36
GUK1-208	ENST00000366728	SHROOM2	Q13796	1616 aa		42.13	■■■■■ 4.34
GUK1-208	ENST00000366728	KIF27	Q86VH2	1401 aa		42.03	■■■■■ 4.32
GUK1-208	ENST00000366728	JPH4	Q96JJ6	628 aa		42.02	■■■■■ 4.32
GUK1-208	ENST00000366728	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	42.01	■■■■■ 4.32
GUK1-208	ENST00000366728	IGF1R	P08069	1367 aa		42.01	■■■■■ 4.31

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms