Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KLHL20Q9Y2M5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
KLHL20Q9Y2M5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KLHL20Q9Y2M5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
KLHL20Q9Y2M5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
KLHL20Q9Y2M5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
KLHL20Q9Y2M5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
KLHL20Q9Y2M5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
KLHL20Q9Y2M5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
KLHL20Q9Y2M5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
KLHL20Q9Y2M5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
KLHL20Q9Y2M5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
KLHL20Q9Y2M5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
KLHL20Q9Y2M5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KLHL20Q9Y2M5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KLHL20Q9Y2M5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
KLHL20Q9Y2M5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
KLHL20Q9Y2M5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
KLHL20Q9Y2M5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
KLHL20Q9Y2M5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
KLHL20Q9Y2M5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
KLHL20Q9Y2M5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
KLHL20Q9Y2M5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
KLHL20Q9Y2M5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KLHL20Q9Y2M5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KLHL20Q9Y2M5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KLHL20Q9Y2M5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KLHL20Q9Y2M5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KLHL20Q9Y2M5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KLHL20Q9Y2M5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KLHL20Q9Y2M5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KLHL20Q9Y2M5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KLHL20Q9Y2M5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KLHL20Q9Y2M5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KLHL20Q9Y2M5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KLHL20Q9Y2M5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KLHL20Q9Y2M5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KLHL20Q9Y2M5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KLHL20Q9Y2M5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KLHL20Q9Y2M5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KLHL20Q9Y2M5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KLHL20Q9Y2M5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KLHL20Q9Y2M5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KLHL20Q9Y2M5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KLHL20Q9Y2M5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KLHL20Q9Y2M5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KLHL20Q9Y2M5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KLHL20Q9Y2M5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KLHL20Q9Y2M5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KLHL20Q9Y2M5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
KLHL20Q9Y2M5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KLHL20Q9Y2M5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KLHL20Q9Y2M5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KLHL20Q9Y2M5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KLHL20Q9Y2M5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KLHL20Q9Y2M5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KLHL20Q9Y2M5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KLHL20Q9Y2M5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KLHL20Q9Y2M5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
KLHL20Q9Y2M5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KLHL20Q9Y2M5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KLHL20Q9Y2M5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KLHL20Q9Y2M5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KLHL20Q9Y2M5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
KLHL20Q9Y2M5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KLHL20Q9Y2M5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
KLHL20Q9Y2M5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KLHL20Q9Y2M5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KLHL20Q9Y2M5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KLHL20Q9Y2M5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KLHL20Q9Y2M5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KLHL20Q9Y2M5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KLHL20Q9Y2M5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KLHL20Q9Y2M5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KLHL20Q9Y2M5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KLHL20Q9Y2M5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KLHL20Q9Y2M5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KLHL20Q9Y2M5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KLHL20Q9Y2M5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KLHL20Q9Y2M5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHL20Q9Y2M5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHL20Q9Y2M5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KLHL20Q9Y2M5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KLHL20Q9Y2M5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KLHL20Q9Y2M5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KLHL20Q9Y2M5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KLHL20Q9Y2M5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KLHL20Q9Y2M5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KLHL20Q9Y2M5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KLHL20Q9Y2M5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KLHL20Q9Y2M5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KLHL20Q9Y2M5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KLHL20Q9Y2M5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KLHL20Q9Y2M5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KLHL20Q9Y2M5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KLHL20Q9Y2M5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KLHL20Q9Y2M5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KLHL20Q9Y2M5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KLHL20Q9Y2M5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KLHL20Q9Y2M5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms